这才是“信息时代”科研的高级玩法。
我们知道,人类历史经历了“农业时代”、“工业时代”和现在的“信息时代”,科研也是如此。
最早的科研只是一些学者的独立研究,这些学者如一个个点散布在全世界,这是科研的“农业时代”;
接下来,大学为科学家们组织学会、实验室,就像是农民进入工厂的“工业时代”;
而现在,大家能够通过互联网联接在一起,突破地域的限制,通力合作,每个人都完成自己最擅长的部分。这种改变,可以说是科研的“信息时代”
只是3个月就从零开始发一篇SCI,第一反应,吹牛的吧~ 但我们用互联网科研学习新模式,做到了。
在大多数人还沉浮在求知海洋时,酸谈学社中已有一些优秀的学员采撷到SCI论文的甜美果实。
7月,《生信数据挖掘套路课》在先锋班率先上线;8月10日,酸菜老师一声招呼,在先锋班内刷了数百条的微信,组织起学员们合作探索生信文章的科研协作。至此,这支小美佩琪(小张,Ewen,慧美,小琪)生信合作小组成立。
随后小组的成员就各展所长、互补短板,以雷厉风行之势在8月31日即斩获初稿。速度之快着实让人瞠目结舌,更让人赞叹的是,这篇文章投出2个月,就在11月10日收到Journal of Cellular Biochemistry(IF:2.959)杂志的接收函,整个过程仅耗时3个月,迅疾如闪电。
那么这支小队究竟是如何做到高效发文章的呢?接下来就让我们走进这支小美佩琪战队,看看这些成员到底有何神通,能在短时间内完成一个看似不可能的任务。
组队篇
刚刚组团,又初涉生信领域,研究课题的推进就显得困难重重。不过,经过成员的磨合交流沟通,素有Meta老司机之称的小张老师,因撰写过十余篇SCI类paper,也担任过多本SCI审稿人,是团队指挥MT的最佳人选,主要负责小组的选题、任务分配、写作指导的工作。
慧美同学虽还只是个励志未来要做生信的女娃娃,但潜力无限,写作能力天赋异禀,便是战队的主力写作dps。
而小琪这枚铁血汉子则是群里生信经验最丰富的,尤其对R语言及生信分析情有独钟,擅长用AOE来处理大量数据,是团队数据大法师。
最后酸谈学社中人称大湿胸的Ewen同学,则化身技术总监,负责小组的思路指导以及协助小琪共同攻克代码与分析上的瓶颈(就是个大奶妈)。
至此,团队阵容才初具规模,接下来就是撩起袖子加油干,期望能积累起足够的数据以支撑起一篇SCI文章。
写作篇
根据既定的组内分工,小琪和ewen同学人手一块肥皂将自己关进了小黑屋,开始了深夜跑代码的闭关修炼,终于花了一周的时间跑好了初步结果,并拟好了文章总体框架与分析思路。
紧接着,小张老师和慧美紧锣密鼓地开始了文章撰写的工作。鉴于这篇文章是慧美同学的SCI论著处女作,小张老师充分发扬了老司机带新人的精神,对其进行逐句指导。
在打通慧美的任督二脉后,故事就顺畅了起来。英文初稿的完成也只花了几天时间就写好了,打磨与润色花了一周的时间,最终由技术总监大师兄Ewen进行全局评估与调整,并形成文章的终稿。
投稿篇
文章完成后,为了节省投稿审稿的时间,大家在投稿前对候选期刊进行了充分评估。
大湿胸与慧美整理了所有1-5分接收生信分析的杂志,并根据IF、审稿周期、是否需版面费等信息进行了杂志的综合排序。最终大浪淘沙,Journal of Cellular Biochemistry(IF:2.959)成为大家心仪的期刊杂志。
9月7号,建队28天我们的第一篇SCI就正式submit到该杂志了。当然,小张老师对于投稿的时间也是很有讲究的,必须要求在黄道吉日的时间段方可投稿。
承蒙上苍厚爱,文章一审后10余天就获得相关反馈,整整20余条来自生信老司机的审稿意见,等待队员们去解释、去分析。
这时候小组合作的形式就发挥了重大的作用,有针对数据集合并方法不合适的质疑,有针对数据及图表的调整,参考文献的重编及表格的重新制作等,大家分工合作,针对审稿意见逐条进行突破,10月2号就将返修稿返回给了杂志了。
经过一个月的等待,终于等到你,邮箱里收到了John P.A. loannidis的邮件,I am pleased to inform you that your revised manuscript is acceptable for publication in Journal of Cellular Biochemistry.
后记
至此,小组第一篇文章就完成了,可是这个模式却给大家带来了大量的思考。
既然网络的力量如此强大,大家怎么能停的下来?解螺旋传授了这么多肿瘤领域的套路与数据库使用方法,光TCGA就能提供足够丰富的素材。
目前我们只有生信上合作,但未来我们也能合作实验。当每个科研人都能取长补短,互联网+科研的力量无可限量。
想跟优秀学员一起玩发SCI的游戏,你首先要贯通科研学习的基本技能,没有任何苦功是浪费的,小伙伴们,学起来!!!
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