有了这个数据库，妈妈再也不用担心我的毕业！

科研难做在于没有Idea，关于找Idea我们已经介绍过“顺手和反手”系列的两个数据库：有了这个数据库，我反手就是一批课题！和有了这个数据库，我顺手又是一批课题！，今天我们开始介绍“不用担心毕业”系列，今天是妈妈篇，如果以后还有别的，我们还会出爸爸篇、爷爷篇、奶奶篇、姥爷篇、姥姥篇……等等，如果数据库够多的话，七大姑八大姨可能都会有，大家不要急，慢慢来。

下面我们要说的数据库是m6AVar：http://m6avar.renlab.org/

这个数据库师兄在RNA甲基化研究常用的数据库，我收藏了，你呢？一文中提到过，大家知道RNA甲基化很火（一个月发了十几篇10分以上的文章，这个方向的前景不可估量！），所以今天就来带大家设计一些RNA m6A甲基化修饰有关的课题。

我们先看看可以设计什么样的课题：

一共有6点，包括了SNP、剪切位点、RNA结合蛋白和miRNA，所有内容还是比较宽的，涉及到的RNA类型也很多：

不仅有编码基因，还有lincRNA、miRNA、piRNA等等，其中疾病的类型不限于肿瘤，虽然我们下面用肿瘤来举例子。

首先，我们直接下载数据，有两个选择dbSNP和TCGA：

以TCGA为例，我们可以下载LUAD（肺腺癌）的数据：

里面的信息包括了m6A甲基化的位置、基因名-转录本名-基因类型、样本信息、m6A的功能和SNP的信息。

这里我们可以做一个假设：RNA 的甲基化影响到了基因的可变剪接过程，导致RNA的表达异常，最终导致肺癌发病，我们就可以进行筛选了，把RBP_ID和Splice_Record这列的空白去掉，就有了一批项目了：

有2785条，我们挑个CCNB1基因在数据库里面看看，这个是GEPIA里面表达和预后的数据：

在m6AVar里面：

我们挑选倒数第二个看看有哪些蛋白结合：

有几个大家可能比较熟悉：EIF4A3、PTBP1、ELAVL1、 IGF2BP1等等，我们选一个PTBP1把课题初步定下来吧：

肺腺癌转移新机制：m6A甲基化异常影响PTBP1对CCNB1的可变剪接和表达调控

看起来是不是像那么回事？