20世纪50年代，四川高校的院系调整与全国院系调整大体同步，可以分为三个阶段。但四川在院系调整的具体过程中，又表现了一些与全国院系调整特点所小同的差异性，体现了历史的丰富和多样性。
一．第一阶段，从1949年底到1952年上半年，为四川高等院校小规模的初步调整。在这段时期，四川由于巩固政权和恢复国民经济的任务很重，无力进行大规模的院系调整，只是对全川36所高校进行接管、接收和部分整顿。这段时期的小规模院系调整是通过下列步骤实现的。
1.接受、接管了国民党时期的全部公立院校。四川解放初，在西南军政委员会的统一部署下，各级军管会或人民政府发布了“保护学校的通告”，本着“维持现状，继续开学，宁慢勿乱，稳步前进”的方针，接管了12所公立院校。把这些已经失去主管机构和经费来源的国民政府公立大学改为人民政府的公立大学，但在这段时间对四川公立大学很少调整。大多是维持原状，稳定教学。
2．有步骤地整顿调整了私立大学。由于新政权的建立，旧社会四川私立大学所潜伏的各种矛后迅速激化，大部分私立学校出现严重困难，许多难以继续维持。对此，西南军政委员会文教部按照“积极支持、重点补助、逐步改造”的方针，对四川的私立大学进行适当的整顿。首先对办学条件好或者设有国家急需专业的院校，开始补助经费，并设“人民奖学金”，例如成华大学、相辉学院、辅成学院等8所私立院校。其次取缔了一些实际上不属于高校范围、没有办学资格和政治极端反动学校，例如东方文教学院改按宗教团体对待，办学条件不足的群治学院等4所大学自动停办，政治反动的大川学院等3所高校子以查封。对涉及国家主权的教会私立华西协合大学，也在抗美援朝运动中收回自办，改为华西大学。
3.根据国家和地方建设的需要，调整和新建了一些院校，使四川又产生7所院校。它们是西南人民艺术学院(原西北艺术学院为基础)、川北大学(原川北大学和川北文学院合并)、西南师范学院(原女子师范学院和省教育学院部分系科合并)、西南农学院(省立教育学院和相辉学院部分系科合并)、川东教育学院(以原乡村建设学院为基础)、西南民族学院(新建)、西南人民革命大学(新建)。
这次小规模的院系调整，初步整合了四川的教育资源，特别是私立院校得到了大力整顿，同时新建了一些适应四川经济、社会发展的部分系科，但是直接服务于大规模经济建设的各专门学院仍然还很薄弱，这就成为下阶段调整的重点。
二．第二阶段，从1952下半年到1956年底，四川高等院校大规模调整。1952年，随着国民经济恢复任务的完成和各项政治运动的深入展开，四川乃至全国大规模院系调整的时机已经成熟，西南军政委员会文教部根据中央“以培养工业和师资为重点，发展专门学院，整顿和加强综合大学”的方针，依据西南地区的具体情况，在征求各方而的意见后拟定了西南地区的院系调整方案，经呈教育部批准后，于1952年9月22日至25日召开了西南高等学校院系调整工作会议。同时新成立的四川省政府也规定了四川院系调整原则:（1)从国家建设的全局出发，集中使用师资、设备，既考虑发展的远景又照顾当前的需要;（2)有计划、有步骤、有重点的进行;（3)尽量减少普通综合大学，增强和发展专门学院。通过这次调整，四川高校设置和地区分布发生了巨大变化。这次调整采取了下列步骤：
1.鉴于国家和地方大规模经济建设需要各级各类人才，特别是工业人才，四川在这一时期新建了11所专门学院，它们是四川师范学院(原川北大学为基础)、重庆土木建设学院(各院校相关系科合并，1954年改为重庆建筑工程学院)、四川财经学院(原成华大学为基础)、四川纺织工业专科学校(原乐山技艺专科学校为基础)、四川化工学院(以川南工业专科学校为基础)、西南美术专科学校和西南音乐专科学校(以西南人民艺术学院为基础)、西南政法学院和西南俄文专科学校(以西南人民革命大学为基础)、重庆师范专科学校(新建)、成都工学院(以川大工学院为基础)。
2.进一步优化了四川原有的高等教育资源，对部分院校进行调整、改组、撤消。四川大学改为文理综合大学、重庆大学改为多科型工科大学、华西大学改为多科型医学院，将它们的其它系科调出。将成都体育专科学校扩充为西南体育学院，取消了四川纺织工业专科学校和西昌技艺专科学校的办学资格。
经过这一阶段的大规模调整，全省共有高校18所，其中工科院校和师范院校各4所，仅保留了一所综介大学，基本达到中央1952年院系调整的要求，进一步的优化了四川高等教育的结构。但是这次调整后四川的高校数量较解放初减少一半，不利于四川高校规模效应的发挥，也与国家备战、开发西部的战略方针不符。
三．第三阶段，1956以后四川院校的继续局部调整，在这个阶段主要是配合全国国民经济布局的调整，继抗战时期之后，第二次调整高校集中于东部沿海地区的不合理状况，正如中央指出“无论是从社会主义建设的长远目标着眼，还是从国防观点……高校分布都不宜集中”。
1.这一阶段有大量东部院校的系科西调，在四川新建了3所院校。它们是成都电讯工程学院、重庆医学院、成都地质勘探学院。
2.进一步调整优化四川的高教资源。四川师范学院由南充迁往成都，部分专科留当地建立南充师范专科学校、四川大学农学院迁雅安独立建校，定名四川农学院、新建成都中医学院等等。
经过这一阶段的调整，四川新建6所院校，其中工科和医科各2所，农科和师范各1所。至此，四川共有高校24所，建立了以工科和师范为主、其它系科协调发展、学科门类齐全的高等教育体系，四川高等教育的优势地位得到进一步的加强。
四川在院系调整过程中，表现出与全国不同的一些特点。四川院系调整的总体规模相对于全国而言并不算大，在中央关于院系调整的文件中，四川总体始终处于局部调整的地位，当时是这样措辞的:“以华北、华东、中南为重点，西南区只进行个别院校的调整”，“1953年以中南为重点，西南进行局部调整”，等等。这样一来，是四川院系调整的进程总体上就比全国的进程要稍缓一些，就给了四川的高校更多一些准备时间和可资借鉴的经验，有利于维护四川高教事业的整体稳定性。
具体来说，第一阶段全国院系调整进程总体较缓，而四川却因为有着众多的私立院校而而临着较繁重的初步调整任务;第二阶段全国院系调整进程总体较急凑，许多地区的高校设置被全盘打破，推倒重来，而四川却在基本维持原有高校设置的基础上，有计划地发展了一大批新兴学院，使四川高校资源配置在巩固的基础上稳步提高;第三阶段全国许多地区的高校资源都被调出而受到不同程度的削弱，相反四川的高校资源却因为其独特的战略地位而被不断的充实和加强。第三阶段调整的余波可以追溯到1972年唐山交通学院内迁四川峨眉组建西南交通大学。
1950年代的四川院系调整，促进了四川高等教育的发展。经过调整的四川高校已经初具规模，对四川省的社会主义建设人才的培养乃至经济发展、科技文化事业的进步产生了不可估量的影响;四川高校自身也得到充实提高，办学效益大大改善;全国高校地区分布继续合理优化;四川省内的高校分布也趋于合理。
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