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GenomePixelizer 2003.10.1版 显示基因组中重复基因与基因簇成员之间的相互关系的软件。 查看基因扫描（genescan）格式.fsa文件并计算峰大小的小软件。 Sequin 13.70 S用来向三大核酸数据库GenBank, EMBL, DDBJ 查询与提交序列数据。 Gene Construction Kit 4.0.3 Demo 管理并显示克隆策略中的分子构建过程，包括分子构建，电泳条带。另外，还可以质粒作图（有序列没序列均可）。 GenomeComp 1.3 中科院生物物理所生物信息实验室推出的可视化的微生物基因组比较工具。 Web Apollo 1.0.4 Java语言开发的基因组注释显示编辑软件。 SNPHunter 1.75 SNP（单核苷酸多态性）查找软件。 SSRHunter 1.3 SSR（Simple Sequence Repeat，即简单序列重复，又称微卫星DNA）位点查找软件。 iCE 3.5 Java语言编写的显示基因指纹图及相关数据的软件。 MB6.84 免费的DNA分析软件。 FinchTV 1.5 免费的DNA图谱分析软件。 Sequence Scanner v1.0 显示分析ABI基因分析仪DNA图谱数据软件。 CodonCode Aligner 5.1.5 DNA测序trace图编辑、突变分析、contig编辑、序列拼接软件。 BioLign 4.0.6 免费序列拼接软件。 PIC_Calc 0.6 多态信息含量计算程序。 SequenceViewer 1.0 DNA序列图形显示软件； SERIAL CLONER 2.6-1 DNA序列分析工具软件 Xplorer 2.4.3 DNA图谱查看分析软件 DNA Counter v1.0.2 统计DNA序列各核苷酸百分比软件。 Chromatogram Explorer 3.2 显示、处理序列层析图谱文件软件。 NSA 3.3 核酸序列分析软件 YCDMA 3.1.1 管理微卫星数据的软件。 G-InforBIO V1.90 基因组数据建库与分析软件 IGB 8.3.2 基因组显示软件 goldMINER 2.0.27 根据蛋白功能分类数据库对基因序列进行功能注释与分类软件 DNA Master 5.22.1 免费DNA编辑分析软件 DNAPlotter 1.11 环形与线型DNA序列、基因组图形显示软件 AssociationViewer 2.0 基因序列SNPs查看显示软件 gbench 2.8.10 NCBI开发的分析序列数据软件平台 LocalMotif 1.0 查找分析DNA序列Motif软件 RepeatAround 2.1 在基因组中查找重复(同向、反向、镜像、互补重复)序列的工具软件 DNAux 3.0 DNA序列分析辅助软件 DNA Baser 4.20 DNA序列装配、分析、格式转换软件 Seqool 3.1 免费核酸序列分析工具。 DNA Dragon 1.5.6 build1 DNA序列装配软件。 CisGenome Browser 2.0 基因组数据显示软件。 PriorsEditor 1.0.11 dna序列调控区和转录因子结合位点分析软件平台。 Savant 2.0.5 适用于高通量测序数据的基因组浏览器。 BiQ Analyzer 2.0 DNA甲基化分析软件。 DNAmend 1.02A 简单的对DNA序列进行操作的软件。 BQGB 090528 Berkeley定量基因组浏览器。 Visual Gene Developer 1.7 基因设计软件 BioWord 20120923 生物序列编辑Word插件 MetaSee 1.2 宏基因组学显示工具 Genome Compiler 2.2.27 DNA设计软件平台 Avalanche Workbench 2.0.9 DNA序列数据分析显示软件以上软件，除特别注明外，均在生物软件DVD光盘1中。`
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