有了这两个神器，挥手一堆papers

对于科研工作者而言，找到一个合适的idea异常重要，但是对于没有大把钱财来测序寻找idea的人来说，就必须要依靠一定的套路才能快速高效的发文章。今天，我就通过一篇文章给大家分析一下别人文章中的套路。

这篇文章于今年1月份发表在《Innate Immunity》杂志上(IF 2.3)，讲的是幽门螺杆菌通过miRNA-223来调控NLRP3的表达。

NLRP3是一类存在于细胞内的模式识别受体（PRR），当受到环境中一些危险信号的刺激（比如灰尘，紫外线，人体内的尿酸盐结晶以及能量物质ATP）；或者外界病原微生物的入侵（比如尼日利亚菌素Nigericin）时，NLRP3受体会感知这些信号并作出快速应答来清除这些入侵的病原。这些都不重要，重要的是作者看了很多文献，决定研究NLRP3和幽门螺旋杆菌。

这篇文章中，作者的思路很取巧，首先，作者以靶蛋白NLRP3作为基础，通过miRNA预测网站进行预测，发现靶向NLRP3的hsa-miR-223-3p。

随后，作者对hsa-miR-223-3p对NLRP3的调控进行验证，发现hsa-miR-223-3p的确可以靶向NLRP3；接下来，作者就探究在幽门螺杆菌入侵过程中，hsa-miR-223-3p的变化，发现幽门螺杆菌入侵后，诱导hsa-miR-223-3p的产生，后者通过与NLRP3的UTR区域结合，抑制NLRP3表达进而减弱NLRP3炎症小体的活化以及炎症因子IL-1β的产生 。

这篇文章集中于一点，miRNA靶向NLRP3蛋白，抑制后者的表达。那这个miRNA又是如何寻找的呢？在文章中，作者讲的很明白，通过两个数据库预测得到的，它们分别是miRDB和 TargetScan。

下面我给大家介绍一下这两个网站。

 MiRDB

首先进入miRDB， http://www.mirdb.org/

在gene target一栏输入需要查找的靶蛋白NLRP3，点击Go。

得到以上可能结合的13种miRNA，为了更强精确的选定一个miRNA，再进入另外一个数据库TargetScan。

TargetScan

进入TargetScan数据库，http://www.targetscan.org/vert_72/

在gene sumbol出输入NLRP3，随后点击Submit，获取可能的miRNA。

可以看到，只有一个相对保守的miRNA-hsa-miR-223-3p.

通过上述的讲述，你发现什么端倪了吗？其实套路不难，只要你确定需要研究的靶点，随后通过上述两个网站进行预测相应的miRNA，对这两者的关系进行验证就可以发表一篇相对不错的文章，还等什么，毕业触手可及了。

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