三焦是孤腑，语出《灵枢·本输》：“三焦者，中渎之腑也，水道出焉，属膀胱，是孤之腑也。”言孤腑者，谓无藏可合者，因而就没有通常意义的表里关系。然《难经·二十五难》却以心主与三焦相表里，俱有名而无形。后之经络学说亦以手厥阴心包经与手少阳三焦经相为表里。此或受足厥阴肝和足少阳胆相表里的影响，自然地以为手厥阴心包和手少阳三焦亦当是相表里。且不论心包络本就有形，存在实际解剖意义之实体，况心主之脉实主心，其表里关系是小肠，而手少阴独主脉，《内经》论其理甚明，难经此论当是有误，导后人于歧途也。

另有论命门与三焦相表里，此源当在《灵枢·本脏》：“肾应骨，密理厚皮者三焦膀胱厚，粗理薄皮者三焦膀胱薄。踈腠理者三焦膀胱缓，皮急而无毫毛者三焦膀胱急。毫毛美而粗者三焦膀胱直，稀毫毛者三焦膀胱结也。”以肾分左右，一为命门，故以肾合膀胱而命门合三焦也。此绝非《内经》本旨也。盖三焦连属膀胱，犹心包连属于心。此论肾而言三焦膀胱者，犹论心而言心主少阴也。心主为心之用，三焦为膀胱之用罢了。孙一奎便是据此辩三焦乃无形也。心包连属于心而不言心包与小肠相表里，故三焦连属于膀胱自不能言三焦与命门相表里者。然治肾可调理三焦，一如治心先就心包。

《难经》以三焦为外腑，马莳云：“惟其外有经而内无形，所以不为内府，而为外府。”细品倒象说了一句很正确的废话。盖言外腑，当取“五藏所合之外”的意思。或云外腑即孤腑。所指一也，用孤腑涵义或者更为准确。《灵枢·五癃津液别论》云：“三焦出气，以温分肉。”《素问·灵兰秘典论》云：“三焦者，决渎之官，水道出也。”可明三焦乃水气之通道也。故《本输》有云：“少阳属肾，肾上连肺，故将两藏。”有本或以“少阳”当是“少阴”之误，一字之改，真意泯然。此言少阳是正确的，当指手少阳三焦，却非言脉而言此孤腑者。思三焦乃五藏五腑外所虚者，故上焦如雾，中焦如沤，下焦如渎，营卫皆出其间也。而“将”者，助也。三焦可助肾肺两藏与外界的代谢交换也。言其孤者，以其孤于五藏之合，更是独以其虚。故言外腑者，意有所狭也。