重庆市(4)
1.重庆缙云山国家级自然保护区
2.重庆大巴山国家级自然保护区
3.长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区*
4.重庆金佛山国家级自然保护区
四川省(22)
1.四川龙溪-虹口国家级自然保护区
2.四川白水河国家级自然保护区
3.四川攀枝花苏铁国家级自然保护区
4.四川画稿溪国家级自然保护区
5.四川王朗国家级自然保护区
6.四川唐家河国家级自然保护区
7.四川马边大风顶国家级自然保护区
8.四川长宁竹海国家级自然保护区
9.四川蜂桶寨国家级自然保护区
10.四川卧龙国家级自然保护区(直属国家林业局;参见卧龙特别行政区)
11.四川九寨沟国家级自然保护区
12.四川小金四姑娘山国家级自然保护区
13.四川若尔盖湿地国家级自然保护区
14.四川贡嘎山国家级自然保护区
15.四川察青松多白唇鹿国家级自然保护区
16.四川亚丁国家级自然保护区
17.四川美姑大风顶国家级自然保护区
18.长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区*
19.四川米仓山国家级自然保护区
20.四川雪宝顶国家级自然保护区
21.四川花萼山国家级自然保护区
22.四川海子山国家级自然保护区
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