在清代，气学主流失去昔日光辉，而无声息，唯道家内丹派有些许可言者，医家则更是少得可怜，而诸儒谈气则恰好窒息了气学的生气。
清代内丹派名家不少，成绩多在工夫论层面，在气学有贡献者却较少，刘一明论述了精气神的一、三辨证关系(《仙术秘库 · 抱混元仙术》亦载此文)：
混元者何？先天之精气神也。白紫清云；其精不是交感精，乃是玉皇 · 口中涎；其气即非呼吸气，乃知却是太素烟；其神即非思虑神，可与元始相比肩。是即所谓元精元气元神也。夫以精气神而曰元，是本来之物。人未有此身，先有此物。既有此物，而后无形生形，，无质生质，乃从父母未交媾之时而来者也。方交媾之时，父精未施，母血未包，情合意授，其中杳冥有物，隔碍潜通，混而为一，氤氲不散。既而精泄血受，精血相融，包此一点之真，变化成形，已有精气神寓于形内。名虽有三，其实则一。
一者，混元之义；三者。分灵之谓。一是体，三是用。益混元之体，纯一不杂为精，融通血脉为气，虚灵活动为神。三而一，一而三，所谓上药三品者。用也。所谓其足圃成者，体也，不得专言三亦不得专言一。学道之士不知三即是一，一即是三，或抱元守一而落于着空，或炼药三品而失于执相。着空执相皆非还元之妙理也。夫还元者，所以还其元精、元气、元神也。若欲修道，必须先知此三物潜藏于混元之中，离乎混元即非先天精气神之本体，失其本体，焉得元物？
闵小艮提出了修炼内气与外气相合以“医世”的观点。对“医世”之理，他作了如下阐述：
人天禀地之气，故通天地之气，而能达天地之气，人气为天地二气之枢纽。性命之功未圆则气不灵，性命之功既圆，而四大已空，则无所依据以有为。故天仙亦让其权于人，此人所以为三才之一也。
其缺惟何？虚我色相，一我气神，卵而守之，久则内外无间，神完气足而精化。此身之神气既旺，则所事得实，必无不济而中止之虞。又久之，乃一丝不挂，身世两忘，归于太无，功竣一敛，全复太初，而缩斯身斯世于祖窍之中，悠然住手。斯时也，身世两益，嗣则相力加进，自成计验计程。
盖元与一，是一非一，是二非二。离气而言曰真一，合气而言曰真元。天心之气曰真元，真元之宰曰真一，真一即天心，天心无形，赋于人而有形，即真一也。真元有气，藉心迎一，藉一敕元。天以真一真元铸有形，吾以真一真元培有形，令各安泰，是曰医世，是性命之学，有为而无为者。而对“医世”的作用机制，则有混化之说：
何为混化，继何加以混忘乎？曰混化之义，犹以晶瓶，承照日下也。究其入手，乃由假始。假法为何？存此身世，等同晶若也。诚而行之，初戒期效，毋住见闻。法惟浑此身世于虚寂之中耳。在汝入手，须先明彻其义，方不堕入幻妄，何可平草?体会明彻，乃可行焉。我为言之，其义惟何？有形之实，不是真实；可见之虚。不是真虛。故而古哲有言，真实之虛，金玉得之故坚；真实之实，虛空得之故溥。我今更以两造言之，苍苍之天，乃合地成者，然而不可不谓天也快然之地，乃承天禹结戚者，然而不可不谓之地也。学由是义，以行混照，念自无得而著，心自得而不贰焉。如是体行，实虚必自熔一，功到镓一，已造化境。以无分别，故名曰浑。而必继以浑忘者。并此存浑体用而悉释之，乃得深造自然地位
耳。学造自然，水无流弊，古哲所谓百尺芋头更进一层是也。
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