文章集锦

程序学习心得

• 生物信息之程序学习

• 如何优雅的提问

Linux 学习

• Linux学习-文件和目录

• Linux学习-文件操作

• Linux文件内容操作

• Linux学习-环境变量和可执行属性

• Linux学习 - 管道、标准输入输出

• Linux学习 - 命令运行监测和软件安装

• Linux学习-常见错误和快捷操作

• Linux学习-文件列太多，很难识别想要的信息在哪列；别焦急，看这里。

• Linux学习-文件排序和FASTA文件操作

• 用了Docker，妈妈再也不担心我的软件安装了 - 基础篇

• Linux服务器数据定期同步和备份方式

• 不用Linux也可以的强大文本处理方法

R统计和作图

• R语言学习 - 入门环境Rstudio

• R语言学习 - 入门环境Rstudio

• R语言学习 - 热图绘制 (heatmap)

• R语言学习 - 基础概念和矩阵操作

• R语言学习 - 热图简化

• R语言学习 - 热图美化

• R语言学习 - 线图绘制

• R语言学习 - 线图一步法

• R语言学习 - 箱线图（小提琴图、抖动图、区域散点图）

• R语言学习 - 箱线图一步法

• R语言学习 - 火山图

• R语言学习 - 富集分析泡泡图 （文末有彩蛋）

• R语言学习 - 散点图绘制

• 一文看懂PCA主成分分析

• 富集分析DotPlot，可以服

• R语言学习 - 韦恩图

• R语言学习 - 柱状图

NGS基础

• NGS基础 - FASTQ格式解释和质量评估

• NGS基础 - 高通量测序原理

• NGS基础 - 参考基因组和基因注释文件

• NGS基础 - GTF/GFF文件格式解读和转换

• 本地安装UCSC基因组浏览器

• 测序数据可视化 (一)

• 测序文章数据上传找哪里

• 39个转录组分析工具，120种组合评估(转录组分析工具哪家强-导读版)

• 39个转录组分析工具，120种组合评估(转录组分析工具大比拼 （完整翻译版）)

癌症数据库

• UCSC XENA - 集大成者(TCGA, ICGC)

• ICGC数据库使用

• TCGA数据库在线使用

Python学习

• Python学习极简教程 （一）

• Python学习教程（二）

• Python学习教程（三）

• Python学习教程 （四）

• Python学习教程（五）

• Python学习教程 （六）

• Pandas，让Python像R一样处理数据，但快

• Python解析psiBlast输出的JSON文件结果

NGS软件

• Rfam 12.0 本地使用 （最新版教程）

• 轻松绘制各种Venn图

• ETE构建、绘制进化树

• psRobot：植物小RNA分析系统

• 生信软件系列 - NCBI使用

Cytoscape网络图

• Cytoscape教程1

• Cytoscape之操作界面介绍

• 新出炉的Cytoscape视频教程

分子对接

• 来一场蛋白和小分子的风花雪月

• 不是原配也可以-对接非原生配体

• 简单可视化-送你一双发现美的眼睛

• 你需要知道的那些前奏

生信宝典之傻瓜式

• 生信宝典之傻瓜式 (一) 如何提取指定位置的基因组序列

• 生信宝典之傻瓜式 (二) 如何快速查找指定基因的调控网络

• 生信宝典之傻瓜式 (三) 我的基因在哪里发光 - 如何查找基因在发表研究中的表达

生信人写程序

• 生信人写程序1. Perl语言模板及配置

• 生信人写程序2. Editplus添加Perl, Shell, R, markdown模板和语法高亮

招聘

联系我们