生物信息在线资源查找（一）

生命科学的许多在线资源在同行评审的论文中被大量发表，包括数据库和在线应用及数据分析软件。 这些资源在整个互联网和已出版的文献中散布，因而收集这些已发表的在线资源至关重要。 

OReFiL为一个在线资源检索系统。其能够抓取网址出现在BioMed Central开放获取期刊的摘要和全文论文中，并收集这些网址。其通过正则表达式和基于启发式知识的规则提取URL。然后对在线资源进行构建索引，以便研究人员对其进行检索和比较。因为每个在线资源至少有一个PubMed ID，所以我们可以通过医学主题标题（MeSH）术语轻松获取其摘要，并通过参考相应的PubMed条目来确认其可信度。此外，OReFiL能自动提取URL并能更新索引。总之OReFiL，一种免费提供的在线生命科学资源检索系统。该系统的独特功能包括能够返回在线资源对应的发表论文;使用任意词检索的能力，使用MeSH术语或作者姓名;通过检索BioMed Central，Scirus，HighWire Press或Google Scholar的链接到相应的PubMed条目或引用该URL的论文，轻松验证每个命中结果的准确性，并快速确认是否存在该在线资源的网址。

下面小编列出几点检索技巧：

1、查询可以是任何关键字。可以修改每个关键字以通过在其后面添加以下修饰符来指定上下文：

1）.tiab只检索标题和摘要（例如，RNAseq.tiab），

2）作者名称的.auth

3）MeSH术语的.mesh / .majr / .noexp。

2、可以使用＃1（RNAseq human）来表示多关键字，此处为RNAseq 和human；布尔值“AND”运算符功能可以使用#band来实现，如#band(cotton genome),检索既含有cotton也含有genome的工具。

下面以human genome为关键词检索

出现一个我们常用的数据库UCSC,同时这条检索信息点击 Show details ... 后还包含以下参考文献、网址等信息