生信入门,看到这四个字首先想到如下几个问题:
生信是什么?
你想入门生信吗?为什么?动力是什么?
你入门生信了吗?
当初是怎么入门生信的?
有入门生信的基础吗?
......
【末尾有彩蛋】
生物信息学(Bioinformatics):研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科(当然我们大多数人只涉及到分析和解释过程),也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学,计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。假如你目前的工作是基因克隆,PCR获得的序列需要与参考序列比对来确认你所扩序列的正确性,那么理论上你可以把两条序列放一起用肉眼来看,如果你不被晕的话,那么生物信息就是通过计算机编程的方式来解决这一问题。所以,简单的说生物信息就是用计算机的思维去解决生物学问题。生物信息从大讲包括:基因组,转录组,代谢组,蛋白组,表观等组学;
想,生信不需要或只需做少量实验;生信毕业好找工作;用到服务器,看起来显得高大上;确实是对计算机感兴趣........不想,“编程、整天对着电脑,我天生讨厌电脑”;看到那些代码就头疼;没基础现在起步太难啦;没人带;分子实验有现成技术,毕业风险小;喜欢分子实验........
生信的坑很多,涉及到的面也很广,学到哪些才算是入门了?这很难去定义,仁者见仁智者见智,但生信既然是一门学科,那就有基本的课程体系:基础的测序原理(数据来源),基本的文本处理能力,生信软件的使用(安装和报错处理),数据的解释能力......这是我理解的生信入门标准。
想起了当初的我自己,一把辛酸泪,没人带,没材料,没目标,当然也没有像现在这样好的条件(比如,生信技能树,生信菜鸟团这样专业的信息分享平台和背后强大的团队),以及那么多的技术分享博客,前人的总结对于新人的入门指导意义太大啦。
生信最主要是生物学和计算机的综合,相较而言,计算机比生物学难度稍大。这里的入门基础主要针对计算机基础。有,有计算机编程经验,学过C,python等编程语言。没有,纯生物毕业,早年的VB只有印象;
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