白芷气味芳香，味道微苦，具有除腥去膻、增香添味、增进食欲的神奇功效，因而是日常烹饪中常见的一种香辛调味料，可广泛应用于卤、煮、酱、烤、焖、烩、煎、炸、蒸、腌等各种烹调方式之中，堪称去腥增香的“神器”。作为香料家族中的重要成员，白芷与其他香料具有很好的融合性，可与八角、桂皮、茴香、丁香等组合使用，因此成为复合调味料“十三香”的重要原料之一，还常常被添加在火锅底料中使用。以白芷为主料，配上洋葱、红椒、香菜等调制而成的白芷卤水，最适合拿来卤制三黄鸡及猪心、猪舌、鸭掌、鹅翅等。我国各地的许多特色菜肴均离不开白芷的参与。如山东菏泽地区被誉为“中华第一汤”的单县羊汤，就是用羊肉加白芷熬制而成的特色美食，这种已有200多年历史的羊汤色白似奶，水脂交融，质地纯净，鲜而不膻，香而不腻，烂而不黏，且散发着浓浓的白芷香气，令人食之难忘；又如四川遂宁“十大名菜”之一的灵芝白芷丸，是将鸡脯肉、鱼、虾打成泥，与白芷一起搓成丸子，放在老母鸡和灵芝炖的汤里用文火慢煨而成，是一道晶莹剔透的食疗佳品；再如颇具创意的白芷旱蒸鸭，是在传统的白斩鸭中加入白芷上锅清蒸而成，既保留了食材原有的营养和味道，又很好地升华了鸭肉的清香；还有我国南方地区广为流行的川穹白芷鱼头汤，也是一道用鱼头和白芷、川穹烹制而成的美味浓汤，因有祛风驱邪的神奇功效而深受大众喜爱。不过，白芷的香味太过浓烈，有一种很重的中药味道，很容易掩盖其他食物原有的味道，因此，在使用过程中很有讲究。通常来说，白芷最适合用来烹饪牛、羊肉等高油脂含量的食材，因为它能促进脂香的形成，不仅可以有效去掉肉中的腥膻味，而且还能保留牛、羊肉的本味，使肉质变得更加细嫩美味。在烹制牛杂汤、羊杂汤时，我们可以适当多加一些白芷调味；但如果在烹制油脂含量相对没那么高的禽类食物时，则要十分注意控制用量。这是因为，白芷有收敛的功效，在烧烤禽类时适当加些白芷，可防止食材水分的流失，烤制出来的鸡、鸭、鹅肉润泽香嫩，不焦不燥。在红烧或者卤制禽类食物时，也可添加少量白芷进行增香，但切记不可过量，否则，药味太重，反而会破坏食物的口感。如果是清炖鸡、鸭，最好不要加白芷，以免将原有的鲜美味道掩盖殆尽。除了直接将白芷的根部切片用于烹调荤腥食物之外，新鲜的白芷根还可以用于制作泡菜。
由于白芷的味道辛辣芳香，且含有天然的抗菌成分，可对多种细菌产生抑制作用，并能抑制病毒的活性，因而在制作泡菜时加入几根新鲜出土、尚未经过硫黄熏蒸的白芷，不仅能使泡菜变得更加爽脆可口，还能有效防止泡菜坛中的水质生花变质。此外，白芷的根、叶和果实还可以拿来提取精油，用于调配食用香精或者用于化妆品生产。
