基于现代安全科学的理论，结合企业安全生产工程技术的实践，对本质安全定律的应用存在有三种层面的应用方式：一是早期的“设备本质安全”应用；二是基于系统思想的“系统本质安全”应用；三是面向组织或企业全面安全管控的“企业本质安全”应用。显然，本质安全的范畴、视野、格局不断扩展，这是安全规律及安全理论发展，以及安全工程实践进步的必然。
从国家战略、策略角度，我国大系统本质安全还没有成为国家高层级策略（如：安全标准化、安全双重预防机制、安全文化建设等），但是在2020年国务院安委会《全国安全生产专项整治三年行动计划》（2020）3号文中，其主要任务中明确提出了：“全面提升本质安全水平”要求（突破性、标志性）。表明，大系统本质安全思想将逐步得到深入和普及。在安全生产领域，本质安全定律的应用可以从如下方面入手： 1.设备或技术系统的本质安全应用
早期，由于事故致因理论和安全科学原理发展的有限，对本质安全的认知是局限的，其概念仅仅是指从技术根源上消除或减少危险。即：通过对技术或设备的本质安全设计，消除和减轻技术系统本身的固有危险性，从而提高设备、工艺的安全可靠性，在技术因素层面保障安全，减少由于技术致因导致事故发生的可能性。显然，早期的本质安全思想推进了人类安全科学和工程实践的进步，对提高安全科学技术水平发挥了重要的作用。但随着对事故致因规律研究的不断深入，人们发现导致事故发生的因素不仅仅是技术因素，甚至现实和宏观层面主要还不是技术因素，人的因素、环境因素（技术的外在条件），甚或管理因素成为各行业、各类事故的主因。因而，系统安全的思想和安全系统理论应运而生。随之，本质安全的理论与实践得到了丰富和发展，本质安全的含义得到了深化和扩展。
2.生产系统或企业本质安全的工程应用
从企业“大安全系统”出发，本质安全就是通过追求组织生产过程中人、物、系统、制度（管理）等诸多要素的安全可靠和谐统一，使各种事故风险因素始终处于受控制状态，进而逐步趋近本质型、预防型、恒久型安全目标的系统或体系。企业进行本质安全体系的构建，其基本目标就是不断提升企业预防型的安全保障水平，使其从根源和本质上具备预防事故发生的能力，实现本质化安全生产（设备设施、工艺过程、作业岗位、人员操作、组织管理等）。本质安全型企业的创建，追求生产系统过程的本质安全，实现全面的安全最大化，事故风险最小化；本质安全型企业要求从“大系统、全要素”的角度构建安全生产保障体系。“大系统”就是指企业安全生产保障体系的“技术、管理、文化”大策略和大机制；“全要素”就是指安全系统的“人因、物因、环境因素、管理因素”全面的安全要素本质安全化，即：人员的本质安全化、设备的本质安全化、环境的本质安全化、管理的本质安全化。通过本质安全型企业的创建，实现企业生产过程的人员无三违、无差错，设备无隐患、无故障，环境无危害、无缺陷，管理无缺项、无宽容。
本质安全型企业的创建就是运用先进的系统思想和科学的治理模式，使企业生产系统涉及的人员、技术、环境和管理达到根本性安全，从而使各类事故发生概率降到最小程度，最终实现企业零事故目标。本质安全型企业创建的系统工程中，“人本”靠文化，“物本”、“环本”靠科技，“管本”靠体系。创建本质安全型企业需要从如下维度入手：
1) 人员的本质安全化。人的本质安全化主要是通过安全文化建设，强化决策层的安全领导力，提高管理层的安全管制力，提升执行层的安全执行力，培塑企业全员“本质安全型人”。“本质安全型人”的标准是：想安全、要安全、学安全、会安全、能安全、成安全。即具有自主能动的安全理念，具备充分有效的安全能力，具有自觉、自主、能动、团队特质的生产企业领导者、管理者和作业人员。人的本质安全相对于物、系统、制度等三方面的本质安全而言，具有先决性、引导性、基础性地位。人的本质安全是一个可以不断趋近的目标，人的本质安全既是过程中的目标，也是诸多目标构成的过程。
2) 技术的本质安全化。就是通过设计、制造、检验、施工、安装、监测等科技手段和工程措施，使技术系统的全生命周期的功能安全、固有安全性能最大化，使生产系统在任何时候、任何场所、任何过程、任何环节，其“物态”始终处在安全运行的状态，即：设备达标，无危险、无故障；原料保质，无失效、无危害；工具良好，无缺陷、无风险。相对非本质安全，技术的本质安全化优势及特点在于：变被动技术为主动技术、变数据技术为信息技术、变冗余技术为容错技术、变危险报警为风险预警、变故障检测为健康监测、变事故预警为事故预控，变能级控制为失效监控、变人工测控为自动测控、变单元模式为系统模式。技术的本质安全为人-机-环系统的安全协调提供“物本”的基础和条件。
3) 环境的本质安全化。环境本质安全包括空间与时间、自然与人工、物理与化学等环境因素的本质安全。环境本质安全化就是通过附加的安全监测、安全防护、安全警示等环境和技术外在条件，建立安全防护设施齐全、安全监测监控有效，人-境系统和谐，并具自愈能力的安全生产环境条件。空间环境的本质安全要求企业生产区域、平面布置、安全距离、道路设施等环境条件符合安全规范及标准；时间本质安全要求基于人体工程学的作业时间设计科学合理、设备的运行时态达标符合；物理化学环境因素的本质安全，就要以科学的标准为据，实现采光、通风、温湿、噪声、粉尘及有害物质控制达标，实现劳动者的生命安全、健康保障、身心舒适、作业高效。
4) 管理的本质安全化。通过安全标准体系、制度体系的全面、科学建立，实施合理、系统、超前、动态、闭环的本质预防型安全管控模式，并能够长期有效运行，持续改进提升，有效控制事故的发生。能够改变传统的非本质安全管理方式，即：变经验管理为科学管理、变结果管理为过程管理、变事后追责为事前管控、变静态管理为动态管理、变成本管理为价值管理、变效率管理为效益管理、变因素管理为系统管理、变管理的对象为管理的动力、变约束管制为激励管理、变人治管理为法制管理。本质安全管理做到管控的超前预防、系统全面、科学合理、能动有效，使自律、自责、自我规管理成为普遍和自然，最终实现安全管理的零缺项、零宽容、零追责。
