近年来随着肠道菌群与慢病之间相关性研究甚至因果性研究的快速发展，以及越来越多的实验证实“饥饿源于菌群”并形成“菌心说”学说与相应体系！
“菌心说”学说使我们意识到人体共生微生物菌群尤其是肠道菌群很有可能是实现“中医现代化”的关键点，有望为“藏象学说”和“脏腑理论”的合理解释提供来自现代生物医学理论和临床应用技术的科学支持，从而为实现传统中医药的现代化、并充分发挥新中医在慢病防控和医疗改革中的积极作用奠定重要基础。
但是传统中医的“望、闻、问、切”等基本技术以及系列传统中药的（特殊）炮制技术面临失传的风险，不仅道地药材的质量在持续下降（由于化肥使用、重金属超标、农药残留等），而且即便是基于中药指纹图谱的质量控制，也难以从根本上支持并证明甚至关联起中药的明确疗效，这是因为如果按照西药的研究路线的话，以“复方”为主的传统中药很难通过CFDA的评审而获批。
而当针对整个国际医学界所面临的多种慢病例如肥胖、糖尿病以及恶性肿瘤等层出不穷、心脑血管疾病和自闭症等频繁高发的现状，西医的“头痛医头，脚痛医脚”不但副作用大，综合治疗效果也差！
“菌心说”学说（简称“菌心学说”）是中医专家们于2013年12月19日正式提出来的，指的是对于人体的饥饿与摄食而言，人脑可能并不是最重要的器官，而隐居并共生于人体胃肠道内部甚至遍布在全身体内体外的微生物尤其是胃肠道菌群即“心脑菌脑”，很有可能是人体代谢信号特别是因饥饿而摄食信号的来源以及多种慢病的起源中心，即“饥饿源于菌群”和“慢病源于菌群”。
人体每天的饥饿信号来自于胃肠道菌群繁殖其自身后代、复制基因组DNA的需要，通过攻击人体胃肠道粘膜获取碳源、氮源等营养物质，而向人体发出饥饿信号，引发人体摄食活动，而且饮食的种类也与胃肠道菌群的数量和质量密切相关、甚至受到其控制。在胃肠道菌群异常的情况下，人体会表现出多类慢病包括肥胖、便秘、三高、过敏和免疫相关疾病、心脑血管疾病、肿瘤、老年性痴呆、帕金森氏症、癫痫、孤独症、异食癖、甚至精神病等，甚至包括同性恋等问题也与胃肠道菌群的不同状态密切相关。
即一个人的整体健康状态受到其本身、共生菌群以及两者相互作用（含环境因素）的联合影响。
慢病是困扰人类健康的大问题，而且目前问题还在变得越来越严重。结合已有大量文献所报道的菌群紊乱与多种慢病（例如肥胖、便秘、糖尿病、心脑血管疾病、老年性痴呆、恶性肿瘤等）的发生发展密切相关这些事实，使用菌心学说的观点来看，结合传统中医“藏象学说”与“脏腑理论”，不妨可以这样认为，人体出现慢病，即人体这个“表象”通过“六腑”表现出人体异常，应当是“藏”所对应的“五脏”的菌群异常的表现，因为菌群是人体健康的核心、而人体则是菌群是否健康的标志，菌群正常则人体正常，菌群异常则人体异常。
因此，不同慢病应当是不同菌群异常通过人体的不同表现而已。据此，不妨可提出这样的观点，后续关于慢病起源、发生发展与治疗转归，学术界应该致力于创建“不同慢病的菌群异常状态的频谱图”的大百科全书，陆续确定菌群异常与人体慢病的高度相关乃至因果关系，并基于菌心学说以及传统中医“藏象学说”与“脏腑理论”系统研究治疗方案，从而形成完成“中医现代化”的关键一环。
台湾敏博士提醒您：
min bose remind you
过敏的患者肠内缺乏好菌 过敏原的种类很多，诸如：尘螨、细菌、花粉、蛋白、荞麦、牛奶、大豆……等千奇百怪，许多医学研究指出，由于过敏原所引起的过敏问题，与肠道内的好菌坏菌有着密切的关系。有研究显示，人体70%以上的免疫是受控于肠道中的有益菌，而过敏的患者，肠道里的好菌（比菲得氏菌、乳酸菌）比较少，如果能正确的多补充好菌，尤其是多补充能有效调节过敏体质的好菌，自然就能改善过敏体质。
（那么过敏体质和人体免疫之间到底是什么关系呢？请看视频）
过敏是免疫球蛋白E太多了 人体的免疫细胞目前区分为三类，分别为TH1、TH2与Treg。在健康状态下，TH1和TH2会互相平衡，且共同受到Treg调控。在Treg调控能力不足时或接触到某些蛋白质或细小分子（尘螨、花粉或海鲜食物等）后，TH2过度活化，导致TH2细胞激素分泌量过高/过盛，就会帮助B细胞（B cell）制造较多的过敏抗体IgE，因而出现过敏症状。
经过多年的研究，通过对人体已知的肠道菌，用专利生物芯片不断筛选后，研究发现，如果肠道内有足够的L.g(格式乳杆菌) l.j（约氏乳杆菌）和L.s（唾液乳杆菌）益生菌，就能够针对过敏上游源头透过对辅助型T细胞的调控达到有调控TH2细胞激素（cytokine）分泌量，进而调节免疫细胞活性平衡，从而达到从根本上纠正过敏体质的作用。（请详细看研发过程！）
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