Weblogo使用操作指南

WebLogo简介

今天小编给大家介绍一款可以将序列可视化的软件Weblogo，它是基于多序列比对，以图形的形式将保守区域展示出来，总高度表示此位置上的序列保守性，单个碱基代表出现的频率。

http://weblogo.berkeley.edu/logo.cgi。要是运行较大数据量时，建议使用本地化，不然就是后果自负（嘿嘿）。需要给它的输入文件与FASTA文件格式类似，可以直接将序列文件粘贴到框框中，也可以先将文件存储到本地，之后浏览上传本地文件。

Image Format & Size是参数主要是文件输出格式和图片大小。

Advanced Logo Options里边包括Sequence Type通常输入文件它会自动判断输入文件的类型，氨基酸或碱基两种。Logo Range可以选择你想要画出的区域；这里它会有一个小样品的校正功能建议勾上；Frequency Plot如果勾上就会将每个位点每个碱基的一个出现次数显示出来（高矮对应的出现多少），不会显示保守程度信息。

Advanced Image Options 里面调整的是高级图像设置，如Bitmap Resolution为做出图片的清晰度；Title标题等。

最后就是Colors调整，这个就看个人喜好。像小编这种对于颜色搭配上也是醉了的，通常选择默认了。

下图为小编截取测试数据做出来的图片。 

  

最后小编放上一个IUPAC碱基代码表，不清楚赶快来瞄一瞄啦。