NCBI数据库中搜索基因序列的私家套路三

作者：荷叶

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“荷叶师兄，教授让我研究新基因XXX的功能，我想问下…”

“小师妹，这个也是有套路的，首先你可以研究XXX在各器官、组织表达谱，其次……，你明白吧？”（师兄迫不及待的向小师妹传授经验之谈）

“哦！”（刚入科的小师妹好像明白怎么做了）

“你可以利用原核、真核表达系统将XXX表达出来研究其功能，再次……，你明白吧？”

“哦？”（小师妹感觉好多东西需要学）

“接下来你可以研究XXX的表达调控，……，你还可以……，你明白吧？师兄我硕士阶段就是这么做的。”

“哦？？”（小师妹感觉有点跟不上节奏）……

一个小时后师兄意犹未尽。

“师兄，我就是想问下在NCBI里如何快速、准确找到基因序列。”（小师妹弱弱的说了一句）

“Easy！”荷叶师兄又开始传授经验。

套路一

进入NCBI网站，在Nucleotide（核苷酸）数据库中搜索，以人CCL2为例。

套路二

进入NCBI网站，在CCDS（共识编码序列）数据库中搜索，https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/CCDS/CcdsBrowse.cgi

套路三（荷叶推荐）

进入NCBI网站，在Gene（基因）数据库中搜索。找到Tools工具的下拉菜单中Sequence Text View，点击就可以查到基因序列，并且网站以不同颜色标注CCL2基因的不同部分，灰色的UTR，红色的外显子，绿色的内含子，以及一一对应的编码区。