5月，卫生部公布《抗菌药物临床应用管理办法》，并要求自2012年8月1日起施行。具体内容包括：① 建立抗菌药物临床应用分级管理制度；② 明确医疗机构抗菌药物遴选、采购、临床使用、监测和预警、干预与退出全流程工作机制；③ 加大对不合理用药现象的干预力度，建立细菌耐药预警机制；④ 明确监督管理和法律责任。
恶性袭医事件一再发生
3月23日，哈尔滨医科大学附属第一医院发生恶性袭医事件，造成1死3伤。11月13日，一男子持刀闯入安徽医科大学第二附属医院，砍伤正在工作的5名医护人员，其中1人因伤势严重经抢救无效死亡。11月29日，天津中医药大学第一附属医院一医生被人用斧头砍伤致死。一系列事件引起社会和医务界的担忧和思考。
首个戊型肝炎疫苗研制成功
10月，福建省厦门大学的研究人员宣布，全球首批戊型肝炎病毒疫苗正式上市。研究人员通过遗传修饰一种大肠杆菌菌株生成了一种蛋白质，将其注入人体，可刺激机体免疫系统对抗戊型肝炎。该疫苗于2011年12月获得国家食品药品监督管理局（SFDA）颁发的国家一类新药证书。
3年医改取得重大进展
1月5日，2012年全国卫生工作会议在北京召开。
在此次会议上，卫生部部长陈竺指出，在党中央、国务院的正确领导下，各级党委政府及其相关部门精心组织、密切配合，广大医药卫生人员充分发挥主力军作用，3年医改取得了重大的进展，主要表现在以下4个方面：① 人民群众通过医改得到更多实惠；② 中国特色基本医疗卫生制度框架初步建立；③ 卫生事业正在发生结构性变化；④ 卫生总费用发生重大结构性变化。与此同时，公立医院改革试点工作也将全面铺开。
耐药结核病流行态势严峻
中国疾病预防控制中心（CDC）结核病预防控制中心赵雁林等对我国10个省开展的调查结果提示，中国有严重的耐药结核病流行。耐多药（MDR）结核病与公共卫生系统以及医院系统的不恰当治疗相关。文章6月7日发表于《新英格兰医学杂志》（N Engl J Med）。
我国慢性病患者已达2.6亿
目前，我国慢性病确诊患者已达2.6亿，相关死亡人数占总死亡人数的85%，疾病负担已占总疾病负担的70%。5月21日，卫生部等15个部门联合发布《中国慢性病防治工作规划（2012－2015）》提出，“十二五”时期是我国加强慢性病防治关键时期，要采取有力有效措施，尽快遏制慢性病的高发态势。
全科医生培养标准颁布
7月25日，卫生部、教育部联合印发《全科医生规范化培养标准（试行）》，其中明确了“5年临床医学本科教育＋3年全科医生规范化培养”模式下全科医生规范化培养的方式、时间、内容及各项具体要求。
全国人大三审 通过《精神卫生法草案》
10月23日，十一届全国人大常委会第29次会议对《精神卫生法草案》进行了三审并最终通过。《草案》规定综合性医疗机构应设精神科门诊，患者住院治疗实行自愿原则，精神障碍患者财产安全不受侵犯。
《中国吸烟危害健康报告》发布
5月31日（世界无烟日），卫生部发布了《中国吸烟危害健康报告》。这是我国首部系统阐述吸烟对健康危害的权威性报告。报告涉及了控烟领域以及呼吸、肿瘤、心血管等临床医学及预防医学、医学信息等多个相关学科。
中国学者 推翻晚期鼻咽癌治疗标准方案
中山大学肿瘤防治中心马骏教授等开展的一项临床研究结果显示，已应用10多年的晚期鼻咽癌标准治疗方案未能使患者获益。这是全球首个评价鼻咽癌同期放化疗后辅助化疗价值的临床研究。文章发表于《柳叶刀·肿瘤学》[Lancet Oncol 2012, 109(4): 1127]杂志。
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