为了有效防止蒙古军队的入侵，孟珙向朝廷提出了“藩篱三层”的军事防御措施。
第一层驻扎在夔州，担负起涪南以下的长江江面上的防务工作；第二层是做好鼎州、澧州的保卫工作；第三层是做好辰州、沅州、靖州、柱州的防备工作。
同时，在峡州、松州、滋州等重要军事地域，必须屯兵万人以上并配备一定量的船只。归州屯兵三千人，鼎州、澧州、辰州、沅州、靖州各五千人，郴州、桂州各屯兵一千人。
按照这样的部署分配军队，那长江以西的地盘可以得到防御。
孟珙派遣杨鼎、张谦等人，到达辰州、沅州、靖州，同守卫当地的官员一起，做好当地少数民族的工作，主张采用民族感化的政策，在孟珙的感召下，当地少数民族纷纷出兵出粮，支援南宋军队，抗击蒙古侵略军。
孟珙刚击退进犯的蒙古军队，又探知蒙古军队在襄州、樊州、随州一带，准备从襄樊地区向南入侵，并于邓州积聚造船的木材，以准备渡江南下之用。
孟珙采取先发制人，以攻为守的战略，派遣大将张汉英向随州进攻，任义向信阳进攻，焦进向襄阳等地进攻，分路扰乱其后方。
孟珙又派大将王坚前往邓州，烧毁了蒙古军队准备造船的大量木材，孟珙还侦察到蒙古军队在蔡州屯积军粮，以备南侵之用，就派张德、刘整二将分兵前往蔡州，放火烧掉了蒙古军队积聚的军粮。
孟珙的这些措施，打乱了蒙古军队南下的战略部署，制止了一次蒙古军队南侵的行动。蒙古军队于是不敢偷渡襄阳。
嘉熙四年（公元1240年），著名的抗蒙将领孟珙，升为宁武军节度使，并被任为四川宣抚使、又兼任京湖安抚使，全面负责长江中游及川东防务，抗拒蒙古军队的南侵与东下。
为了提高南宋军队的战斗力，孟珙创建了战斗力特别强的军队。
孟珙招集麻城县、巴河、安乐矶一带的强壮百姓三百五十九人，这些人都是百战之士，人数不多，但战斗力特别强。
这支部队号称宁武军，由孟珙弟弟孟璋统领。
回鹃人爱里八都鲁率领壮士一百多人，男女老少一百十五人，前来投降，孟珙把这部分人编成“飞鹘军”，还是爱里八都鲁领导，并封给爱里八都鲁相当的官职。
四川制置使陈隆之，同副使温大雅不和睦，双方都向朝廷上奏章，互相攻击对方。孟珙写信当面指责他们说：“敌人如此强大，倾全力攻打我们。我们全体将士假如合智合力，还担心打不过他们，而你们之间却互相争斗，难道没有廉颇、蔺相如这种互相礼让的风格吗？”
两人接到孟珙的信后，自觉怀愧，因此改怨为睦，不生龃龉。
四川一带，长期以来形成一种弊政，官吏腐败，严重影响了抗击蒙古军队的士气。孟珙担任四川宣抚使后，对蜀政进行了一些改革。
孟珙对蜀政的弊断进行了总结，归纳为五点：差除计属；赏罚不明；克扣军粮；官吏贪黩；上下欺骗和愚弄。
孟珙制订了改革弊政的政策和方案，颁发到各郡县，建立奖励制度和惩罚制度，约束官吏严格执行。
孟珙又对部下说：“没有选择险要的地势建立防御阵地，那不能责怪军队没有起到保护人民的责任；不把流浪的人民生活安顿下来，让他们种田耕地，那么难怪老百姓没有财产养活军队。”
黎州（今属海南省）太守阎师古说：“云南大理国的国王请求从黎州出发，路过四川向南宋朝廷进贡。”
孟珙担心元朝的间谍侦察四川的军情，于是向朝廷汇报说：“大理国可以从广西、广东一带到达朝廷，不需要路过四川到朝廷。”孟珙拒绝了阎师古的请求。
从此以后，官吏一新，官兵防备非常严密，蒙古间谍不能深入到南宋内陆刺探情报。
南宋军队出现了军粮问题，为了解决部队的军粮问题，做到军队不扰民，孟珙采取了屯田制度。
孟珙自己担任屯田大使兼夔州路制置大使，调集农夫围水筑堰，征集老百姓耕种田地。从秭归延续到汉口，建立了二十个屯，一百七十个屯田庄，造田十八万八千二百八十顷。
创立屯田制度后，南宋军队的粮食问题基本解决了。
广西靖州的徭族同胞作乱，孟珙派遣部下王禹镇压了。
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