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RNA中的典故——“围魏救赵”


作者:亢小玉

转载请注明:解螺旋·临床医生科研成长平台

这里有篇文章“TTBK2 circular RNA promotes glioma malignancy by regulating miR-217/HNF1β/ Derlin-1 pathway.”(回复170527可下载文献,一月有效由题目可知这是一篇circRNA作为mircoRNA sponge的文章,小编做了一张模式图。

这样你看清楚了吧,“围魏救赵”的主人公是齐国:circRNA-TTBK2,魏国则为miR-217,赵国则为:HNF1β和Derlin1。那就来看春秋战国时期他们是如何布阵厮杀的吧!

文章首先弄清楚在春秋战国时期的战乱纷纷的环境下,三个国家的经济水平和国家阶级实力,以及社会地位。

(1)在胶质瘤组织和细胞中,环状TTBK2而不是线性TTBK2的表达水平异常增高,而且环状TTBK2在胶质瘤细胞能够致癌。

(2)恰恰相反,MiR-217 在胶质瘤组织和细胞中的表达水平是下降的,而在胶质瘤细胞中呈现的是抑癌功能。

(3)HNF1β在胶质瘤组织和细胞中高表达(d),HNF1β 可以促进胶质瘤细胞的恶性增长而且可以与Derlin-1的启动子区结合(d1,d2)。

(4)Derlin-1在胶质瘤组织和细胞中高表达,可以促进胶质瘤细胞的浸润、迁移和增殖,而不是抑制凋亡。

当各国的经济实力和国家地位弄清楚之后,需要细细品味三个国家的关系。

 

MiR-217 与 circ-TTBK2



1.Starbase数据库分析两者的结合位点以及用荧光素酶报告基因实验验证

2.在胶质瘤细胞系中用RIP assay分析两者共在RISC复合物中

3.circ-TTBK2可以负调节miR-217 的表达,可以促进胶质瘤细胞的浸润、迁移和增殖

4.circ-TTBK2水平下降伴随着miR-217的表达水平增高,抑制了肿瘤的增长而且促敲除小鼠的存活

 

miR-217与HNF1β

1.HNF1β 是miR-217的下游靶基因

用生物信息学数据库预测miR217的下游靶基因非mRNA-HNF1β莫属,并且用荧光素酶报告基因技术验证。

2.观察在胶质瘤细胞系中两者的关系

3.过表达miR217之后, miR217通过与HNF1β的3,UTR区结合减少了HNF1β诱导的细胞增殖,迁移,浸润和凋亡。

 

circ-TTBK2与HNF1β

mRNA水平和蛋白水平观察circ-TTBK2与HNF1β之间的关系是正相关的。

当我们明白三国两两之间的关系之后,作为历史的后人,你会怎么评价三者的关系呢?

在这里作者又进一步用实验验证了三者的关系,并且盖棺定论了三者的关系。

circ-TTBK2与miR-217和HNF1β

HNF1β的mRNA水平和蛋白水平是增高的,当在胶质瘤细胞系中过表达circ-TTBK2而同时敲除miR-217之时。

circ-TTBK2与miR-217和HNF1β

三者的模式图

以上就是这篇文章的主要内容,加上小编的一步一步分解,你有没有从这场厮杀中学到什么呢,谢谢你的阅读。

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