咸蛋兄妹在辅导企业挂牌股改过程中，遇到过企业出现净资产值低于注册资本的情况，根据《公司法》第九十五条规定，有限责任公司变更为股份有限公司时，折合的实收股本总额不得高于公司净资产额。因此，公司在变更股份公司之前应调整公司经审计后的净资产不能存在低于公司的实收资本的情形。也就是说虽然申请挂牌新三板的公司没有严格的财务标准，即使处于亏损状态的公司也可以挂牌新三板，但是公司不能亏损到经审计后的净资产低于实收资本的情况。
实务中，由于各种原因，可能会出现公司以选定的股改基准日进行整体变更股份有限公司时，经审计的公司原账面净资产小于注册资本的情形。然而，公司股改整体变更折股的过程是公司净资产按照一定比例折合成股份有限公司的股本，剩余部分计入资本公积的过程，需要公司原账面净资产大于或者等于注册资本。在公司净资产小于注册资本的情形下，则无法进行折股，从而影响公司股改。
举例子：公司注册资本3000万元，经审计公司净资产只有1500万元，企业经审计后的净资产低于实收资本，可以采取以下几种方式进行调整。
公司净资产小于注册资本的原因
作为有限公司阶段，公司资产负债表的所有者权益包括如下会计科目：实收资本、资本公积、盈余公积、未分配利润。导致公司净资产小于注册资本的关键性因素在于实收资本和未分配利润两项。
主要原因有三：（1）公司实收资本过低，即公司注册资本未缴纳或未全部缴纳；（2）公司未分配利润为负，即公司一定程度的亏损；（3）公司实收资本过低且未分配利润为负。
针对不同的导致公司净资产小于注册资本的原因，为实现公司未来顺利股改有着不同的处理方式。
第一种方案：减资：减资完成后再进行股改；减资同时进行股改
根据现行法律等规定，如果没有新的资金弥补亏损应当减资。因为，根据《公司法》81条规定，股份有限公司注册资本应当等于认购股本总额（发起设立）或实收股本总额，根据96条实收股本总额不能高于净资产额，而现在公司净资产额却低于原注册资本额，最终变更设立的股份有限公司注册资本额必然会低于原公司注册资本额，如果没有新的资金注入，将构成减资行为，应当按照公司法178条进行减资。
实践中，公司股改时一般都是以公司净资产进行折股。需要注意的是公司股改时，股东出资已经全部缴纳，即注册资本和实收资本是一致的。因此，公司经审计师审计后的净资产不能低于公司的实收资本，换一种说法就是公司可以亏损，但是不能亏损到审计后的净资产低于实收资本（注册资本），如果审计后的净资产低于实收资本，那就进行减资，将实收资本减少到低于公司的净资产，当然此种情况减少的注册资本实际是亏损的部分。该种操作，可以解决公司股改的问题，但是带来了另外一个问题，公司是否具有持续经营的能力，持续盈利能力如何？如果企业是因为过去亏损造成的，但是报告期持续盈利，能够解释清楚的，此问题不会对公司挂牌新三板造成实质性障碍。
对于审计净资产低于注册资本，改制折股时是否要履行减资手续的问题，对于IPO业务多有发生，但是对于新三板挂牌业务发生的比较少见。
这种情况，一般实务操作都是引进新股东弥补历史亏损或者原股东出资补齐差额，然后进行审计评估折股，整体变更或发起成立股份公司。
针对IPO证监会的审核情形，如果直接采用净资产折股低于原有注册资本，虽没有明文规定这种情况不能上报，但却会得到特别关注。因为这种情况出现的本质是历史上存在大量亏损或营业外损失，虽最近三年满足首发条件，但仍不能弥补亏损，在审核上对公司的经营和管理的历史问题会高度关注，质疑公司的盈利能力和主营业务能力的持续稳定性。
整体变更是我国在企业首发上市时为了连续计算业绩而独创的东西，它具有独立性，任何想与之一起进行的操作都有很大的风险，也不可取。在实际业务中，有企业出于各种考虑想增资和整体变更一起做，虽然从理论而言应当可行，如果没有新的资金弥补亏损应当减资。因为根据公司法81条规定，股份有限公司注册资本应当等于认购股本总额（发起设立）或实收股本总额，根据96条实收股本总额不能高于净资产额，而现在公司净资产额却低于原注册资本额，最终变更设立的股份有限公司注册资本额必然会低于原公司注册资本额，如果没有新的资金注入，将构成减资行为，应当按照公司法178条进行减资：公司需要减少注册资本时，必须编制资产负债表及财产清单。
公司减少注册资本有以下几个程序：（1）编制资产负债表和财产清单；（2）股东会（股东大会）做出减资决议；（3）向债权人通知和公告；（4）减资登记。
第二种方案：溢价增资
通过增加公司注册资本补齐与净资产之间的差额是在实务操作中最经常使用的方式，也就是溢价增资，根据增资的主体不同，又可以划分为如下几种方式：
1、以货币或其他出资方式对公司进行增资。
1）原股东通过货币出资溢价增资，部分出资转为公司资本公积金，公司整体变更时，以公司资本公积金转增公司注册资本，以此种方式避免公司净资产不足注册资本的情况。
2）引进战略投资者、财务投资者对公司进行溢价增资。
3）设立员工持股平台对公司进行溢价增资。
2、原股东对公司的债权转为股权。
所谓债权转股权是指公司债权人将其对公司享有的合法债权转为出资（认购股份），公司会计处理表现为其他应付款转为公司资本公积金，增加被投资公司注册资本的行为，但是债转股不适用于公司设立。
在实务操作中债转股要严格的按照法律规定的流程。下面将详细介绍债转股所要履行的的程序：
1）用于出资的债权应当符合以下条件：债权合法有效；债权权属清晰、权能完整；债权依法可以评估和转让；债权是被投资公司经营中产生的货币给付、实物给付的合同之债；被投资公司为有限责任公司的，债权出资应当经全体股东一致通过；被投资公司为股份有限公司的，债权出资应当经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。
2）签订《债权转股权协议》
《最高人民法院关于审理与企业改制相关的民事纠纷案件若干问题的规定》(法释〔2003〕1号)第十四条：债权人与债务人自愿达成债权转股权协议，且不违反法律和行政法规强制性规定的，人民法院在审理相关的民事纠纷案件中，应当确认债权转股权协议有效。
《债权转股权协议》应当载明下列事项：债权人和被投资公司的名称、住所；债的形成依据、时间；债权总金额及各债权人所享有的份额；拟转为出资的债权数额、评估作价方式；协议生效时间；争议解决及违约责任。通过《股东会决议》修改《公司章程》等法律文件。
3）专项审计与资产评估
用作出资的债权应当经会计师事务所专项审计。以考查作为投资的债权是否真实合法、是否没有其他权利负担以及是否可以作为公司出资进行转让。
在公司所有股东能达成该笔债权折股比例协议的情况下，公司可以不进行全面资产评估，只需对债权进行专项评估，否则公司将对公司现有资产价值进行评估，以确认新增的持股比例账面价值与其公允价值之间的差异。
4）验资
5）工商局变更登记
第三种方式：调整改制基准日
无论是增资还是减资，因其程序的复杂性都可能会导致公司改制基准日的延后，所以公司可以主动调整股改基准日（审计基准日），以时间换空间，即公司未来几个月预期能持续盈利的前提下，推迟股改基准日，待公司净资产审计值（预估）大于或等于注册资本后进行股改。
另：企业如果出现未分配利润为负时的处理方式
需要明确的是，此情形是指公司注册资本已经全部实缴，但由于未分配利润为负，最终导致公司净资产小于注册资本的情形。公司注册资本未实缴或未全部实缴，且未分配利润为负的情形下文将单独予以讨论。
此种情形下的处理方式，主要有两种：
1、无偿向公司赠与资产
既可以是公司股东无偿向公司赠与资产，也可以是股东以外的主体无偿向公司赠与资产。若是股东赠与，将计入公司资本公积；若是股东以外主体赠与，将计入公司营业外收入从而增加公司利润。两种赠与均可以实现公司净资产的增加。该种处理方式操作较为简便，时间上也较短，但赠与时需综合考虑赠与的具体数额，以确保赠与完成后公司净资产大于或等于注册资本。
2、改善公司经营状况，扭亏为盈
通过改善公司经营状况，扭亏为盈，也可以增加公司净资产，从而最终实现公司净资产大于或等于注册资本，为公司未来顺利股改奠定基础。该种方式难度较高，且时间较长。
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