兰是植物界进化最高极的物种，菌是生物界较低极原始的物种（这里说的菌，专指真菌，原属植物界，现已独立为菌物界，与植物、动物并列）他们都是陆地上最复杂最重要的主体生态系统—森林中的重要成员。在维系森林生态系统物种的多样性与稳定性方面起着重要作用。在森林生态系统漫长的历史演化过程中，兰与菌之间，以及兰和菌与其他生物种之间，建立起了多种复杂的生态关系（包括食物链关系），极积参与系统的物质循环与能量流动，从而也成就了自己的生存与发展，物种的延续与进化。
由于兰科植物具有重要的经济价值和观赏价值，人们将其请出森林，模拟自然生态环境条件，进行人工栽培，所谓来其自然生，还其自然养，引种驯化栽培取得了巨大的成功。特别是兰属植物大多数种，作为花卉栽培进入人们生活领域，生长发育环境发生了很大的变化，兰与原生环境中许多野生动植物种的生态关系虽消失了，但与兰关系密切的一些种如昆虫、菌物、微生物等随之进入养兰环境。其中兰与某些菌物种亘古以来所形成的微妙的生态关系被保持住了。这也是人类引种栽培兰花取得成功的关健因素之一。
兰与菌的关系主要有以下几种：伴生、寄生、共生。兰与一些腐生菌、蝇类幼虫、原虫、环节动物等伴生在兰盆基质中，营养方式各异，和平共处，有利无害或利大于害。如腐生菌以分解基质中的有机物为生，也为兰根提供营养来源。森林中的许多附生兰，主要靠腐生菌分解老死的木质纤维素为矿物质源，以完成自己的生长发育；兰菌寄生关系普遍存在于森林系统中，主要是一些致病性真菌如刺盘孢菌、棕疫霉菌、镰刀菌、狄巴利腐霉、立枯丝核菌、菌核菌、柱盘孢属菌等，也称为寄生菌。它们是兰的敌人，分别引发炭疽病、疫病、基腐病、腐烂病、根腐病、菌核病，黑斑病等兰病。它们的菌丝侵入兰花细胞内吸收营养，分泌毒素解析破坏植物组织，引起植株新陈代谢失调，甚至死亡。也有一种“反寄生”关系，密环菌菌丝与兰科植物天麻的块茎接触后，菌丝伸入块茎内作为营养源，不断被消化吸收，供块茎生长膨大，最终完成生活周期，而密环菌又腐生在其它植物上吸收营养，供自己及天麻生长；兰菌共生关系是朋友关系，主要以菌根的方式广泛存在于自然界，组成菌根的真菌称为菌根菌（共生真菌），其菌丝与兰的营养根形成一种联合体，菌根菌从兰根获得碳水化合物及其他营养物质，而兰也从菌根菌那里得到所需养料及水份，从而达到一种互惠互利、共生共荣的高度统一的联合关系。以上几种菌兰关系中，伴生关系因与兰的生活较间接，人们研究较少，本文略去不提。寄生关系在各种兰花病虫害防治书籍中讲得很透，故不再赘述。本文就兰与菌的共生关系作一些粗浅的介绍。
一、兰花菌根的形成及其生理功能
森林植被是兰科植物的原生地，兰菌共生形成的菌根普遍存在于森林土壤中。菌根中的共生菌大多数属于半知菌和担子菌。它们对兰科植物的生长影响很大。兰花的种子微小，似尘埃一般，本身贮存的养料很少，要供应种子萌芽并长成幼苗是不够的，而且需要较长时间。但由于森林中有共生菌的存在，真菌的菌丝很快能穿透那些发育较好的兰花种子的表皮，进入胚体细胞，在细胞腔内形成菌丝团，并不断消解释放出营养，供应胚芽及幼苗的顺利生长。人工驯化或栽培条件下的兰花不存在种子成苗阶段，主要以营养体分苗繁殖。但共生真菌与兰花根部接合形成菌根，对兰花生长发育非常重要。
1、菌根的形成及特点
无论下山兰还是家养兰，其兰根已共生有菌根真菌，根表附着菌丝及孢子，如果带有原生土，土中菌丝及孢子就更多一些。兰花菌根真菌是内生菌，当新根发出伸长时，表面分泌一些有机物质，它们刺激吸引老菌根根际附近土壤的菌丝及孢子萌发芽管（芽管再长成菌丝）并向新根表面伸长，另外菌丝在根际附近具有趋根性。菌丝与根接触以后，能穿过根皮进入皮层细胞，在细胞腔内形成胞内菌丝，胞内菌丝还可从一个细胞传到另一个细胞。胞内菌丝常呈节状或圈状，统称菌丝团。菌丝不侵染兰根生长锥（水晶头），使兰根保持旺盛的生长能力。根表面菌丝比较稀疏，主要起吸收水分、矿物质及产生分生孢子的作用。菌根表面看不出什么变化，显微镜下能看到根外菌丝，菌丝有横隔，皮层细胞内有菌丝团，这是兰与菌进行营养交换的地方。
