说到明朝刚开始的时候朱元璋成为了开国皇帝，不过当时朱元璋在北京的开封，可是京都是在南京。不过他理想中的京师是开封，所以暂且将开封府称北京。所以当时明朝的时候是有两个京都的！这样一来，是如何治理的呢？下面就和小编一起来看看吧！
1、明朝两京指的是什么
看过明朝题材的历史电视剧，大家都会发现里面经常提到一个名词叫做两京一十三省。所谓的两京一十三省，是指对当时明朝来说，全国的政治区域划分，而其中的两京，指的自然就是北京（开封）和南京。在明朝的时候，特别是朱元璋时期，明朝的北京其实并不是我们现在的北京，而是河南的开封。
变故发生在后来的“靖难之役”，叔叔朱棣夺取了侄儿朱允文同志的江山社稷，自己做的皇帝，他就把都城迁移到了现在的北京，可能是为了加强对于北方地区的管理，因为中国的疆域实在是太过于广大了，把都城向北边迁移对于有效加强北方（边疆）地区的管理是很有作用的，而且朱棣做王爷的时候，它的主要管辖区域是就是在北方的北京。不过当时的北京还叫
“北平”，这是因为朱元璋灭掉元朝后，为了记载平定北方的功绩，所以将元大都改称北平。永乐皇帝朱棣迁都又称明成祖迁都北京，在中国历史上具有重大意义。朱棣迁都对中国政治、经济、文化造成的影响一直延续到现代。朱棣迁都北京有利于控制全国的政局，同时有利于抗击北方残元势力的南侵，也有利于经营东北地区。
而南京是孝陵所在地如果南京的政治地位有所下降的话，对于明朝的统治是十分不利的，因此，南京也就作为两京中的一京，是在明朝的政治管辖中十分独特的一个。可以这么说，在明朝（永乐之后）北京是全国的政治中心，而南京则是全国的经济中心，两个地方都具有十分重要的特性。
南京是朱元璋陵墓孝陵的所在地，所以对于明朝来说，提升南京的政治地位，无论是在政治还是在经济等各方面，都具有十分重要的意义，这也是南京能够跟北京相提并论的一个重要原因。而北京自然不用说是朱棣定都的地方，作为全国的政治统治中心，其地位自然遥遥领先，其他的省份，特别是对于朱棣刚刚统治的初期，稳固他的统治地位就显得具有十分重要的意义。
2、明朝两京制是如何分工运作的
明代的两京制与以往有所不同，它在留都南京有一套完整的行政机构。两京制下并设官制，同属朝廷行政系统，两京主要机构设置基本相同，略为复杂。
两京都设有六部、督察院、大理寺、通政司、宗人府、翰林院、国子监等机构，除此之外，南京还设南京守备，它与协同守备、守备太监构成权力核心。
这三个守备统辖南都一切留守、防卫之事，其中守备太监权力极大，虽然是三者互不统属，但守备太监是代表皇帝意志。另外，南京还有一个参赞机务。
南京机构名义上是朝廷官员系统，却无实权，基本上受制于北京机构。从职权范围看，留都机构职权仅限于南京及南直隶地区，无权过问其它地区事务。
从政策执行程序看，南京机构的奏章多要经北京一些部分覆议，才能上报皇帝，再由皇帝下诏南京机构负责执行。明代两京制总体呈现出上下隶属关系。
这种隶属关系的形成，避免了政治权利斗争，缓和了内部矛盾，加强了明朝的统治。南京一直充当着经济、文化中心的角色，对社会发展产生不少影响。
随着明朝政治中心的北移，南京并未完全失去政治功能。南京的功能有三点，一是收容京师仕途失意的官员，二是在危急情况下，成为备选都城。三是作为明朝的经济文化中心。
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