近期,河北科技大学副教授韩春雨提出的基因编辑系统NgAgo因多名研究人员表示无法重复备受质疑。事实上,在NgAgo之后,国内高校/机构在开发基编辑新工具方面连续取得了新进展。上个月,南京大学的研究小组在Genome Biology杂志上发表了一项突破性成果,开发了不再受到靶序列限制的结构导向性DNA编辑新技术[详细]。
10月10日,发表在Nature Methods上题为“Targeted AID-mediated mutagenesis (TAM) enables efficient genomic diversification in mammalian cells”的一项研究中,来自中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所的常兴研究组又开发出了一种编辑DNA碱基的新方法。
常兴博士(图片来源:健康科学研究所官网)
据健康科学研究所官网报道介绍,单核苷酸的多样性是遗传多样性的主要来源,是分子进化的动力和很多疾病的直接诱因。然而由于哺乳动物基因组的高度稳定性,在哺乳动物细胞内很难高效和高通量地诱导单核苷酸的突变,进而研究这些突变的功能。虽然通过CRISPR等基因编辑技术,可以实现较高效的DNA切割和基因敲除,但现有的CRISPR技术对于体内构建单核苷酸突变仍处于低效阶段。
有别于绝大多数体细胞基因组,适应性免疫系统在淋巴细胞发育过程中可以进行高效编辑,对抗原受体进行高效突变,产生近乎无限的抗原受体库,用以抵御可能的病原体入侵。受这一机制的启发,研究小组发现诱导抗体高频突变的胞嘧啶核苷脱氨酶(activation-induced cytidine deaminase,AID)与失活的dCas9融合后,实现了功能变异的高通量筛选。在sgRNAs的引导下,dCas9-AID-P182X (AIDx)可直接将胞嘧啶或鸟嘌呤转变为其它三种碱基,在预期位点产生一系列的变异。
dCas9-AID融合蛋白,被sgRNA招募到相应的基因组DNA上,随机诱导胞嘧啶和鸟嘌呤的点突变,从而实现体内特定DNA序列的多样化,通过遗传筛选,高通量分析单核苷酸突变的功能。
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(图片来源:健康科学研究所官网)
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