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脑科学日报|CA重磅综述文章,AI和肿瘤:临床挑战与应用;Nature:大脑皮质神经元投射的亚细胞转...

第 225 期 脑科学日报

2019年2月11日

科 学 时 讯

1,Nature最新突破,大脑皮质神经元投射的亚细胞转录组和蛋白质组研究

1月9日,哈佛大学干细胞与再生生物系、干细胞研究所、脑科学中心Jeffrey D. Macklis在Nature杂志发表文章。他通过转录组和蛋白组定量来自体内单个投射的GC,最终开发了GC分选方法并得到亚细胞RNA-蛋白组图谱。

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Nature最新突破,大脑皮质神经元投射的亚细胞转录组和蛋白质组研究

2, 神刊CA(IF=244),2019年首篇重磅综述文章,AI和肿瘤:临床挑战与应用

2019年2月5号,医学顶级期刊CA(IF=244)在线发表题为“Artificial intelligence in cancer imaging: Clinical challenges andapplications”的综述,该文章提出了:尽管迄今为止评估肿瘤学中AI应用的大多数研究尚未得到有效再现性和普遍性的有效验证,但结果确实突出了越来越多的努力将AI技术推向临床应用并影响着未来癌症护理发展方向。

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神刊CA(IF=244),2019年首篇重磅综述文章,AI和肿瘤:临床挑战与应用

Motif Search 揭示PTBP2是神经元轴突早期发育中基因选择性剪接的重要调控因子,Ptbp2 基因缺失小鼠存在明显神经元轴突发育缺陷。

近日,美国加州大学河滨分校医学院郑斯卡教授团队与美国南加州大学陈亮教授合作,于Neuron在线发表了题为Axonogenesis is coordinated by neuron-specific alternative splicing programming and splicing regulator PTBP2的研究结果。

该研究通过对小鼠胚胎大脑皮质神经元基因进行转录组水平的深入分析、结合对基因敲除小鼠模型的研究发现, 在神经元轴突早期发育阶段存在广泛的pre-mRNA选择性剪接(pre-mRNA alternative splicing),神经特异性剪接调控蛋白PTBP2在此过程发挥重要作用、并调控众多已知的神经轴突发育相关基因的选择性剪接,从而揭示了神经轴突早期发育重要分子机制,为今后神经轴突生长机制的进一步研究及相关神经系统疾病机理探索和疾病治疗提供了重要实验依据。

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Neuron丨郑斯卡/陈亮合作组揭示神经元轴突生长机制,为相关疾病治疗提供新思路

4,JCI | 南京大学张存金组发现多发性硬化症免疫病理新机制

近期,南京大学医学院附属鼓楼医院神经内科张存金团队与美国Xiaoxia Li教授团队合作,在Journal of Clinical Investigation上发表题为TLR-stimulated IRAKM activates caspase-8 inflammasome in microglia and promotes neuroinflammation的文章。通过对MS病人尸检脑标本、动物模型研究和分子水平质谱筛选等技术手段,发现小胶质细胞内IRAKM促进炎性小体介导的IL-1β产生,进而IL-1β以自反馈的方式促进小胶质细胞存活并通过促进Th17细胞的炎性功能加重髓鞘损伤的新机制,提出阻断脑内IL-1β或IL-1R信号是抑制中枢髓鞘损伤的新策略。

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JCI | 南京大学张存金组发现多发性硬化症免疫病理新机制

5,肖百龙课题组发表研究论文揭示机械门控Piezo通道在小鼠躯体感觉系统机械力感知中的重要功能

当不小心砸到手时,我们会下意识的轻轻吹吹伤口,就会带来疼痛的有效缓解。为什么会这样呢?清华大学药学院肖百龙课题组的最新研究为此现象提供了解释。相关研究成果于 2019年2月5日以封面论文发表在Cell Reports期刊,论文题目为“机械门控Piezo通道介导小鼠的触碰而抑制其机械疼痛感知” 。

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肖百龙课题组发表研究论文揭示机械门控Piezo通道在小鼠躯体感觉系统机械力感知中的重要功能

阅 读 分 享

1,因细胞污染而使3万多篇医学论文作废 ,数十亿美元资助可能打水漂

据调查显示,数十年来发表的超过30000份医学研究论文因污染细胞而无效。科学家使用的细胞系中有20%到36%被污染或被错误识别 - 作为人体组织细胞的研究,实际上来自猪,大鼠或小鼠,或者其中所需的人类细胞被未知的其他细胞污染。 但是,尽管已经了解这个问题至少35年,但绝大多数期刊尚未对受影响的研究提出任何免责声明,同时这些污染的细胞可能影响数十亿美元的研究。这些问题。Science进行了专门的报道。

阅读链接:

【重点关注】因细胞污染而使3万多篇医学论文作废 ,数十亿美元资助可能打水漂

沈定刚教授认为,所谓的AI或者深度学习,只是解决问题的一种方法,方法必须为解决问题服务。他也时常告诫自己的学生:这个行业里的研究者,不能光知道深度学习,很多几十年累积起来的经典方法都必须要懂。因为一个方法不可能解决所有的问题,每种方法总有它的局限性。同时,在思路上,应该是通过问题找方法,而不是用方法来找问题。

演讲链接:

沈定刚教授:深度学习在医学影像分析中的应用丨2018医学影像AI经典演讲回顾(二)

本文中的这篇科学论文证明:在小鼠,对于制造(神经系统)疾病模型,混合遗传背景优于单一背景。这也就否定了一种简单的说法,那种说法声称:制造人类疾病的动物模型时,用克隆的动物优于非克隆动物。

克隆动物一定比不克隆动物更好吗?答案有时是否定的

前 文 阅 读

1,脑科学日报|JCR:你的选择困难症什么时候才会发作?当深度学习握手脑科学;2019年度国家自然科学基金项目指南发布;

2,脑科学日报|Cell:失去性欲、产生同性性行为,或因一类神经元失常;段树民院士团队《BRAIN》发文揭示帕金森病研究新进展。

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