据支付圈获悉，日前国家税务总局下发国家税务总局公告2017年第11号文件，《国家税务总局关于进一步明确营改增有关征管问题的公告》中首次将银行卡交易清算市场参与机构的手续费的增值税发票问题进行明确阐述，随着国内清算组织的开发，与国内银行卡清算的量的逐年攀升，手续费分成是主要参与机构的盈利根本。特别是收单商户付出手续费的，很少有商户主动索要手续费发票，导致收单机构出现大量的无票收入，有的合规机构则按照无票收入统一报税，但是不乏部分机构恶意偷税漏税的情况，此次税务总局的文件明确了商户索要发票的开票主体，以及各机构间发票处理流程。
由于银行卡清算机构业务系统连接发卡机构和收单机构，掌握各成员机构的清算数据，此次《公告》中的开票方案采取的是以银行卡清算机构为枢纽的开票方式。
发卡机构、清算机构和收单机构提供银行卡跨机构资金清算服务，按照以下规定执行：
（一）发卡机构以其向收单机构收取的发卡行服务费为销售额，并按照此销售额向清算机构开具增值税发票。
（二）清算机构以其向发卡机构、收单机构收取的网络服务费为销售额，并按照发卡机构支付的网络服务费向发卡机构开具增值税发票，按照收单机构支付的网络服务费向收单机构开具增值税发票。
清算机构从发卡机构取得的增值税发票上记载的发卡行服务费，一并计入清算机构的销售额，并由清算机构按照此销售额向收单机构开具增值税发票。
（三）收单机构以其向商户收取的收单服务费为销售额，并按照此销售额向商户开具增值税发票。
发票开具流程如图（以刷信用卡1000元为例，商户结算手续费费率0.6%为例）：
此次开票方案，保证了增值税纳税链条的完整性，使产业各方税务关系清晰，解决了收单机构和商户发票需求的问题，既有利于银行卡产业的健康发展，也符合税法基本精神。
对商户侧，商户得到的是刷卡手续费全额发票，从流转税和所得税两方面降低了商户的税务负担，达到实质性减负的目的；
对收单侧，收单机构在向商户开具全额手续费发票后，可以从清算机构取得进项发票用于抵扣，降低税负，解决其开拓、服务中小商户的后顾之忧，一定程度上能够促进受理银行卡的积极性，有利于银行卡的推广使用；
对于银行卡清算机构侧，有利于增强产业四方模式下已形成和固化的业务关系，发挥银行卡清算机构在转接清算中掌握各方清算数据的优势，有利于清算数据的进一步应用。整体来看，增值税新规的出台，将进一步推动银行卡产业的健康发展。
说点其他的： 所有使用POS机，网络支付的机构都可以要求收单机构开具发票，因为商户交易手续费属于零散性质，需要收单机构和商户在受理协议中明确开票流程与周期。不过对于支付机构可能又是一把利润剪刀啊。
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