2017年4月,约翰·霍普金斯大学的一名生物学家Michael Beer向期刊Scientific Reports(IF=4.259)投诉,他认为哈尔滨工业大学的学者剽窃了自己的成果。Beer于2014年发表论文《Enhanced regulatory sequenceprediction using gapped k-mer features》,介绍了一种能鉴定DNA调控序列的算法,名为gkm-SVM,哈工大学者于2016年发表论文《Recombination spot identification Based ongapped k-mers》,阐述了用来鉴定DNA重组热点的技术,命名为SVM-gkm,Beer认为后者剽窃了前者。
Beer认为,我们的文章于2014年先行发表,但2016年哈工大的文章表诉不正确:we... introduce a new feature called gapped k-mer” and “we present a newpredictor called (SVM-GKM)。这些都是不正确的表诉,他们声称建立了一种新方法SVM-GKM,与我们建立的GKM-SVM高度相似,并且用的是我们建的软件。哈工大的作者对我们的文章进行了复制黏贴,重新对方法进行了命名,并且用我们的软件在别的数据库运行。这篇文章不应该是“we present a new predictor called(SVM-GKM)”,而应该是“we applied gkm-SVM to recombination”。
两篇论文疑似剽窃处用飘黄标识
但杂志社经过调查,尽管哈工大的论文引用了Beer之前的工作,但论文作者在表述自己对算法的贡献时夸大了,他们应该更清晰地表述说,是在新的生物学问题上,应用了已有的方法论。论文中的不准确和歧义不应作为撤稿的依据,但我们会发布一个更正。因此并不认为这是一起剽窃事件,不会撤稿,但是会刊发一个更正说明,哈工大等人的论文未能正确引用Beer的工作。杂志社已要求作者对文章的一些表述错误进行了更正和致歉,将文章中一些会引起歧义的句子,主要是摘要的句子,进行了修订。例如,原句:“The k-mer feature is one of the most useful features formodeling the properties and function of DNA sequences.” 改成了“k-mer is one of the commonly used features for recombination spot identification.”,再例如着重强调了Beer的工作,加上了“recentlya new feature called gapped k-mer was proposed (Ghandi et al., PloS Computational Biology, 2014)”。(参考:Corrigendum: Recombination spotidentification Based on gapped k-mers)
但是这仍旧没有平息事件,这样结果仍令Beer非常不满,恰巧他是Scientific Reports的一名编委,于是他和其他20名约翰·霍普金斯大学的编委表示,如果还不采取措施(即撤稿),他们打算集体从Scientific Reports的编委中辞职。
这周一的早晨,Scientific Reports的主编Richard White对于此次“剽窃”事件再次进行了回复,他们认为没有充足的理由撤稿,因为这篇文章“做出了原始的贡献,使用现有的方法论并将之应用于一个新的问题,在这种情况下才使用了Michael Beer开发的方法并进行重新组合”。因此,杂志社不会撤稿。
听到这个消息,19名Scientific Reports杂志编委辞职,其中17位来自美国约翰·霍普金斯大学,以抗议此次的“剽窃”事件。
李莫愁博士:大多数小伙伴不会遇到“你剽窃了我的idea'这么坑爹的事情,大多数人(主要指医生或医学生)的日常是,这段我的抄的,那段我也是抄的,英文不是母语,不抄写不出来。在这个不合时宜的场合下,又要开始推销万事屋的英文查重服务了。我把珍藏的一个turnitin账号,贡献出来给大家查重吧,免费的。
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