《伤寒论》成书距今已1700余年，近贤叶橘泉氏谓：“中国医籍之最有价值而为近世科学界所推崇者，惟张仲景之伤寒论。”信哉斯言！近年来若干中外医家在临床实验、实验医学研究方面的报到，足证《伤寒论》经方确寓有科学的内涵。
清·柯琴尝谓：“胸中有万卷书，笔底无半点尘者始可著书；胸中无半点尘，目中无半点尘者，才许作古书注疏。”便是强调读仲景书要“始终理会，先后合参”，不可掺入别派医家论点，使概念混淆产生歧义，才能真正领悟仲景心法，洞察《伤寒论》之精髓处。
笔者早年从师应用《伤寒论》法治疗急性热性病，投之得当，效如桴鼓；投之不当，变证蜂起。其后在临床实验中验证六经传经理论与现代医学病理生理学若干基本病理过程的因果转化关系相符。近年来与计算机作者共同探索研制中医软件时，乃日益明确《伤寒论》之科学性，在于其结构中寓有数理逻辑基础。
如论中：“太阳之为病，脉浮，头项强痛而恶寒。”经“脉浮”概括中风之“脉浮缓”和伤寒之“脉浮紧”。此太阳病与伤寒、中风，便是数据关系中的层次关系结构。太阳病为根元素，伤寒、中风等皆是从属元素。
又如：“太阳病，发热，汗出，恶风，脉缓者，名为中风。”“太阳病，或已发热，或未发热，必恶寒，体痛，呕逆，脉阴阳俱紧者，名曰伤寒。”是中风有发热、汗出、恶风、脉缓诸症状；伤寒则有或未发热者，且有必恶寒、体痛、呕逆、脉紧等各种症状的不同组合，以示与之相异之处。
观其方证“太阳病，头痛，发热，汗出，恶风，无汗，桂枝汤主之。”“太阳病，头痛，发热，身疼，腰痛，骨节疼痛，恶风，无汗而喘着，麻黄汤主之。”以症状组合与汤证链接，构成根据简化基构造的逻辑诊断树。根据医学知识细释汤证：两证据见头痛、发热、恶风，其差别主在桂枝汤证“汗出”；麻黄汤证“无汗而喘”，且有身疼、腰痛、骨节疼痛等次级症状。方剂组成中桂枝汤中无麻黄，麻黄汤中有桂枝，乃知中风之重者是伤寒，伤寒之轻者为中风。故不必在风寒上细分，须当在有汗、无汗上着眼，明示证之差别，不在病因，而在病机——机体反应性。
从现代医学观之，确是如此。伤寒是微生物病原体侵入人体后，毒素激活交感-肾上腺髓质系统分泌大量去甲肾上腺素（NE）作用于血管平滑肌α受体引起体表微循环收缩，出现竖毛反应与机体遇寒时生理反应相似。又NE可抑制乙酰胆碱（Ach）分泌，因二者在神经元内递质共存。人体小汗腺的支配神经属交感神经，节后纤维为胆碱能纤维，Ach对小汗腺有促进分泌作用。当Ach受抑制，汗腺分泌管鼻塞，故是“不汗出而恶寒”的伤寒症；若侵入人体病毒毒素量小，激活NE亦少，Ach可使皮肤、粘膜血管扩张，促使汗腺分泌增强，便是“汗出、恶风”的中风证。
见微知著，纵观《伤寒论》中若干条文均是构建在科学内容的数理逻辑基础之上，真乃“首尾相顾，鳞甲森然！”故可藉助专家系统，使用知识库、数据库及规定选用知识的策略与方式的控制推理程序，在临床辨证中模拟出伤寒专家的推理过程。
《伤寒论》系列软件医理设计的特点，首先在于获取知识即辨认特定疾病的传经结构。由于不同病原微生物毒素性质、致病力、入侵门户、特异性定位和受损害脏器之不同，出现不同的机体反应，可从微观辨证入手，归纳临床实验资料，确定其传经范围。制定症状、病名、汤证、中西药物和实验室检查等有关数据，作为静态数据的物理结构，存储于数据库中。
以“冬伤于寒”的急性呼吸道感染疾病（含伤感、支气管炎、肺炎等）为例，病程初起多为太阳病中风、伤寒之桂枝汤证、麻杏石甘汤证。病之轻者，仅止少阳，为柴胡桂枝汤证、小柴胡汤证、承气汤证。若体弱抗病能力低下则直中少阴，或为阳邪下陷、少阴热化之四逆散证；或为手足厥冷，少阴寒化之四逆汤证。若腹痛、下利、邪入太阴，则为理中丸证，桂枝人参汤证等证。经实验研究，太阳、少阳病阶段体液内环境尚无大变化。阳明经证为集体抗损害反应高热持续期；阳明腑实证为肠源性内毒素血症。太阴病属脱水、水和电解质代谢紊乱。少阴热化为温休克、心衰代偿期；少阴寒化为冷休克、心血管衰竭综合征。厥阴气分属中枢神经中毒性反应；厥阴血分属DIC等。故在病、证判定中可介入现代医学之实验室指标，对汤证进行量化、数据化，并采用中西药结构，西药入经，随经施治，如强心类药物】抗休克药用少阴病等。
在动态程度中算法结构使用非数值逻辑运行：
1. 逻辑相加，即逻辑“或”。
其运算法则是在命题中几个以上数据元素（自定义的）为真，则结果为真。如：
（1）桂枝汤证：①头痛②发热③汗出④恶风⑤脉缓，若≥4，则结果为真。
（2）麻黄汤证：①头痛②发热③身疼④腰痛⑤骨节疼痛⑥恶风或恶寒⑦无汗而喘，若≥5项，则结果为真。
2. 逻辑相乘，即逻辑“与”
（1）桂枝汤证：①头痛∧②发热∧③汗出∧④恶风∧⑤脉缓∧⑥发汗，遂漏不止。若出现遂漏亡阳，欲传少阴，则为桂枝加附子汤证，原桂枝汤证命题为假。
（2）麻黄汤证：①头痛②发热③身疼④腰痛⑤骨节疼痛⑥恶风或恶寒⑦无汗而喘⑧脉微细或脉沉。若出现脉沉发热，太少两感则为麻黄附子汤证，原麻黄汤证命题为假。
3. 逻辑否定，即逻辑“非”。
其运算法则是凡是出现某一特殊单项数据元素，取原逻辑值的负值，则命题被否定。即出现一项《伤寒论》六经分证中阳明腑实证、三阴证数据元素时，则逸出太阳病桂枝汤证、麻黄汤证等证范围。如：
⑴面色苍白⑵面色青紫⑶目直视⑷口唇青⑸舌质绛红⑹舌苔黄厚⑺微喘直视⑻息高⑼面垢⑽多眠睡⑾倦卧⑿四肢拘急⒀抽搐⒁循衣摸床⒂舌卷囊缩⒃谵语⒄郑声⒅汗出如珠⒆汗出而厥⒇烦躁(21)下利清谷(22)脉微细(23)脉细欲绝(24)脉不出(25)手足寒(26)手足厥冷(27)……
以上凡有一项数据元素出现，则原命题为假。
除使用逻辑运行外还采取加权求和，阈值运算和正向推理与回溯技术相结合的方法，力求体现《伤寒论》汤证诊断的正确性和可靠性，使之广泛推广应用成为可能
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