沼气池不漏水、也不漏气，就是不产气，或产气量很少。这是缺乏沼气技术知识和管理使用不当所致。主要原因有以下几点：
一、未加接种物或接种物过少。装料时没有加入足够的接种物，池内甲烷细菌少，使沼气发酵不能正常进行。为避免沼气发酵失败，投料时必须按发酵工艺的要求，向沼气池内投入质量较好、数量足够的接种物。
二、池温过低。加入沼气池的料液水温低于12℃以下，抑制了甲烷菌的生命活动。特别是北方地区第一次加料或大换料应安排在十一月中旬以前完成，不能安排在冬季或早春，以免池温低，启动困难，造成长时间不产气。冬季应做好沼气池的保温防冻工作。
三、原料酸碱度失衡。沼气池发酵液浓度过大，初始所产的乙酸甲烷细菌吃不了。或秸秆原料未经堆沤处理，产酸太快等，使挥发酸大量积累，导致料液酸化，使料液PH值低于6.5，影响沼气正常发酵。注意调节发酵液的PH值为6.5～7.5。发酵液酸碱度，除用PH试纸测试外，还可根据沼气燃烧时火苗发黄、发红或者是否有酸味来判断。调节PH值的方法：从进料口加入适量的草木灰、氨水、或石灰水等碱性物质，并从出料间取出粪液倒入进料口，同时搅动料液。用石灰调节PH值时，不能直接加入石灰，只能用石灰水，石灰水的量也不能过多。因为石灰水的浓度过大，它将和池内的二氧化碳结合，而生成碳酸钙沉淀，而二氧化碳含量减少过多，会影响沼气产量。
四、原料混入有毒物质。原料或水中混入农药等有毒物质，如电石、洗衣粉等。或将带有葱蒜、辣椒及韭菜、萝卜等的秸秆和烂叶作为原料投入新建沼气池。或使用吃了蒜苗、蒜叶和韭菜的猪粪，都会影响产气。对此，应更换料液重新启动或停止使用不合理原料。
五、发酵原料不当。以牛粪作发酵原料的沼气池，由于牛以草食为主，粪中含氮量偏少，碳氮比失调，封池后迟迟不产气，应适当加入碳铵或尿素，补充氮源。某些地区以薯渣为沼气发酵原料，红薯渣是一种酸性很强的发酵原料，薯渣过多，会使发酵液变酸，不仅产气少，而且只产气，点不着火，需更换料液或用石灰水调节PH值。若沼气池内全部进人畜粪便，由于人畜粪被沼气细菌分解，产气早而快。新鲜人畜粪入池后大约有30～40天的产气高峰期。如进一次料以后不再补充新料，产气就会逐渐减少。为避免上述问题产生，只有建“三结合”或“四结合”模式，做到畜禽舍、厕所、沼气池连通，保证每天有新鲜原料入池，达到均衡产气，持续供给日光温室用肥。
使用鸡粪、人粪为原料而又采用半连续或批量发酵工艺的沼气池，常常出现初期就产气不正常，或初期产气好、以后逐渐失效的现象。前者是启动不能正常，后者则是虽然启动正常，但由于鸡粪和人粪在厌气消化过程中产生一些有毒物质，如不能及时排走，它们会逐渐积累，使沼气微生物逐渐中毒，引起整个发酵逐渐失败。遇到这种情况，一是采用补加接种物的办法，使发酵恢复正常。二是改半连续发酵为连续发酵，并采用适宜的进料浓度及发酵温度。
六、发酵时出现浮渣与结壳，影响沼气的产生和逸出。作物秸秆等纤维素原料，表皮有一层蜡质，如不处理很难腐烂，下到池内易浮在表面，不易同其它原料混合均匀，使用时应预先进行粉碎和堆沤处理。牛粪、马粪入池前，应加水捣碎，以免入池后浮在发酵表面形成结壳。粪便入池前尽量混合均匀，利用旋流布料自动破壳装置自动破壳，或用出料活塞强制循环池内料液，均可达到破壳目的。
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