基因与蛋白质的不对称关系，就是基因决定蛋白质，但基因不完全等于一个蛋白质，例如在真核生物基因组中，一个基因常常包含有多个外显子与内含子，内含子在转录翻译后不表达，但在转录翻译过程中，多个分立的外显子可在内含子被切除后随机组合和表达，这样就会出现多个不同的蛋白质，这即是基因与蛋白质的不对称关系。