据美国1947年《国家安全法》，美军设立由多军种组成的联合司令部。《1999年联合司令部计划》确定美军设有九个联合司令部，每个司令部由一名上将统率。
太平洋总部：航母曾游弋于台湾
成立于1947年1月，辖区从美洲西海岸到非洲东海岸，从北冰洋到南极，面积约一亿多平方英里，覆盖44个国家、30个美国及其他国家的托管领地，是美军联合司令部中辖区最大的一个。该总部统领太平洋陆军司令部、舰队司令部、陆战队司令部和空军司令部以及驻韩美军司令部等，共约30万部队。总部设在夏威夷州瓦胡岛史密斯营地，现任司令为丹尼斯・布莱尔海军上将。太平洋总部的部队先后参加过朝鲜战争和越南战争，并曾为其他战区的战争提供重要的保障和支援。在上曾数度出手干涉。1950年其第七舰队奉命到台湾海峡巡逻，阻拦我军；1958年金门炮战中，其军舰先为蒋军护航，后又仓皇撤退；1996年我东南沿海军事演习期间，其"独立"号航母到台海附近游弋，待我潜艇出港后迅速后撤。近年来，太平洋总部逐步加大了与台湾的军事交流和合作，并力图将双方部队的数据网络系统匹配链接，为提升台湾的作战能力和武力介入作精心准备。
欧洲总部：打过科索沃战争
成立于1952年8月，辖区从挪威的北角经波罗的海和地中海一直到南非的好望角，包括欧洲大部、中东部分地区和非洲大部分地区的共89个国家，面积约1400多万平方英里。该总部下辖驻欧陆军司令部、海军司令部、空军司令部、特种作战司令部和陆战队司令部。总部设在德国的斯图加特，总部司令兼任北约盟军最高司令。现任司令为罗尔斯顿空军上将。冷战时期，欧洲是美苏对峙的前沿，欧洲总部重兵集结。冷战后该总部兵力大幅削减，但仍保持约10万人的规模。1999年4月，以欧洲总部力量为基础的北约部队发动长达78天的科索沃战争。
南方总部：曾经抓捕诺列加
1963年6月在原加勒比海司令部基础上建立，辖区北起美国南海岸，南到南美洲（不含墨西哥）南端的火地岛，面积为1200多万平方英里。该总部下辖南方陆军司令部、空军司令部、特种作战司令部和大西洋舰队司令部等。总部原设于巴拿马霍华德空军基地，1999年底《巴拿马条约》到期后迁至美佛罗里达州的迈阿密。1962年古巴导弹危机期间，南方总部的前身曾参与在古巴周围的海空封锁行动。该总部还参加了1983年入侵格林纳达的"激流"行动和1989年入侵巴拿马的"正义事业"行动。目前，该总部在辖区内推进军事参与计划，并与一些国家联合开展缉毒行动。
中央总部：海湾战争的主角
1983年1月在快速反应部署联合特遣部队基础上设立，辖区包括波斯湾、中亚、西南亚和东北非，涉及25个国家。中央总部统辖中央陆军司令部、空军司令部、海军司令部、陆战司令部和特种作战司令部。总部设在佛罗里达州的麦克迪尔空军基地，现任司令为汤姆・弗兰克斯陆军上将。在1991年的海湾战争中，时任中央总部司令的诺曼・施瓦茨科普夫陆军上将指挥多国部队用42天时间击败伊拉克。此后，中央总部又多次参与对伊禁飞区的行动和1998年的"沙漠之狐"行动，并于1999年在美驻非洲两使馆被炸后向苏丹和阿富汗发射巡航导弹进行报复。在9.11后美国对阿富汗实施的军事打击行动及可能打击伊拉克的行动中，中央总部都扮演重要角色。
联合部队总部：推动联合作战
1999年10月1日由原大西洋总部改编而成，总部设在弗吉尼亚州的诺福克。该总部既负责大西洋战区（除与中美洲、南美洲毗邻的水域、冰岛、亚速尔群岛和北冰洋部分水域以外的整个大西洋地区）的防卫外，还负责美军的联合作战训练，提高各级部队的联合与协同能力，并向各总部提供做好战斗准备的联合部队。在现代条件下，美军力图借助联合部队总部推动部队联合作战甚至联军作战的能力。
航天司令部：航空航天和导弹总管
成立于1985年9月，负责对各军种航空、航天和弹道导弹防御部队实施作战指挥，下辖空军、海军和陆军3个航天司令部和若干作战及作战支援中心。航天司令部司令兼任北美航空航天防御司令部司令和空军航天司令部司令。总部设在科罗拉多州彼得森空军基地。
特种作战司令部：指挥三军特种部队
1992年6月在原战略空军司令部的基础上成立，负责指挥美国战略核力量。司令部设在内布拉斯加州奥佛特空军基地。
军事运输司令部：兵马粮草送往全球
于1987年4月成立，负责为配合各类作战行动准备特种作战部队，并对驻美本土的各军种特种作战部队实施作战指挥，统辖现役和后备役特种作战部队共4.6万多人。总部设在佛罗里达州的麦克迪尔空军基地。
于1987年10月成立，是美军全球国防运输系统的管理部门，负责协调、投送和维持美军所需的人员和战略运输资源，下辖空中机动、军事海运和军事交通管理3个司令部。总部设在伊利诺伊州的斯科特空军基地。
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