环状RNA在疾病中的作用机制研究

本节课讲解了环状RNA研究现状和文章解析，首先看一下历年的环状RNA 的基金情况。

课件下载，请点击阅读原文进入GCBI学院！

可以发现一些比较有意思的点

1、“环状RNA在参与高血压及其并发缺血性脑卒中机制的分子流行病学研究”，通过文献检索我们可以发现环状RNA在非肿瘤疾病中的研究并不多，

所以如果有兴趣的话，可以从一些非肿瘤的疾病中申请环状RNA相关的面上项目。

 

2、“肿瘤细胞外泌体中环状RNA的生成和转运调控机制研究”，目前外泌体的研究主要集中在miRNA中的研究，

而与环状RNA有关的研究确非常少，所以这个也是目前非常不错的切入点。

 

3、“肝细胞脂质代谢关键酶SCD基因基因形成的环状RNA在慢性乙型肝炎相关肝癌发生过程中的调控机制研究”，

涉及了脂肪代谢，环状RNA，炎症与肿瘤的关系，非常精巧的研究课题。

还有一些比较复杂的研究课题如：长链与环状非编码RNA共同调控MUC3A/5AC/13在肺癌发生发展中的作用机制。

目前来说，对于环状RNA相关的课题研究其实已经很多了，非肿瘤领域，包括与转录因子的结合以及中药相关的研究。

 

接下来王刚老师讲解了一篇cancer letters上的一篇文章，文章的大致思路如下：

首先

作者通过RNA测序的方法在胃癌标本中鉴定并筛选了发生上下调的circRNA，同时对环状RNA做了染色体定位分析，circPVT1差异倍数最大，位于PVT1基因内，

而PVT1这个基因的表达却并未受影响，PVT1基因本身既可以转录长链非编码RNA，又可以转录环状RNA， 同时发现circRNA与MYC基因邻近，此时猜测其可能通过调控MYC起作用。

用RNA酶及放线菌处理后，circRNA表达量未受影响，同时细胞学定位实验发现cirRNA位于细胞质中，这就提示它可能通过结合miRNA或者mRNA的稳定性起作用，如果circRNA在细胞核中，那么它可能结合转录因子起作用。

同时

同时在扩大临床样本量（187个胃癌标本）验证，发现circPVT1和PVT1基因在胃癌组织中均呈高表达，且与拷贝数变异呈正相关。

讲到这里，还是没理出个所以然来，而且有很多可继续进行的方向，那就把这个环状RNA干掉试试看吧！

所以作者紧接着做了环状RNA沉默实验，发现细胞增殖及克隆能力明显减弱，这个时候作者试着用预测软件，预测出了46个miRNA可能与这个环状RNA结合，合成小分子miRNA后，进行荧光素酶报告实验进一步筛选出了miRNA-125b和let-7b，因为PVT1是抑癌作用，

而let-7是促癌作用，所以这个时候就确定了唯一的候选miRNA-125b，同时确定了2个结合位点，进行位点突变实验后，发现miRNA-125b并不导致PVT1降解，只是可以吸收circPVT1，ERF2是miRNA-125b的靶基因，干扰circPVT1， ERF2的表达量明显下降，也就是说circPVT1结合miRNA-125b促进了ERF2的表达。

临床病理学资料中也表明circPVT1与肿瘤大小及分期有密切相关性。

临床标本检测及生存分析发现，circPVT1高表达预后更差，而circPVT1低表达预后较好。