吴门医家是指在“吴门”这一地域范围内进行医学活动的医家之总和。吴门医家众多， 著作颇丰，据《古今图书集成》所引《神仙传》载，吴医始于周朝吴郡人沈羲。自周以降，至建国前，共有医家138扩人，著作1179部，存世约530部。纵观吴门中医学 的发展历程，经历了起源于周，发展于宋元，繁荣于明，鼎盛于清，中西汇通于民国的过 程。
1.唐代及唐之前
吴门在唐代之前有医家2人，周代有沈羲，汉代有负局先生，皆为道门中人。唐代有 周广、纪朋、程仪等医家3人，其中纪朋为周广之徒，二人善于望诊，“观人颜色，便知 疾病深浅”，周广在唐开元年间被“召至京师”，为吴门中有史记载的首位御医。
2.宋元发展时期
宋代之时，吴门医家约有13人，其中多人为南宋迁都临安之后，迁徙至苏州地区， 如沈良惠、庄季裕等。他们为江南地区输入了新的医学知识和学术思想，并繁衍于此，世 代为医，形成世医家族，如以葛应雷为起源的“宋代世医第一家—葛氏世医”，后世 对葛氏世医评价甚高，元末明初文人王伟曾言“予观近时言医者，莫盛于吴中。而吴中世 业医者，莫盛于葛氏”。此时苏州地区已出现专科医家，如专于疡科的颜直之，专于小 儿科的滕伯祥等。
元代吴门地区中医学进入发展时期，约有医家58人，其中有九大医世家族，计有53 人，如葛氏世医、韩氏世医、昆山郑氏女科等。特别是起源于此时的“昆山郑氏女科”更 延续至今仍有传人。“儒医多”亦为元代的显著特点，许多文人因战乱而由文转医或因儒 通医，如刘岳、倪维德、王国瑛、葛应泽、陆文圭等。宋元时期由于北方人口的南迁，使 发源于北方的医学思想得以在吴门传承与发扬，如易水学派的学术思想主要通过私淑的方 式传播，如葛应雷、倪维德、许矩等人。同时吴门医家通过医学实践丰富了易水学派的学 术思想，如葛应雷之子葛乾孙所著《十药神书》，将易水学派重视脾肾的思想用于肺痊的 证治。
3.明代繁荣时期
明代吴门医学进入发展繁荣时期，约有医家392人，存世著作68部。在儒医、世医 人数众多的基础上，因明初定都南京使明代吴门涌现了大量的御医、医官，召至太医院者 计72人，并出现家族聚集现象。如盛寅一门，有盛寅、盛宏、盛皑三人;薛己、薛恺父 子;刘观、刘溥父子等。学术思想出现繁荣之景，涌现出大量的医学著作，易水学派、河 间学派、伤寒学派的不同学术思想得以传播与继承。同时不同学术流派的学术思想得到了 碰撞和融合，从而产生了新的学术思想。如薛己在重视脾胃的基础之上创导温补之法:王 履的《医经溯涸集》对“温病、热病混称伤寒”提出批评，认为“当观其何时何气，参 酌伤寒、温热病之法，损益而治之，尤不可例以仲景即病伤寒药通治也”；明末吴有性 于《瘟疫论》中提出“温疫之为病，非风，非寒，非暑，非湿，乃天地间别有一种异气所 感”，对温疫的病因有了较为明确的认识。这些新学说实为清代温病学派在吴门中崛起 的思想种子。
4.清代鼎盛时期
清代进入鼎盛时期，此时期约有医家693人，存世著作388部。清代的吴门医家在继 承先人传统医学活动的同时，学术交流变得更为频繁，寓居、迁徙现象增多，游学、访师 颇盛，如喻昌、缪希雍、李中梓、柯琴、陆憋修等人。又因学术交流的发展而衍生出学术 沙龙、学术团体、学术期刊，如唐大烈所汇编之《吴医汇讲》，作为中国第一本医学期刊， 从清乾隆五十七年(1792)到青嘉庆六年(1801)，办刊有十年之久，有力促进了吴门地 区乃至全国的中医学术交流。清末西方教会医院的出现带来了全新的现代医学思想，吴门 医家群体秉着“师夷之长技以制夷”的救国思想，宣统年间成立中西医学研究会，医家 们开始接受和学习完全不同于传统中医的医学思想。
学术思想上，吴门在清代诞生了新的学术流派—温病学派。同时伤寒学派中出现学 术分野，喻昌、张璐父子、周扬俊等人主张以“错简重订”为研究角度;徐大椿、尤怡、 钱磺等人，主张从“辨证论治”角度研究《伤寒论》。易水学派、河间学派的学术思想更 逐渐融合于医家的一般思维，成为医家之共识。
5.民国新思潮时期
民国时期，约有医家227人，存世著作82部。在动荡的历史环境下，吴门医家群体 在“教育系统漏列中医案”和“废止中医案”等生存困境下继续从事传统医学活动，并开 始尝试用中西医结合两种方法治病，中西汇通的思想得到医家的认可。同时整理和总结了 中国的传统医学，诸如陈景岐等人编纂了《中国医学入门》等丛书。更翻译了国外的中医 学著作，如日本吉原昭道编写的《中风预防名灸》，在一定程度上促进了国内外的中医学 术交流。
从学术思想上看吴门医家中学术流派的发展历程，主要存在医经学派、易水学派、河 间、伤寒学派、温病学派等五大学派。其中医经学派贯穿了整个医学发展历程;易水学派、河间学派主要盛行于元明时期;伤寒学派在清代出现学术分野;温病学派诞生于明，繁荣于清。
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