打开APP
userphoto
未登录

开通VIP,畅享免费电子书等14项超值服

开通VIP
TCGA现有数据汇总

今天看到一篇帖子,193种已发表植物基因组汇总,简简单单多余的东西一概没有。唤起了我很多最初的想法和感动,见贤思齐,把我整理过的东西也发一发。


截止2018年GDC的最新一次更新后,TCGA现存数据大致如下:



CNVFPKM/FPKM-UQmiRNA isoformclinical甲基化450K
Acute Myeloid Leukemia(TARGET-AML)急性髓系白血病285151105200140
Acute Myeloid Leukemia(TCGA-LAML)急性髓系白血病285151105200140
Adrenocortical Carcinoma(TCGA-ACC)肾上腺皮质癌18079809280
Bladder Urothelial Carcinoma(TCGA-BLCA)膀胱尿路上皮癌814433437412440
Brain Lower Grade Glioma(TCGA-LGG)脑低级别胶质瘤1019529530515534
Breast Invasive Carcinoma(TCGA-BRCA)乳腺浸润癌2223122212071097892
Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma(TCGA-CESC)宫颈鳞状细胞癌/宫颈腺癌586309312307312
Cholangiocarcinoma(TCGA-CHOL)胆管癌8545454545
Clear Cell Sarcoma of the Kidney(TARGET-CCSK)肾透明细胞肉瘤00010
Colon Adenocarcinoma(TCGA-COAD)结肠腺癌972521465459353
Esophageal Carcinoma(TCGA-ESCA)食管癌373173200185202
Foundation Medicine Adult Cancer Clinical Dataset (FM-AD)(FM-AD)基础医学成人癌症临床数据集000420
Glioblastoma Multiforme(TCGA-GBM)多形性胶质母细胞瘤11491745596155
Head and Neck Squamous Cell Carcinoma(TCGA-HNSC)头颈部鳞状细胞癌1083546569528580
High-Risk Wilms Tumor(TARGET-WT)高危肾母细胞瘤013213820
Kidney Chromophobe(TCGA-KICH)肾嫌色细胞癌132899111366
Kidney Renal Clear Cell Carcinoma(TCGA-KIRC)肾透明细胞癌1118611616537485
Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma(TCGA-KIRP)肾乳头状细胞癌608321326291321
Liver Hepatocellular Carcinoma(TCGA-LIHC)肝细胞癌768424425377430
Lung Adenocarcinoma(TCGA-LUAD)肺腺癌1147594567522507
Lung Squamous Cell Carcinoma(TCGA-LUSC)肺鳞癌1059551523504412
Lymphoid Neoplasm Diffuse Large B-cell Lymphoma(TCGA-DLBC)淋巴样肿瘤弥漫性大B细胞淋巴瘤9448474848
Mesothelioma(TCGA-MESO)间皮瘤17386878787
Neuroblastoma(TARGET-NBL)神经母细胞瘤0157020
Osteosarcoma(TARGET-OS)骨肉瘤00020
Ovarian Serous Cystadenocarcinoma(TCGA-OV)卵巢浆液性囊腺癌114637949958710
Pancreatic Adenocarcinoma(TCGA-PAAD)胰腺腺癌368182183185195
Pheochromocytoma and Paraganglioma(TCGA-PCPG)嗜铬细胞瘤和副神经节瘤363186187179187
Prostate Adenocarcinoma(TCGA-PRAD)前列腺腺癌1038551551500553
Rectum Adenocarcinoma(TCGA-READ)直肠腺癌317177165170106
Rhabdoid Tumor(TARGET-RT)横纹肌样瘤0550250
Sarcoma(TCGA-SARC)肉瘤522265263261269
Skin Cutaneous Melanoma(TCGA-SKCM)皮肤黑色素瘤939472452470475
Stomach Adenocarcinoma(TCGA-STAD)胃腺癌906407491443397
Testicular Germ Cell Tumors(TCGA-TGCT)睾丸生殖细胞肿瘤271156156134156
Thymoma(TCGA-THYM)胸腺瘤249121126124126
Thyroid Carcinoma(TCGA-THCA)甲状腺癌1025568573507571
Uterine Carcinosarcoma(TCGA-UCS)子宫癌肉瘤11056575757
Uterine Corpus Endometrial Carcinoma(TCGA-UCEC)子宫内膜癌1094587579548485
Uveal Melanoma(TCGA-UVM)葡萄膜黑色素瘤16080808080

红色为妇科癌症,文内表格可以直接贴回excel,TCGA这一计划已经接近尾声了,大文章也都被发的七七八八,需要挖掘的尽快挖掘,需要下载的赶紧下载。


本站仅提供存储服务,所有内容均由用户发布,如发现有害或侵权内容,请点击举报
打开APP,阅读全文并永久保存 查看更多类似文章
猜你喜欢
类似文章
【热】打开小程序,算一算2024你的财运
生信教程(一)实例展示如何使用TCGA数据库
TCGA各大癌症的somatic突变全景图鸟瞰(动态交互)
【96】2015版WHO肺部肿瘤组织学分类变化和争议
WHO|肺肿瘤分类目录2021版
中国心胸医学影像论坛
2020年第五版WHO阴道肿瘤肿瘤分类
更多类似文章 >>
生活服务
热点新闻
分享 收藏 导长图 关注 下载文章
绑定账号成功
后续可登录账号畅享VIP特权!
如果VIP功能使用有故障,
可点击这里联系客服!

联系客服