整体观念和辨证论治是中医学的基本特点，不仅仅中医有整体观念，西医也有，不同的是西医的整体观念是微观的，比如西医也讲呼吸系统、消化系统，还有复杂的神经系统等，而中医的整体观念是宏观的，小到人体五脏六腑是一个整体，大到人与自然界也是一个整体。
更确切地说辨证论治才是中医最具特色的特点，辨证就是分析疾病的病因病机，也就是在分析疾病是如何产生的，致病因素是什么，通过望闻问切四诊收集到的信息来判断，这个过程有点像法官判案。论治就是通过辨证的结论来确定相应的治疗法则或方法。如果辨证错误，后面确立的治法也会错误，处方也会错误，自然也就不会有效果或者出现副作用。可见，辨证这个环节是非常关键的。
怎样才能准确辨证呢？辨证的方法教科书上有很多种，如八纲辨证、脏腑辨证、气血津液辨证、经络辨证、病因辨证、六经辨证、方证辨证、卫气营血辨证、三焦辨证等，每一种辨证方法都有其适应性，同时也有其局限性，这有点像中学时学的数学和物理公式一样，有其适用范围，并不是普遍的真理，只是一般的规律性。其中脏腑辨证是中医界的主流，个人比较推崇六经辨证。
肖相如教授说：辨证论治就是一句空话。此语似乎挑战了权威，但仔细分析他的观点，也并非完全没有道理。他认为《伤寒论》已经给我们树立了标准，他强调特异性方证，有是证，用是方，方与证相应，用之皆验。《伤寒论》中有：某某方主之，可与，宜，等描述，主之的相应程度最高，效果也最好，宜的相应程度其次，可与相应程度更其次。但可惜的是这样的方证不多，符合相应方证的病证可以直接拿来用不需要辨证施治环节，没有符合方证的才需要辨证论治，然后根据辨证的结论开出处方。
辨证是通过什么来完成的呢？症状和体征。每一个症状和体征又不具有特异性，一个症状可能在多个病机中出现，现代人身上往往会同时出现很多疾病，症状也繁多，辨证的目的就是要得出一个或多个病机，这也就成了辨证的难点。病机是由一串有关联性的症状和体征构成的，怎样从纷繁复杂的症状中找出关键点成了摆在每一个中医面前最核心的问题，当然病机也有主次之分，抓住主要矛盾也就抓住了核心病机，根据情况兼而治疗其次要矛盾。有的放矢，疗效才会好。
综上所述，辨证论治的目的就是辨病机，也就是中医所说的证，而辨证是通过分析患者身上出现的症状和体征实现的，找到那串关联性的一组或多组症状，也就找到了打开了疾病的钥匙。
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