人体肠道内寄居着500多种微生物，它们按一定的比例组合，各菌间互相制约互相依存。一旦机体内外环境发生变化，就会导致相关的胃肠道疾病或免疫性疾病。微生态学称之为肠道菌群失调症。菌群失调症的危害很大，它是引发许多慢性病的根源，也是导致亚健康的最终原因。
菌群失调的原因：是指由于某种原因使正常菌群的种类、数量和比例发生大幅度的改变，导致机体微生态失去平衡。比如：滥用抗生素、抗癌、化学因素、饮食因素等。
菌群失调时，容易引起二重感染或重叠感染，即在原发感染的治疗中，发生了另一种新致病菌的感染。菌群失调的发生多见于使用抗生素和慢性消耗性疾病等。临床上长期大量应用广谱抗生素后，大多数敏感菌和正常菌群被抑制或杀灭，但耐药菌则获得生存优势而大量繁殖致病，如耐药金黄色葡萄球菌引起腹泻、败血症，对抗生素不敏感的白假丝酵母菌引起鹅口疮、阴道炎、肠道和肛门感染。
在正常情况下，人体肠道菌群维持平衡，对“外来”致病菌能起有效的防卫作用。但是当长期应用抗生素等药物、疾病发作，饮食不当和水土不服等都容易使体内的有益菌减少，有害菌增多，而引起菌群失调。菌群失调后会导致免疫力下降，出现体弱多病、营养不良、腹泻、便秘等疾病的几率大大增高。这时就需要摄入有益菌的营养源——水苏糖来促进其增殖。
出现菌群失调后，在人体的消化系统反应最为明显。对于女性来说，容易出现内分泌失调症，对儿童来说，容易出现机体抵抗力下降，对老年人来说，他可以导致众多疾病的丛生。
此可见，菌群失调不可小视。所以对年老体弱、慢性消耗性疾病者，使用抗生素或者激素时，严格掌握适应症，最好能作药物敏感试验，选择最敏感的抗生素。对老、细及病后体弱者，在用抗生素的同时并配合使用水苏糖以防肠道菌群失调症的出现。
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