[转帖]我在美国的科研感受--我又回来啦!【5月份写过一个贴,58天check经历,灵隐寺真灵】
2个月前,本人到达美国。
回想被check长达近2个月的感受,至今仍感受多多。
我还是怀念小木虫的,她让我成长啊。
下文是上个月写的,从自己QQ空间转来这次,希望与大家分享!
美国的科研感受
-----我的钱是全额有美国老板支助的,所以我的工作必然会和那些拿着国家的钱出去CSC的朋友不太一样。因为我拿了美国老板的钱,所以我就没借口游山玩水了。
也许我的经历不适用于CSC的朋友!
现在是美国东部时间21:29分,我还在实验室,
距离我早晨来上班,已经过去了整整12个小时,
之前写过2篇关于生活感受的日志,
此刻有那么一点点小累,就当休息吧,与各位分享一下这边的科学研究的感受。
背景信息:
我所在的地方是Wake Forest University , Baptist medical center.
字面意思是维克森林大学的医学中心。
这个大学,USNEWS全美综合大学排名在24-27位应该算是顶尖大学!
该大学的全校学生只有7000人,这么个小学校,能排位如此靠前,可见科研实力有多强?这个Baptist是教会的意思 。
此医学中心,是医学院和附属医院的综合体,过去2年位列全美最好的40所医院之一,保守估计 年收益25亿美金。整个医院
有各类员工13000多.
这个医学中心分布在这里多个街道,一大片楼。楼和楼之间有免费巴士,5分钟之内必定到达。医院内设施极其现代化,十分干净,各种配套服务设施应有尽有。上班下班每天看直升机降落在对面停车场顶上,运送病人 !
我所在 部门是一个生物信息和系统生物学实验室。
我的老板是个中国人,他非常卓越,因为40多岁就是终身教授,这种顶尖的中国人在美国是屈指可数的。
老板的项目很多,财力雄厚。实验室有20多个人,80%是博士后,从中国的北大,清华等招募过来,也有海外的。
这么大的团队在美国不多,据我师兄说,美国老板一般能有10个人团队就很了不起了。
目前实验室分成2个大团队:computational biology和experimental biology。这么做十分必要,那就是我们通过数学和计算所
分析的结果要在实验环境下得到验证,才能说明我们的分析结果或推理方法是合理的。
工作时间:
每天,导师要求至少工作8小时,中午吃饭1个小时。
而实际上,大部分人都是早晨9:00到,自己带饭,晚上19:00以后走的。
而导师呢,早晨7:50到达实验室,中午至少13:30吃饭,晚上20:30分左右饿着肚子回家。
我现在还是新人,所以必须刻苦一点,一般我09:00--22:00是我的工作时间,中间去掉1个小时的吃饭时间。
有人问,这么长时间工作,不累吗?
这个问题问的好,从两方面回答:
(1)我天生睡眠时间比别人短,可以说是精力比较充沛。
(2)我工作时间感觉不怎么累,因为要全身心投入。
在这里,科研氛围很好,人就会被激发出一种动力。
科研模式:【绝对重点片段】
在这里,导师会给每个同学分配一个任务,我们叫project。
导师的原则是:这个任务必须是生物,或者医学领域里一个重要的,新颖的,有意义问题。
他绝对不会把一个过时的东西交给学生来做,没有意思。更加不会为了让我们论文而论文【和国内区别很大】。
所以,导师每天都会跟医生和生物学家交流,发现一些暂时未被人研究或者还有很好研究空间的主题。
每个同学在任务上基本是没有交集的,于是在具体的问题上,你是无法求助队友的。
所以。一切都要自己摸索,自己想办法找资料。
我们目前主要会集中在癌症数据分析,以及一些疑难病症的分析,试图通过数学和计算机的手段揭示复杂疾病的一部分发病机理。
科研讨论或交流:
这个环节非常重要,
队友之间交流的都是一些一般性的主题,或者共享很多有用的资料。
最主要的交流,是和导师面对面。
每个队友每周要向导师汇报2次你的进展,每次30分钟,叫做1-1 regular meeting。
这种1-1汇报,是要英文汇报的,在他办公室汇报你过去2天的进展,一般是周一和周四。
这种汇报频率算高的了,2天就要讲一次,这就要求 非常快速高效地进行科学研究。
从照资料,到做无数次尝试,处理结果,整理,每2天就要让导师看到你有推进,
所以学每一个陌生的东西都必须在极短的时间内解决。这里容不得任何拖沓。
刚开始的几周,我几乎每次汇报都要被导师狠狠指责,
说我进展慢,或思路不对。这种压力不是一般人可以承受的,
心理始终有一种恐慌,。。
每次汇报结束,导师会指出你的问题,改进的地方,吩咐一些指令,
2天后必须再次看到修改后的结果。。。
除此之外,每周的星期二,有个大的研讨会。、
会选出1-2位同学来做大报告,需要PPT,在一个非常正式的会议室。
我一共做过2次这样的报告,当着10几个同学,用全英文,汇报自己的学术进展。
在汇报过程中会面对同学们提 出的各种疑难问题,要一一解释。
在这种压力下工作,人会觉得累,会有怨言,但一段时间之后的确发现自己进步很快。
在这里,每个人都很拼命,用导师的话来说,就是人的能量发挥到了极限。
像他这样的中国人导师,会比美国导师更push,因为竞争的压力太大。
我们三天两头都会听到昔日很牛的某某教授的实验室关门了,只要一段时间拿不到项目,就养不活手下的研究人员,
实验室就要关闭,
所以,导师们那么忘我地工作,同时又要push底下人迅速地出成果。
计算和仿真模式【写给学CS的同学】
在美国,人们很少会在windows系统下运行大的程序,一般都要linux。
我们CS的同学,如果在国内是做算法的,应该喜欢用matlab做仿真,
但是matlab的正版很贵,于是这边完全不是主流。
我在做生物信息学的数据分析时,一直依赖matlab。
来了这里后,迅速学会了R, 才发现matlab在bioinformatics方面的计算能力和资源实在太差 。
我们实验室的所有的大规模复杂计算,全部是提交到远在DZ的超级计算机,
所以要学会在liunux下工作,把本地程序用R调试好之后,连同数据一起提交到远程服务器,由server来算题。
因此,来到这里后,要用全新的方式去做数值计算。