传统的看法认为，金字塔是作为法老们的坟墓而修建的，但是有证据不太支持这个观点。
第一个金字塔（祖塞尔的金字塔）里面有两个屋子（学者们坚持认为是用于埋葬的屋子），由巨大的墓石板盖着。在1821年，当H·M·冯·孟纳托利（H. M. von Minutoli）首先进入里面后，他称他在屋子里面发现了木乃伊的一部分和一些刻有祖塞尔名字的碑文。据称他准备把它们送到欧洲，但是在海上给弄丢了。在1837年，理查德·霍华德·维斯（Richard Howard Vyse）上校又进入大金字塔内部进行更彻底的发掘，他报告说发现了“一堆木乃伊”（一共80个），并进入了一个“刻有祖塞尔名字的屋子”。一个世纪以后，考古学家们报告说发现了一个头骨的一部分和一些证据，这些证据证明了“在红色的花岗石屋子里面有一个木棺”。在1933年，J·E·奎贝尔（J. E. Quibell）和J·P·劳尔（J. P. Lauer）在金字塔下面发现了其他长廊，在长廊里面他们发现了两个石棺，但是也是空的。
现在大家都普遍接受这样一个说法，那就是所有这些木乃伊和棺材都是后补的，即死者是后来才被放进那些封闭的长廊和屋子里面的。
但是祖塞尔他自己是不是被埋在了金字塔里面呢──有没有“原始的埋葬”呢？
大多数考古学家都怀疑祖塞尔埋葬在他的金字塔里面。在1928年，在他的金字塔南边发现了一个墓穴；似乎他是被埋葬在这个“南部坟墓”里面。考古学家是通过一块仿海枣树的石板进入这个坟墓的地下走廊的，这个走廊直接通向一扇半开的门，穿过门就到达了一个巨大的围场。还有更多的走廊通向一个地下屋子，屋子是由花岗岩建造的；屋子四个墙面上有三个假门，其中一面墙上刻着祖塞尔的名字、画像和称号。
现在，许多卓越的埃及学家们都相信，那个金字塔只是祖塞尔的一个象征性的埋葬地，他真正的埋葬地是在“南部墓穴”，墓穴上是一个巨大的长方形超级建筑；下面是一个凹陷的屋子，屋子里面有一个祈祷间──就像一些埃及图画所描述的一样。
据推测，阶梯金字塔是从祖塞尔的继承者塞汉赫特开始修建的，阶梯金字塔里面也有一个“埋葬屋”。屋子里面是一个细纹大理石“石棺”，也是空的。课本告诉我们，发现屋子和石头柜子的考古学家扎卡瑞亚·高内姆（Zakaria Goneim）说，有盗墓者来过这个屋子了并盗走了木乃伊和墓穴的其他东西。但是这并不全然准确。事实上，高内姆发现的柜子上，两扇滑动门是关着的并且是用熟石灰密封了的；而且早已干枯的花圈的残迹仍然留在了棺材上面。他后来回忆说：“……充满了期待；但是当石棺打开时，里面去却是空的，没有用过。”
是不是有国王曾被埋在那里？有些人很肯定，但是其他人认为塞汉赫特（罐子的塞子上刻着他的名字）金字塔只是一个纪念碑或者纪念性建筑而已，即，一个空的象征性墓穴。
第三个阶梯金字塔，也就是哈巴的金字塔，也有一个“埋葬室”；但里面是什么都没有：没有木乃伊，甚至连石棺都没有。考古学家还在附近发现了另外一座未完成的金字塔，他们认为是哈巴的继承者建的。金字塔地下有一个非同寻常的椭圆形“石棺”，石棺嵌在了石头地板里面；石棺的门还是紧紧地关着的，里面什么也没有。
后来又发现了第三王朝的三个小型金字塔。其中一个还没有被人闯入过。另外一个中没有埋葬室。第三个，有埋葬室，但是没有埋葬过人的迹象。
在垮塌了的米达姆金字塔中的“埋葬室”里，同样什么都没有发现，甚至也没有石棺。弗林德斯·皮特里（Flinders Petrie）在他所称的盛装塞奈弗鲁的木乃伊的棺木，实际上只是一些木棺的残迹，而且，现在学者们一致认为那些残迹属于后来才放进去的棺木。
在米达姆金字塔周围，有许多第三和第四王朝的平顶斜坡坟墓，里面埋葬着那些时代的皇室成员和其他重要人物。金字塔围场是和一种相对低矮的建筑结构相联系的（也叫葬礼庙），现在这些建筑都已经被尼罗河水淹没了。也许法老的尸体就在那里躺着，被神圣的尼罗河水保护着。
就金字塔和坟墓的关系来说，下面两个金字塔更让人尴尬。位于达舒的两个金字塔（曲折金字塔和红色金字塔）都是由塞奈弗鲁建的。第一个有两个“埋葬室”，而另外一个有三个。都是塞奈弗鲁？如果说每个金字塔都是法老修建来作为自己坟墓的，那么为什么塞奈弗鲁有两个？更不用说在对它们进行发掘的时候发现里面也是空无一物，甚至没有石棺。1947年和1953年，埃及文物机构对这两座金字塔进行了彻底的挖掘工作（特别是红色金字塔），结果报告承认了“在那里没有发现皇室坟墓的迹象。”
“每个法老建一个金字塔”这个理论现在轮又到塞奈弗鲁的儿子胡夫了；而且连希罗多德也保证说吉萨的大金字塔就是胡夫建的。它里面没有被动过的“国王之屋”也是空的。这并不奇怪，因为希罗多德（《历史》第二卷Ⅱ，127页）写道：“据说，尼罗河的河水经过一条人工渠的引导围绕着一个岛屿流过，那里就是国王胡夫尸体所躺的地方。”那么法老真正的墓穴是不是在尼罗河谷靠近尼罗河的什么地方呢？到现在为止，没人知道。
吉萨第二个金字塔的归属者海夫拉并不是胡夫的直接继承者。在两者之间还有一个统治了8年的法老拉迪耶迪夫（Radedef）。他选了离吉萨有些远的地点作为金字塔的修建地，关于其中原因学者们也搞不清楚。他修建的那个金字塔大概有大金字塔的一半大，里面也有风俗性的“埋葬室”。但是当探索者进入里面时候也发现屋子里什么也没有。
吉萨第二个金字塔在北面有两个入口，这与传统的一个入口就不一样了。第一个入口位于金字塔外面（又是一个不寻常的特征），入口通往一个未完成的屋子。另外一个通往一间与金字塔顶部对齐的屋子。在1818年，乔万尼·伯尔佐尼（Giovanni Belzoni）进入其中的时候，他发现花岗石的石棺是空的并且棺盖被打坏了，散在地上。一篇阿拉伯文的碑文中记录了几个世纪之前曾有人进入过那个金字塔。但是阿拉伯人发现了什么，却没有记录。
吉萨的第三个金字塔要比前两个小很多，但是这座金字塔却展现了独特的特征。这座金字塔的主体工程使用的石块是三座金字塔中最大的；它底下的16层都是由很难加工的花岗石砌成的，而不是白色的石灰岩。
开始的时候，它是一个很小的真正的金字塔；但是在后来又将其体积加大了一倍。所以，就有了两个入口。在1837年，霍华德·维斯和约翰·皮尔林（John Perring）进入了它的主“埋葬室”。他们在里面发现了一个极其漂亮的、由玄武岩做成的石棺；和其他一样，也是空的。但是他们在附近发现了一片木棺的碎片和一个木乃伊的残迹，碎片上面写着皇室的名字“Men-Ka-Ra”（门卡拉），“很可能就是门卡乌拉（Menkaura）”──希罗多德直接确认道。K·米卡洛斯基（K.Michalowsky）在《古埃及的艺术》（Art of Ancient Egypt）一书中披露，后来利用现代的根据碳测定年代的技术，确认了那个木棺“肯定属于闪米特时期”──并不是在公元前660年。木乃伊的残迹大约是在基督的早期时代，并不是“原装货”。
对于门卡乌拉是不是胡夫的直接继承者还存在一定的不确定性。但是学者们很肯定地相信，门卡乌拉的继承者是一个叫斯普塞卡夫（Shepsekaf）的国王。那些众多未完成的金字塔中，究竟哪个是属于他的，目前还不清楚（或许他的金字塔由于太粗糙，没有经得起时间的考验，因而什么都没留下也未可知）。但是很肯定的是，他没有被埋葬在里面：他被埋葬在了一个斜坡平顶坟墓中（见图138），埋葬他的屋子中有一个黑色的花岗石石棺。古代的盗墓者们已经在这里光顾过了，他们盗走了坟墓和石棺里面的所有东西。
第五王朝的第一任法老是乌塞尔卡夫（Userkaf）。他将他的金字塔建在了塞加拉，即靠近祖塞尔金字塔建筑群的地方。金字塔受到了后来的埋葬行为的破坏，也受到了盗墓者的破坏。他的继承者萨胡拉（Sahure）在塞加拉北部修了一座金字塔。虽然这座金字塔保持最为完好（见图139），但是在它的矩形“埋葬室”里也是什么也没发现；但是在它和尼罗河河谷之间的一处壮丽的神庙（一个低处的神庙装饰着高大的石柱，而石柱模仿了海枣树的造型），表明了萨胡拉真正的墓穴就在附近的什么地方。
尼夫尼尔卡尔（Neferirkara）是继萨胡拉之后的一个法老，他将他的墓葬建筑群建在了离萨胡拉金字塔的不远处。在这座未完成（或者是遭破坏）的金字塔中的屋子也是空的。他的继承者的建筑还没有找到。与前辈们相比，下一个统治者在建造金字塔的时候用了更多的干泥砖和木头；现在它只剩下一点点金字塔的残迹了。
再下一个统治者是尼夫塞尔（Neuserre），他将他的金字塔建造在了离前辈们很近的地方。他的金字塔里有两个屋子──也没有埋葬过人的迹象。但是尼夫塞尔却因他建造的葬礼神庙而闻名，神庙就像是矗立在金字塔上的方尖形石柱一样，方尖形石柱高达118英尺；顶点外部镀了一层铜。
下一个法老的的金字塔没有找到；也许他的金字塔已经崩溃而化成土堆了，而后又被沙漠给淹没了。他的继承者的金字塔直到1945年才被发现，和其他金字塔一样，下面的屋子里也是空的。
从第五王朝最后一任法老乌纳斯（Unash）开始，金字塔的修建发生了很大的变化。在1880年，加斯顿·马斯佩罗（Gaston Maspero）在乌纳斯的金字塔中第一次发现了《金字塔文本》，这些文本刻在屋子的墙上和走廊的墙上。接下来，第六王朝前4位国王──特提（Teti）、佩皮一世（Pepi Ⅰ）、莫润尔（Mernera）和佩皮二世（Pepi Ⅱ）──的金字塔都模仿了乌纳斯，也都在墙上刻了《金字塔文本》。在他们的“埋葬室”里都找到了玄武岩或者花岗岩的石棺；除了在莫润尔的石棺中发现了一个木乃伊以外，其他三个都是空的。之后考古学家们就很快确认了那不是国王的木乃伊，而是代表后来埋葬进去的木乃伊。
那么第六王朝的国王们被埋葬在哪里了呢？那个王朝的皇室墓穴和早期的皇室墓穴都在南部的阿比多斯（Abydos）。这些和其他证据都排除了金字塔是坟墓的概念。
然而，老观念总是很难消失。但事实说明了这些观点是错的。古老王国的金字塔从来没有装过一个法老的木乃伊，因为它们本来就不是用来盛装国王的尸体的。在国王们去地平线的相似的旅程中，金字塔是建造来作为指向标的，将法老们的灵魂带到天堂的阶梯──就像众神最初建造金字塔也是为了当他们“航行过天空时”，让金字塔起个灯塔的作用。
一代一代的法老们都在模仿着建造金字塔，当然，不是模仿祖塞尔的金字塔，而是模仿众神的金字塔：吉萨的金字塔。
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