灵长类动物“艾达”的化石年代可追溯到4700万年前，于5月20日被揭开神秘面纱。一些科学家表示，这是有关人类进化 的一项重大发现。艾达化石是“国家地理新闻”网站2009年点击率最高的图片。一些专家认为，这一化石的发现只能是一个重大事件，而不是一个具有里程碑意 义的事件。
2.长着透明头的鱼
长着透明头的鱼可能是2009年最为怪异的一项自然发现。在2月公布的照片中，这条生活在太平洋的管眼鱼正在炫耀它的透明脑袋以及管状眼睛。据悉，这是迄今为止发现的第一个活标本。
3.新云型
新发现的云型昵称“雅克?库斯托云”。专家们6月表示，天空中出现的这些“狂暴”的云海是自1951年以来首次观察到的新云型。
4.已“灭绝”鸟类
专家们2月表示，长久以来一直被打上“灭绝”标签的菲律宾鹌鹑仍然健在。不幸的是，在第一次拍照之后，这只罕见的鹌鹑便沦为家禽市场上被出售的对象并最终被吃掉。
5.最古老人类祖先骨骼化石
10月进行的一项骨骼化石研究显示，人类与现代猿之间并不存在类黑猩猩动物这样缺失的一环。最古老人类祖先骨骼化石的发现将改写人类进化史。一名科学家说：“它将改变一切。”
6.淘金热时期“幽灵船”残骸
考古学家11月表示，在最近重见天日的“A.J. 戈达德”号明轮船残骸上，人们发现了当时被匆匆扔到甲板上的靴子以及散落的餐具。这些发现有助于了解这艘淘金热时期“幽灵船”上的船员生命的最后时刻。
7.最长蛇 身长超过巴士
这只生活在6000万年前的爬行动物体重超过一辆汽车。科学家2月表示，最长蛇化石的发现为了解气候变化提供了重要依据。
8.美国三分之一地区面临外来巨蟒入侵威胁
美国三分之一地区面临外来巨蟒入侵威胁(图片提供：Lori Oberhofer, National Park Service )
根据10月公布的一份报告，如果能够在美国野外安家落户并繁衍生息，9条外来巨蟒便可能引发一场生态学灾难。现在，至少已有2条外来巨蟒在佛罗里达州定居。
9.古代镶宝石牙齿
古代镶宝石牙齿这一发现说明为牙齿“美容”绝不是hip-hop 明星的首创。5月进行的一项研究显示，先进的牙科技术允许美洲土著人为他们的牙齿镶嵌宝石。这种为牙齿美容的做法年代最远可追溯到2500年前。
10.超罕见巨口鲨
这是迄今为止发现的第41条巨口鲨。3月，不幸最终降临到这条原本生活在菲律宾海域的鲨鱼头上，等待它的是在椰子汁中温火慢煮并最终被吃掉的厄运。
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