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意外发现!科学家在距今54年的组织样本中发现艾滋病病毒基因组

据消息称,科学家意外在1966年的一个组织样本中发现了“几乎完全”的艾滋病病毒基因组,这比人类发现艾滋病的历史还早了20年,科学界纷纷称奇!

专家表示,这是已知最古老的几乎完全的HIV病毒株基因序列,发现地点在刚果民主共和国。该组织样本于1966年采集并保存,巧的是,1976年相关专家在刚果民主共和国采集也采集了类似血液样本,这使得这一HIV序列比先前最古老的基因组早10年。那么发现这些基因序列有何意义呢?其实像这样的基因序列可以帮助我们确定病毒基因突变的时间。这些突变反过来又帮助科学家追踪病毒的传播以及艾滋病毒在人类中传播的时间。

在这个意义上,新的基因序列无疑是巨大的发现,这一序列与研究人员之前对艾滋病病毒出现时间的理解非常吻合。这意味着科学家们一直应用于病毒序列的进化模型运行与之吻合。

病毒出现

根据对病毒样本的基因测序,科学家们认为,艾滋病毒,即人类免疫缺陷病毒,最早在20世纪初的某个时候在中非的人类身上就已经找到了立足点,从黑猩猩身上传播。该病毒有多种毒株,但造成全球95%病例的毒株同属于一个名为HIV-1 M组。自大流行开始以来,已有3200多万人死于由HIV引起的艾滋病。

据有证可考,HIV-1开始在人类中传播到发现该病毒至少有80年的时间,尽管如此,该疾病的早期传播动向仍然很神秘。病毒变异率的数学模型暗示了艾滋病病毒何时开始在人与人之间传播,这种传播最终会导致大流行。但一个大问题是,HIV-1 M组到底是在什么时候变得能够如此有效地感染人类,从而走向全球。

专家认为,这仍然是一个需要长期观测和研究的问题。

旧艾滋病毒

研究员格里塞尔斯加入了由亚利桑那大学进化生物学家Michael Worobey领导的一个正在进行的项目,并与比利时、美国和刚果民主共和国的其他同事一起,分析了1958年至1966年间在中非采集的1645个活检标本,以诊断医疗状况。切片保存在化学福尔马林中,然后包埋在石蜡中。研究人员使用非常敏感的PCR方法(类似于在鼻咽拭子中检测新冠状病毒SARS-CoV-2的方法),寻找HIV基因组的线索。他们只发现了一个:一个38岁男性淋巴结活检的序列。

那里有一些旧的艾滋病毒片段,一个来自1959年,一个来自1960年,也是来自刚果民主共和国。但这些片段并没有那么完整,因此不能提供那么多关于病毒突变的信息。格里塞尔斯说,这些片段也来自不同的HIV亚型,这表明该病毒在20世纪50年代之前已经在人类中传播了一段时间。

格里塞尔斯说,研究人员将继续在很久以前的组织样本中寻找旧的艾滋病病毒基因组。她说,最好能从50年代或60年代找到更多的样本来证实这一结果。下一个目标是弄清楚HIV-1何时转变成一种加速的流行病。虽然HIV-1基因的某些改变可能使其更有效,但更可能是社会的改变造成了这种差异。20世纪初,中非城市化迅速发展。从1910年到1950年代,公共卫生运动扩大了从昏睡病到疟疾和梅毒等疾病的治疗范围。但这些运动中的许多并没有对针头进行适当的消毒,针头可能会广泛传播艾滋病毒。20世纪60年代的非殖民化也可能导致人们四处迁移或行为改变,这可能有助于病毒传播到新的人群中或传播得更快。

格里塞尔斯说:“如果我们能更好地了解这种扩张发生的时间线,我们就能更有效地权衡这些不同的假设,因为它们发生的时间不同。”

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