五条大桥
迷宫的十字路口里主要的线索便是义经和弁庆的故事，柯南和服部在京都的不期而遇也是在五条大桥上。
电影中出现的雕塑也是真实存在，讲述的就是年幼的义经，在五条大桥上通过高超的武义收服勇猛过人却心高气傲的牟庆，从此牟庆心甘情愿任凭比自己年轻的义经驱策，成为历史上有名的佳话。
桥面当然已经是现代化的样子了，不过铜制的桥墩上依然可以看到些许历史的遗迹，因为是近代的产物，所以铭文还很清晰。摸着那些铭文，岁月斑驳的痕迹清晰可见，文字的凹凸和铜的味道，好像闭上眼睛就能看见义经和弁庆的初遇，能看见柯南和服部的偶遇。
五条大桥桥下便是京都灵魂之河鸭川，从桥上看过去，鸭川岸两边的建筑，是京都的气息。
清水寺
清水寺是京都三大名胜之一，是平安时代之代表建筑物，后来曾多次遭大火所焚毁，现今所见为1633年德川家光依原来建筑手法重建的。
清水寺坐落在山腰上，而寺内最有名的当属清水舞台，离地五十公尺高却只靠139根木柱支撑结构，足见当年工程的浩大与艰巨。来到清水寺时，一路拾阶而上，除了参拜诸神，凭栏远望，更可将京都市景尽收眼底。宛如古都的风物诗般，清水寺外围的一景一色，完完全全的将京都的风采表露无疑，无论是春天的樱花，夏天的瀑布，秋天的红叶或是冬天的细雪，清水寺都彷佛是为了证明京都而存在的一般，无时无刻吸引着人们流连忘返。在樱花盛开的季节，选择黄昏时分，站在清水舞台，俯瞰京都全城，空气中弥漫着樱花盛开的气息，而远处是群山和晚霞，半山腰上环绕着的似乎是雾气，又似乎是云朵，与樱花相映成趣。在另一个传说中，义经和弁庆最早的相遇是在这里。
若真是在这里，那一定是最美的相遇了。
鞍马寺
动画电影里，服部介绍说鞍马寺一般人都是从仁王门进去，但是他带柯南走西门会近一点。一路都是盘根错节的古树，来到僧上谷不动堂，据说义经在这里遇见天狗学到的剑法。
鞍马寺是由中国本土东渡日本的著名高僧鉴真和尚的高徒鉴祯上人创建于公元770年，其以天狗传说而知名，被奉仰为守护都城鬼门之寺。春天绯红如梦的云珠樱，秋天眺望远近丛林尽染的满山红叶，堪称鞍马寺的绝景。动画中，柯南和服部追凶手的路上，还给了鞍马寺仁王门一个正面的镜头。之后他们闯进鞍马站，也是游客乘坐叡山電鉄上下站的地方，这趟列车会经过一段别称为“红叶隧道”的地段，秋天红叶时的景色非常漂亮。封面图上地标里还有一个贵船神社，是绘马的发源地。相较于岚山的热门，这里游客较少，步行时间也较多，但是对于喜欢清静的人来说，也是不可错过的美景之地。
先斗町与木屋町
动画中，服部和柯南回到山能寺后，和小兰他们一起前往先斗町找毛利大叔。
先斗町是一条非常日式的小路，沿路有许多的木町屋。先斗町与木町是京都夜生活的大本营，越晚越热闹。两条小巷都很窄小，非常日式，尤其是先斗町，巷弄小到车辆无法进入。这里有许多餐厅、居酒屋与俱乐部，都是晚餐时间才开始营业，可说是京都吃宵夜的最佳去处。门户各色的小酒馆子就在鸭川边上，流水潺潺，声声入耳，笙歌交响。
鸭川
柯南他们所在的木屋町能欣赏到鸭川的美景，沿岸都是盛开的樱花，剧场版里有好几个鸭川的场景，白天和晚上都是同样美不胜收。
来到京都，总会经过这条河流，鸽子及各种鸟类盘旋河上，鸭川旁是对京都人最重要的一条休闲大道，人们近可看水面上的飞禽，身边的樱花，远可看清水寺方向的群山。两岸杨柳依依，河水清浅。整条鸭川河上据说有上千座桥，样式统一，岸边情侣成群，也有着情侣河之称。用古朴的大块岩石铺砌成的河岸，浅浅的流水，水上的飞鸟。暮秋岸边的血红枫叶和浅色樱花，鸭川河是京都市内最美丽的一条河流。
伏见稻荷大社
虽然这个地方只出现在了片尾曲中，但这却是个异常著名的京都景点。慕名而来的人太多了，而作为艺伎回忆录中出现过的场景的千本鸟居，更是令人心驰神往的地方。
伏见稻荷大社是遍布日本全国3万余座稻荷神社的总社本宫，也是京都市内最古老的神社之一。这里供奉的是保佑生意兴隆，五谷丰登的神明，每到正月或每月1日赶集的日子，这里就热闹非凡，本殿与鸟居都是红色的，代表万物丰收秋天的色彩。穿过“千本鸟居”，就是稻荷神山的入口，从这里可登上稻荷山顶，山道两旁布满了红色鸟居。
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