三、肠道微生物群
我们的肠道中含有约100万亿个微生物，统称肠道微生物群。没有两个人的肠道微生物群会完全相同，同卵双胞胎也不例外。
一般说来，正常子宫内是没有微生物的，所以认为胎儿是真正无微生物的个体。但是，当新生儿通过产道时，母亲体内的共生微生物，就会转移到婴儿身上，并开始繁殖。随着与父母、祖父母、兄弟姐妹、朋友，还有与床单、被子、宠物、玩具等的接触，婴儿体内的微生物会变得越来越多，到婴幼儿晚期，我们体内已经形成了地球上最复杂的微生物群落。
总之，肠道微生物群是遗传、饮食、环境和生活方式多方面因素综合的产物。
肠道内的微生物基本在无氧环境中生活，以群居方式生存，互相依存度很高。正常情况下，肠道微生物群之间也是共生关系，就是说都是利益一致的哥们。有非肠道微生物群的微生物（包括病原体）入侵，如数量不大，基本上就被有本土优势和数量压倒性优势的各种肠道微生物的十八般武器所扼杀或被群殴打压，最终命运不是死亡就是被赶走（即排出体外）。所以有人说肠道微生物群就是人体免疫系统的一部分。
肠道微生物生长繁殖的速率差别很大，从高度增殖到休眠的中间各阶段都有。人类认识比较多的微生物都是种群规模较大或生长繁殖比较活跃的，绝大多数肠道微生物我们一无所知或知之甚少。
1. 肠道微生物群的种群变化
1.1 肠道微生物群的种群变化的大趋势
肠道微生物种类繁多，它们大都有相对喜爱的食物，有的甚至对食物种类有严格要求。所以食物种类单一或很少，长期都会减少肠道微生物的多样性。我们平时强调食物种类多样化与其说是为了人体营养物质的多样化和均衡，还不如说是为了保持肠道微生物种类的多样性。
人体内的微生物群经过几百万年的演化，已变得高度适应人体，微生物群的演化的总体趋势是随着人类的饮食习惯和食材改变而变得种类逐渐减少。现在的食物变得越来越精细，越来越远离咀嚼，相信肠道微生物的种类只会越来越少。
1.2 随年龄变化的趋势
有证据表明，新生儿出生后几小时，肠道里就会出现大肠杆菌、双歧杆菌等，母亲的产道和奶头都是新生儿接触微生物的重要途径。以后随着呼吸、接触、爬模等途径接触多样的微生物种类，再大一些则通过吸吮手指、吃非食物等获得更多更丰富的微生物种类。
成年以后，随着年龄的增加、进食量的减少、活动范围的减少、活动场所的单一和生活习惯的固化，肠道微生物群的多样性会逐步减少。
1.3 疾病的影响
如牙齿本身或牙龈或牙周疾病导致牙齿脱落或被拔，又没及时补种或镶牙的，吃东西会受到许多限制。又如一些对饮食有严格限制（限量、限盐、限糖、限脂肪等）的疾病（如慢性胃炎、高血压、高血脂等）。
因病长期服用某些药物可能也是肠道微生物群多样性下降或比例失调的一个原因，大家可以从药品说明书中看到。可以引起肠道便秘、腹泻的药物还是很多的。究竟是哪些药物直接引起了便秘，哪些药物是先影响了肠道微生物群，后者的变化再引起便秘？这是以后才可能有的答案，现在暂且不论，但可以肯定的是：一部分药物性便秘肯定是通过影响肠道微生物群间接引起的。
1.4 抗生素的使用
有报道说，青霉素刚现世的那些年，一个青霉素就使人类的平均寿命提高了10岁。现在我们可以说，抗生素的使用使人类的平均寿命提高了不止10岁。
在我国，病人有整体浮躁的趋势，尤其是儿童家长，患儿只要有发热，就要到医院打抗生素。不少家长到医院，不是配合医生用药，而是要“指导”医生用药，不该用抗生素的用了抗生素，而且用最好的抗生素是许多家长的不二选择，医生们都知道不满足他们的要求多半会惹火烧身。
就算是细菌感染，要用抗生素，也不能一上来就是头孢三代、四代的，或是三代头孢加抑制β-内酰胺酶抑制剂的，这绝不是好的抗感染方案。不得不说这样用抗生素，效果通常都会很好，但这样做，同时会给一些肠道微生物造成灭顶之灾，肠道微生物群多样性减少和比例失调不可避免，而且失调后的肠道微生物群很难全面恢复，甚至终身不能恢复。换句话说，就是人们在用长远的健康和生活质量换取短时（甚至只是一两天）的近期疗效。
2. 肠道微生物群变化与疾病
病人的微生物群与健康人的有差别，可能有两个原因。
一是人体先出现某种疾病，然后导致微生物群结构发生变化。如口咽部感染性疾病是肯定可以引起肠道微生物群的结构和数量变化的，我们常是一牙痛或咽痛就会便秘就是最好的例证。
二是微生物群结构的变化引起人体的某些病理性变化乃至慢性疾病。
但是，微生物群变化与一些疾病之间的关系究竟哪些是“相关关系”，哪些是“因果关系”，在目前还没有明确答案。
近年来认为，一些肥胖、Ⅱ型糖尿病与肠道微生物群多样性下降和比例失调有关。
一些免疫系统疾病，比如炎症性肠病（如克罗恩氏病）、多发性硬化症也与肠道微生物群多样性下降和比例失调有关。
老年性痴呆、部分关节炎、甚至部分哮喘、牛皮癣等被认为同样与肠道微生物群多样性下降和比例失调有关。
还有，肠道微生物群多样性下降和比例失调有关还会影响人的心理。如认为与焦虑和抑郁有一定关联。如前面曾提到的东南大学姚红红教授的课题——肠道微生物群的恢复有助于抑郁症症状的改善。
此外，有报道说健康人血液中的细菌可能会协助引起中风及心脏病；甚至有报道说，改善肠道微生物群比例和增加肠道微生物群的多样性有助于缓解“渐冻症”的症状。
总之，研究肠道微生物群多样性下降和比例失调有关与人类部分疾病之间的关系是现在医学研究的热门领域之一。
肠道微生物群多样性下降或比例失调最常见的症状可能就是便秘了。
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