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Nature子刊: 一组新的基因识别衰老细胞并预测跨组织的衰老相关途径

来源:生物谷原创 2022-08-25 17:36

细胞衰老现在被认为是动物和人类衰老的基本机制。DNA损伤和/或其他细胞应激源的积累导致增殖以及终末分化、不分裂的细胞经历衰老。

细胞衰老现在被认为是动物和人类衰老的基本机制。DNA损伤和/或其他细胞应激源的积累导致增殖以及终末分化、不分裂的细胞经历衰老。衰老细胞的特征包括染色质和分泌体的深刻变化,以及一些衰老标记物的表达增加,包括CDKN2a/p16INK4a和CDKN1a/p21Cip1,免疫逃避和抗凋亡。

尽管细胞衰老通过衰老相关的分泌表型导致多种与年龄相关的共病,但体内衰老细胞的鉴定仍然具有挑战性。

图片来源: https://doi.org/10.1038/s41467-022-32552-1

近日,来自明尼苏达州罗切斯特市梅奥诊所内分泌科的研究者们在Nature Communications杂志上发表了题为“A new gene set identifies senescent cells and predicts senescence-associated pathways across tissues”的文章,该研究揭示了SenMayo是一个具有潜在临床应用价值的监测衰老的基因集。

尽管细胞衰老通过衰老相关的分泌表型导致多种与年龄相关的共病,但体内衰老细胞的鉴定仍然具有挑战性。在本研究中,研究者证实了一个基因组(SenMayo),并在两个老年人类队列的骨活检中验证了它的富集性。

研究者进一步证明了在小鼠衰老细胞遗传清除后骨骼中SenMayo的减少,以及药物衰老细胞清除后人类脂肪组织中SenMayo的减少。接下来,研究者使用SenMayo在单细胞水平上从人和小鼠骨髓/骨scRNA-seq数据中识别衰老的造血细胞或间充质细胞。

因此,SenMayo高保真地识别跨组织和物种的衰老细胞。使用这个衰老面板,研究者能够在单个细胞水平上描述衰老细胞的特征,并确定关键的细胞间信号通路。

在小鼠骨和骨髓间充质细胞中,骨线样细胞占SASP细胞的比例最大

图片来源: https://doi.org/10.1038/s41467-022-32552-1

综上所述,本研究揭示了一个新的基因集(SenMayo),它随着组织和物种的衰老而增加,对衰老的细胞清除做出反应,并可用于批量和scRNA-seq分析,以确定高水平表达衰老/SASP基因的细胞。

该基因集在衰老细胞负荷的临床评估和衰老疗法的研究中也具有潜在的实用价值。此外,SenMayo避开了目前在单细胞水平上对衰老细胞进行转录鉴定的限制,从而允许进行详细的分析(例如假时间、细胞间信号传递),这将有助于在未来的研究中更好地表征这些细胞。(生物谷 Bioon.com)

参考文献

Dominik Saul et al. A new gene set identifies senescent cells and predicts senescence-associated pathways across tissues. Nat Commun. 2022 Aug 16;13(1):4827. doi:10.1038/s41467-022-32552-1.


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