肛瘘有原发性内口、瘘管、支管和继发性外口。内口即感染源的入口，多在肛窦内及其附近，后正中线的两侧多见，但也可在直肠下部或肛管的任何部位。瘘管有直有弯，少数有分支。外口即脓肿溃破处或切开引流的部位，多位于肛管周围皮肤外，由于原发病灶不断经内口进入管道，加之管道迂曲行走于内、外括约肌附近，管壁由纤维组织构成，管内有肉芽组织，故经久不愈。
一般单纯性肛瘘只有一个内口和一个外口，这类最多见。若外口暂时封闭，局部引流不畅，则又逐渐发生红肿，再将形成脓肿，封闭的外口可再穿破或在其他处形成另一外口。如此反复发作，便病变范围扩大或有时造成几个外口，与内口相通，这种肛瘘称为复杂性肛瘘，即有一个内口与多个外口。
但有人认为，复杂性肛瘘不应以外口的多少划分，而是指主要管道累及肛管直肠环或环以上者。虽然这种肛瘘只有一个外口及一个内口，但治疗比较复杂，故称为复杂性肛瘘。相反，有时肛瘘虽有多个外口，但治疗并不复杂。
肛瘘的保守疗法，一般用于择期手术患者，目的是为了减轻症状和减少发作。
①调理排便：保持大便通畅，防止腹泻或便秘，以减少粪便对肛瘘内口的刺激。
②清洁肛门：每日用温盐水或高锰酸钾1：10000的溶液坐浴1～2次。且要勤换内裤。
③适当用药：可适当使用黄连素、庆大霉素等抗生素口服，以控制炎症。也可适当使用药膏等局部涂抹或中药内服外用。
肛瘘不能自愈，不治疗可反复发作直肠肛周脓肿，因此一旦确诊必须立即手术。手术方式很多，主要根据内口位置高低、瘘管与肛门括约肌的关系来选择。手术的关键是处理好瘘管内口，尽量减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁，同时防止瘘管复发。
为了解决高位复杂性肛瘘的根治难题，由富有经验肛肠疾病专家坐诊，具有诊断明确、手术时间短、无痛苦、出血少、恢复快、无复发、无后遗症等特点。
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