经典毒株VR2332非常经典
2005年4月，作为全球第一个蓝耳病疫苗产品，勃林格蓝耳病弱毒疫苗正式进入中国市场，成为当时国内市场上第一个具有正式批文的蓝耳病疫苗。该疫苗是以Collins等1992年在美国分离美洲型经典毒株ATCC VR-2332为疫苗种毒株。
国外学者对该疫苗的免疫效果作了较为详尽的研究，结果发现该疫苗接种妊娠母猪后，流产率和断奶前仔猪死亡率下降，活仔数上升，且未检测到其向环境排毒；该疫苗免疫公猪后，发现其能明显地减少同源或异源强毒感染所引起的病毒血症，且在精液中检测不到排毒。
国内学者也对该疫苗的免疫效果作了评价，发现免疫该疫苗后猪只能够较早的产生抗体，且通过攻毒保护实验发现其保护率达到63.6%，表明该疫苗的免疫保护效果较好。
Ch-1R株保护率较高
猪繁殖与呼吸综合征活疫苗（Ch-1R株）是由中国农业科学院哈尔滨兽医研究所研制而成，已于2007年获得新兽药注册证书。
该活疫苗是在 Marc-145细胞上反复低温传代驯化而成，每头份疫苗含有猪繁殖与呼吸综合征病毒量应≥105.0TCID50，其安全性和免疫原性皆很好。试验证明，该疫苗免疫保护率为96.1%，高于国外同类疫苗（80～87%），对高致病性蓝耳病的保护率高于78%。
通过对高致病性 PRRSV变异株与疫苗株的序列分析发现，高致病性 PRRSV变异处均位于同一个相对独立的分支中，与 CH-1a株亲缘关系较近，与国外疫苗株 VR2332亲缘关系较远。经多次实验表明，CH-1R株疫苗对变异株有明显的保护作用，就目前而言，它是保护率相对较高的疫苗。
R98株：天然弱毒，安全可靠
南京农业大学和瑞普保定生物药业有限公司利用自行分离的PRRSV弱毒株R98研制而成，通过累计80代细胞连续传代和猪体连续回归，毒力不返强，基因序列未见变异，免疫猪只后无不良临床反应，仔猪的发病率降到18.3%以下，成活率达到90%以上，能够较好的预防控制PRRSV提高猪群生产性能。
R98株是自然弱毒株，分离自蓝耳抗体阳性而临床健康的猪群，为美洲型自然弱毒株，高度安全稳定。另外，R98株与美洲型经典毒株VR2332株同源性高达99.5%以上，对普通蓝耳临床保护95.4%以上，对高致病性猪蓝耳病保护率为80%以上。这个毒株的问题就在于和VR2332的同源性太高，存在的意义有争议。
目前经典株蓝耳疫苗在国内规模化猪场的使用较多，种猪群以使用经典毒株为主，主要是进口疫苗（VR2332）和R98株疫苗，肉猪群使用Ch-1R株或R98株疫苗。
JXA1-R株、HuN4-F112株和TJM-F92株3种高致病性猪蓝耳活疫苗比较
目前国内政府采购苗以JXA1-R株为主。2008年中国动物疫病预防控制中心田克恭研究员等成功研制了高致病性PRRSV的JXA1-R株活疫苗彻底打破了中国高致病性PRRS的防控局面。这种活疫苗对不同类型的PRRS综合征均有较好的免疫效果，免疫期可达4个月。目前国内政府采购苗也以此毒株为主。
HuN4-F112弱毒苗是由田志军等研究人员将本研究室分离获得的高致病性PRRSV毒株HuN4在Marc-145细胞上进行连续性传代致弱研制而成，通过动物攻毒保护试验证明该疫苗免疫仔猪后能够迅速产生抗体保护仔猪抵御高致病性PRRSV的感染，并且能有效缓解PRRSV所导致的各种临床症状。
TJM-F92弱毒株是由中国农业科学院特产研究所武华研究室在高致病性 PRRSV的传代时分离出一株自然基因缺失株。
相对于其他两种，TJM-F92 株疫苗有以下优势：
TJM-F92疫苗株缺失了Nsp2基因上360核苷酸，缺失的这段基因是免疫抑制相关基因，使病毒致病力下降，同时宿主对病毒的免疫力提升，是目前国内和国际上最安全的蓝耳病活疫苗；
由于免疫抑制相关基因缺失，TJM-F92株疫苗没有免疫干扰性，可以和猪瘟等其他疫苗同时使用，克服了传统蓝耳弱毒苗在使用时对猪瘟等疫苗的干扰；
可以利用TJM-F92疫苗株这一基因的缺失鉴别自然感染毒与疫苗毒，为该病的净化提供了可能。
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