典型的椎间盘旁的结核很容易描述并且容易识别与治疗.非典型脊柱结核定义为有脊髓压迫没有明显或触及不到脊柱畸形，没有的椎体病变的X线表现.此种病变相对少见，有些像低度的化脓性
感染，布氏菌与鎌状细胞脊柱炎，棘球蚴病，
淋巴瘤和恶性沉着并且在早期有更多的神经并发症故诊断治疗困难。非典型病变可能表现为椎管内结核样肉芽肿，波及神经弓，压迫单椎体病变的脊髓，手风琴样椎体塌陷或椎体间桥接样硬化。
硬膜外、硬膜内或髓内间隙的肉芽样病变压迫脊髓出现肿瘤样病变，而无明显的放射学表现.硬膜外病变或能没有骨质破坏或仅有微小的椎体病变但放射学检查查出，MRI可以明确病变。为了获得组织病理学诊断及脊髓减压可以进行手术治疗。对于硬膜外骨外肉芽肿可以行椎板切除术，但是如果椎体有病变，需行前路或前外侧减压。通常硬膜外肉芽肿术后神经功能恢复好。在硬膜紧张处打开硬膜。此类病人恢复也好。髓内肉芽肿表现为无痛，有结核病史、压迫脊髓。不同的诊断包括脊髓硬肿瘤，囊虫病。MRI增强鉴别诊断一种选择。如果MRI怀疑髓内结核瘤可以行抗结核药物治疗并观察近期的神经功能状态.如果
神经症状恶化可行髓内减压及脊髓切开以减压脊髓并明确诊断。结核性肉芽肿 与脊柱肿瘤症状的鉴别诊断是脊柱结核好发于结核高发病区.脊柱结核中约2%-10%的病例仅表现为单纯的后部结构病变伴较高的截瘫发病率.并可能影响到棘突、椎板、椎弓根，骨性关节及横突，以波及椎弓根最为常见。X平片不能发现此类病变，但在椎弓根阴影缺失的情况下前后位X片可以发现椎弓根病变80.CT与MRI可以清楚的发现此类病变。细针穿刺抽吸细胞学检查对于诊断是有帮助的。只要诊断明确即使没有神经缺陷症状也需用化疗，椎板切除术的适应征是有神经功能病变的体征时行椎板切除。
结核感染始于椎体中央，是因为椎体中央有肉芽组织长入并且椎体成向心性塌陷81.X平片可以显示出椎体塌陷而相邻椎间盘间隙保留。MRI常用来鉴别结核与其它病变并且可以显示出相邻椎体的炎性改变。CT引导下穿刺活检是组织学诊断的指征。
