文章来源于:sci666
前言
论一个气场合适的导师的重要性。
想起一个微信朋友前截图
演示招式
其实有时候,导师经常把他认为最重要的point挂在嘴边,我们可能没有认真体会过。之所以不停的提醒,那是因为他的火眼金睛看出来,我们还没领悟到。
我第一次见到导师时,他给了我一个写mini proposal的机会,让我感动的是,他不仅不断的为我考虑mini proposal的选题,还不断的透露他的想法,帮助我找到proposal的方向。当他问我有没有准备proposal(当时可能听差了,以为老师想问我是否现在有准备好proposal给他看)我说没有,然后他以为我从未写过proposal,所以他直接站起来走到白板前,一边给我解释proposal框架应该包含什么内容,每个内容的要点,并一边写下了这几个单词。
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训练上手
可是写proposal和看文献有什么关系啊??我想,写故事和看故事的思路是一样的,写的人要写的清楚,那么看的人也要尽量把作者的意图给看出来。首先把框架列出来,然后文献搬出来,按照框架去看文献,不仅可以对整个故事有大概的把握,而且可以治过目即忘的看文献不良反应。
(1)background(2)gaps(3)hypothesis(4)aims(5)approaches(6)major results(7)remaing questions
Nat Med.2018 Jul;24(7):939-946. https://doi.org/10.1038/s41591-018-0050-6
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首先将文章标题+作者+杂志等基本信息列上。只看标题就已经知道这篇文章要讲什么了:p53抑制CRISPR-Cas9在人多能干细胞中的编辑作用。
但不管怎么样,按照我们的结构走:
(1) Background and gaps:
CRISPR/Cas9 are powerful tools for us to engineer genomes of human cells. However, it is relatively difficult to engineer human pluripotent cells (hPSCs). The mechanism is still unclear.
CRISPR/Cas9的出现极大的增强了人类在基因编辑上的能力,但相对于鼠和人肿瘤细胞系,CRISPR/Cas9在人多能干细胞(human pluripotent cells, hPSCs)上的编辑仍然较为艰难,具体原因不详。
(2) Hypothesis and aims
The double-strand breaks (DSBs) caused by Cas9 will arouse toxicity and kill hPSCs.
Aim: to investigate the reasons of the high toxicity of CRISPR-Cas9 editing in hPSCs.
假设是由于Cas9引起的DNA切口造成了细胞毒性,目的旨在研究CRISPR-Cas9在人多能干细胞中高毒性的原因。
(3) Major approaches
Third-generation doxycycline (dox) inducible CRISPR-Cas9 system (henceforth iCas9);
Dox-inducible enhanced Cas9 (ieCas9)
构建了Dox(多西环素)依赖的CRISPR-Cas9诱导性敲除细胞(往下叫iCas9),同时构建了增强版的iCas9,叫ieCas9.
CRISPR-Cas9:耳熟能详,就一编辑基因的工具
sgRNA:single guide RNA,帮助CRISPR-Cas9识别靶点的小帮手
DSBs:DNA双链断裂
p53:大名鼎鼎的tumor suppress protein,在细胞中维持基因稳定性,当识别到有基因错出错时,会因为细胞走向凋亡程序,排除异己,从而维持基因的稳定性。
HDR:同源修复,就是DNA被打断啦,最后又接上了的故事。
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先设头和尾,再去补中间。不管是什么课题,都是基于临床上、现实中的问题和现象来设定。所以首先要看到现象,其次通过现象,把头找出来。
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总结
因为CRISPR-Cas9在人多能细胞中基因编辑具有一定难度,且Cas9处理过后,细胞往往会死掉,这个现象引起作者的关注。
这么一路看下来,不仅文章结构清晰,框架完整,故事性更强,且更容易记住,导师再也不用担心我文献看完就忘了呢!
可是这个故事看起来很简单哦,p53基因稳定卫士的作用人人皆知啊,p53诱导DNA损伤细胞走向凋亡也是肯定的呀,那为啥还可以发nature medicine?
其实这是focus在CRISPR-Cas9的不良反应上,试想如果一个病人有p53缺失,那么对这样的病人进行CRISPR-Cas9治疗是有风险的,p53的缺失可能会引导细胞走向癌变。那么在p53缺失的病人身上想要再加以CRISPR-Cas9治疗,则需要慎之又慎了,这是一篇具有临床意义的文章。
后记
作为一个喜欢分享的小伙伴,也为了证明我不是自吹自擂,将该种文献阅读方法告知某一师妹后,她的回复让我看到了喜人的效果。
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再附上一则师妹的笔记(已经获得准许)
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有时候有人跟我说,你很善良,你很热心,现在没有人这么愿意给别人付出了。我想,可能是因为我在一路上得到过很多人的帮助,所以我认为当我可以出力的时候去出力也是非常正常的事情,而且我常常在跟别人屁颠屁颠分享的时候,收获到了许多我想不到的知识,我愿意贡献自己一点点微薄的力量,如果能给别人一点点的启发,那我将会觉得很幸福。
End
作者:冻春卷
来源:简书
排版:小丸子
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