前言
截止2018年10月，朱健康研究组总共发表了22篇文章，其中通讯文章达到了16篇。下面我们系统总结以朱健康院士为通讯作者的文章。由于我们公众号是在4月开始运营，故4月之后的所有的文章都在我们公众号有链接，直接点击题目就可以进入链接查看详细解读！这也是我们着手开始总结2018年国内各实验室的科研成果的第一个实验室，陆续有更多的优秀实验室的年度总结，敬请期待！（以下文章的排序按发表时间顺序）
朱健康
1. 朱健康课题组和南农杨东雷课题组合作揭示了在DNA甲基化与去甲基化的双料间谍!（点击查看）
2018年10月16日，Cell Discovery杂志在线发表了来自中科院逆境中心朱健康课题组和南京农业大学杨东雷课题组共同通讯题为“Four putative SWI2/SNF2 chromatin remodelers have dual roles in regulating DNA methylation in Arabidopsis”的研究论文。该研究揭示了拟南芥中的染色质重塑因子CLSY4及其家族的另外三个CLSY蛋白等四个染色质重塑因子在DNA甲基化和DNA去甲基化中具有双向功能，说明了CLSY家族蛋白是调控DNA甲基化动态平衡的重要分子机制。
2.Genome Biology | 朱健康研究组在提高基因编辑效率上取得新进展（点击查看）
2018年9月28日，朱健康研究组在Genome Biology在线发表题为“Manipulating plant RNA-silencing pathways to improve the gene editing efficiency of CRISPR/Cas9 systems”的研究论文，该论文评估了先前表征的CRISPR / Cas9系统在参与RNA沉默途径的不同步骤的一组拟南芥突变体中的基因编辑活性。最后该文章表明通过减少植物中的RNA沉默可以提高CRISPR / Cas9基因编辑效率。
3.【PNAS】植物逆境中心黄朝锋和朱健康研究组合作揭示了DNA去甲基化在种子休眠的新机制！（点击查看）
2018年9月28日，国际学术期刊《PNAS》在线发表了中科院分子植物卓越中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为“DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting of DOGL4 and seed dormancy in Arabidopsis thaliana”的研究论文。该研究发现了拟南芥DNA去甲基化酶ROS1负调控DOGL4基因的印记和种子休眠的新机制。
4.德国研究组联合朱健康课题组揭示了藜麦抗盐的分子机制！（点击查看）
2018年9月20日，Current Biology杂志在线发表了来自德国维尔茨堡大学Rainer Hedrich课题组和中科院植物逆境中心朱健康课题组合作通讯发表题为“Understanding the Molecular Basis of Salt Sequestration in Epidermal Bladder Cells of Chenopodium quinoa”的研究论文。该论文发现了藜麦的epidermal bladder cells 中的HKT1型通道介导单向钠离子进入，而ClC转运蛋白将氯离子导入到EBCs细胞的液泡中。同时，EBCs细胞质通过将钾和脯氨酸的进入达到渗透平衡。而且该研究在转录水平上，证明了藜麦的EBCs细胞对于盐储存活动具有“组成型活性”。
2018年7月26日，Plant Biotechnology Journal杂志在线发表了来自中国科学院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组题为“Expanding the base editing scope in rice by using Cas9 variants”的研究论文。该研究通过利用SpCas9和SaCas9的变体开发了新的腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器，其大大扩展了水稻基因组中的可靶向位点。 此外，该研究还表明腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器可以在水稻中同时进行。 故该研究报道的新碱基编辑器将在研究水稻功能基因组学中发挥作用，并将推进作物的精确分子育种。
6.《Molecular Plant》朱健康课题组发现ABA代谢调控的新机制（点击查看）
2018年7月4日，《Molecular Plant》在线发表了植物逆境中心朱健康研究组题为“The Flowering Repressor SVP Confers Drought Resistance in Arabidopsis by Regulating Abscisic Acid Catabolism”的研究论文，揭示了开花抑制子SVP (SHORT VEGETATIVE PHASE)通过调控ABA代谢提高拟南芥抗旱性的分子机制。
7.【Cell Reports】朱健康和赵杨课题组构建了PYL家族十四突变体并揭示了PYL在渗透胁迫的新机制！（点击查看）
2018年6月12日，Cell Reports杂志在线发表了来自中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康和赵杨课题组题为“Arabidopsis Duodecuple Mutant of PYL ABA Receptors Reveals PYL Repression of ABA-Independent SnRK2 Activity”的研究论文。该论文通过CRISPR/Cas9技术敲除了包含14个PYLs家族所有成员，验证了之前ABA信号通路，并揭示了PYLs在植物渗透胁迫响应中通过抑制SnRK激酶活性起重要作用。该文通过现在CRISPR/Cas9技术构建PYLs全突变体，排除它们之间的功能冗余性，验证了之前认为ABA通过结合受体PYL后激活下SnRK2.2/3/6参与植物的生长发育调控，同时又揭示了在之前文章显示渗透胁迫分别有依赖于ABA信号通路和不依赖ABA信号通路的分子机制，即在不依赖ABA信号通路中，PYLs能直接抑制SnRK2的激酶活性。但是其中具体的机制仍然有待解决，如PYLs如何抑制SnRK2的激酶活性。
8.PNAS| 朱健康课题组最新研究使水稻产量提高了31%！！！（点击查看）
2018年5月21日，PNAS杂志在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组发表题为“Mutations in a subfamily of abscisic acid receptor genes promote rice growth and productivity”的研究论文，该研究通过同时突变ABA受体基因PYL1、PYL4和PYL6后，水稻的生物量明显增加，谷产量增加了31%。该研究揭示了这些ABA受体在调控水稻生长发育过程中的重要作用，更为重要的是为提高水稻产量提供了新的遗传策略。
9.朱健康团队在国际顶级综述杂志发表文章，阐述DNA甲基化过程 （点击查看）
2018年5月21日，Nature Reviews Molecular Cell Biology在线发表了中国科学院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究员、张惠明研究员与郎曌博研究员共同完成的题为“Dynamics and function of DNA methylation in plants”的综述文章。 在本综述中，朱健康等人讨论了植物中的DNA甲基化，包括甲基化和去甲基化酶和调控因子，以及通过所谓的甲基化状态机制协调甲基化和去甲基化活性; DNA甲基化在调控转座子沉默，基因表达和染色体相互作用中的功能; DNA甲基化在植物发育中的作用; 以及DNA甲基化参与植物对生物和非生物胁迫条件的反应.
10.【一作解读】朱健康课题组在植物中实现超长基因片段高效精准无赘敲入/替换编辑！！（点击查看）
2018年5月17日，国际学术期刊Nature Communications在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为“CRISPR/Cas9-mediated gene targeting in Arabidopsis using sequential transformation”的研究论文。该研究报道了一种在拟南芥中基于二次转化策略与CRISPR/Cas9系统的超长基因片段高效精准敲入/替换技术。它可以在拟南芥基因组精准定向地实现单氨基酸或大片段的插入或替换，且编辑位点无需任何标记辅助筛选，效率高达5-10%。此研究大大推进了CRISPR系统在植物中的应用，为植物基因定点编辑提供了一个新方法。
11.朱健康研究组开发了简化的CRISPR-Cpf1和CRISPR-Cas9系统在水稻中进行多重基因编辑（点击查看）
2018年5月15日，JIPB杂志在线发表了朱健康研究组题为“multiplex gene editing in rice with simplified CRISPR-Cpf1 and CRISPR-Cas9 systems”的研究论文，该论文通过利用FnCpf1，LbCpf1或Cas9开发了简化的单转录单位（SSTU）CRISPR系统，用于在水稻中进行多重基因编辑，其中核酸酶及其crRNA阵列由单个Pol II启动子共同表达，无需任何额外的加工机器。 朱健康研究组的SSTU系统易于构建并有效介导多重基因组编辑。
12.朱健康、高彩霞、周焕斌和Jin-Soo Kim等课题组共同报道了腺嘌呤碱基编辑技术在植物中的应用!（点击查看）
自从David R Liu课题组在2017年11月23日Nature杂志上发表了“Programmable base editing of A·T to G·C in genomic DNA without DNA cleavage” 的研究论文，首次报道通过dCas9融合改造过的腺嘌呤碱基脱氨酶（ABEs）后将动物细胞基因组DNA中的A·T向G·C转化。至此，现有五篇文章报道了该技术同样在各植物中同样能起作用（都是来自植物编辑领域的大牛实验室）：2018年4月2日，Molecular Plant杂志背靠背发表了来自中国科学院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组题和中国农业科学院植物保护研究所周焕斌课题组题为'Precise A-T to G-C Base Editing in the Rice Genome’和“Highly Efficient A·T to G·C Base Editing by Cas9n-Guided tRNA Adenosine Deaminase in Rice；2018年5月29日，Genome Biology杂志在线发表了来自中国科学院遗传与发育研究所高彩霞课题组题为“Expanded base editing in rice and wheat using a Cas9-adenosine deaminase fusion”的研究论文；2018年6月4日，Nature Plants杂志在线发表了来自韩国基础研究所Jin-Soo Kim课题组题为“Precision genome engineering through adenine base editing in plants”的研究论文。
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