已命名的帝国海军舰队列表：
卡迪亚舰队（Battlefleet Cadia）
阿格里皮纳舰队（Battlefleet Agripinaa）
卡利西斯舰队（Battlefleet Calixis）
科罗纳舰队（Battlefleet Corona）
斯卡鲁斯舰队（Battlefleet Scarus）
哥特舰队（Battlefleet Gothic）
阿米吉多顿舰队（Battlefleet Armageddon）
巴卡舰队（Battlefleet Bakka）
卡拉顿舰队（Battlefleet Charadon）
太阳舰队（Battlefleet Solar）
科洛诺斯舰队（Battlefleet Koronus）
卡迪亚是一个位于被称为恐惧之眼的星云边缘的陆地堡垒世界。这颗行星位于一个被称为卡迪安之门的太空区域，这是唯一一个稳定的、永久的进出恐惧之眼的通道，大到足以允许整支舰队通过。由于这个原因，卡迪亚被加强防御以抵抗混沌的攻击，且经常成为掠夺者阿巴顿黑色远征的目标。
卡迪亚舰队是一支庞大的帝国海军舰队，负责保护朦胧星域内至关重要和具有战略意义的卡迪亚星区。卡迪亚堡垒世界位于该星区的中心，它的人民是卡迪安之门坚定不移的哨兵。从139.M41到160.M41，卡迪亚在第12次黑色远征(也被称为哥特战争)期间援助了哥特舰队。999.M41，卡迪亚舰队在第13次黑色远征中遭受了严重损失。卡迪亚的部分地区目前被混沌势力占领，在这场不确定结果的史诗大战之后。现在黑暗之神的仆人们终于在帝国领土上建立了一个立脚点，卡迪亚目前被帝国海军的几支舰队包围着，包括自己的舰队，自荷鲁斯大叛乱结束以来，保持这种太空军事优势就是为了阻止混沌势力首次大规模入侵帝国疆域。
著名舰船
维吉兰蒂永恒号(Vigilanti Eternas)——复仇者级巨型巡洋舰
歌莉娅号（Goliath）——月级巡洋舰
阿格里皮纳是帝国疆域的一个星区。它位于靠近恐惧之眼的朦胧星域，是距离卡迪亚要塞世界和卡迪安之门最近的星区之一，也是卡迪亚物资（尤其是武器和弹药）的主要生产地，帝国海军的造船厂也位于阿格里皮纳的锻造世界，成为卡迪亚之门整体防御体系的关键。与其他星区相比，它是一个富裕且繁荣的地区，并为帝国卫队提供了许多团。
由于靠近恐惧之眼，必须对混沌势力和掠夺者阿巴顿领导的黑色远征保持高度警惕。该舰队在139-160.M41哥特战争期间支援并增强了哥特舰队，成功抵御了混沌势力的入侵。但在999.M41第十三次黑色远征期间被混沌部队重创，损失惨重。阿格里皮纳被混沌袭掠，大部分工业设施被摧毁。
著名舰船
勇武骑士号（Warrior Knight ）——驱魔者级巨型巡洋舰（Exorcist-class Grand Cruiser）
卡利西斯星区位于朦胧星域，靠近光环星（Halo Stars）和恐惧之眼。一千年前被好战者安杰文（Angevin）领主征服，卡利西斯星区包含了许多人口稠密且重要的世界，尽管它距离帝国的心脏地带很远。卡利西斯舰队于384.M39正式组建成立，在M39到M41之间，卡利西斯舰队与范围广泛的敌人交战，例如兽人和兽人海盗、黑暗灵族袭击者、灵族海盗、海盗以及分离主义者和反叛的世界。
著名舰船
顽石之拳（Fist of Adamant）——报应级战列舰同时是舰队旗舰
圣德鲁苏斯的胜利（Triumph of Saint Drusus）——圣杯级战列巡洋舰
贝利斯·科罗纳是一个死亡世界，位于恐惧之眼附近，作为朦胧星域海军基地。贝利斯·科罗纳拥有大量的轨道船坞，可以为整个舰队提供服务。弹药储存在世界地表以下几公里的装甲掩体中。
科罗纳舰队驻扎在贝利斯·科罗纳的轨道码头上。科罗纳舰队，以及阿格里皮纳、卡迪亚和斯卡鲁斯舰队，因其在防御恐惧之眼方面的作用而被统称为堡垒舰队。因此，科罗纳舰队是整个帝国中装备最好和规模最大的舰队之一。
在第十三次黑色远征时，科罗纳舰队由以下舰艇组成：
7艘战列舰
13支巡洋舰中队
17支护卫舰中队
如今的斯卡鲁斯星区是在30世纪末大远征的中期发现的，由原体洛嘉以怀言者军团第52连的斯卡鲁斯连长命名。
斯卡鲁斯舰队与阿格里皮纳、卡迪亚和科罗纳的舰队一起，因其在防御恐惧之眼方面的作用而被统称为堡垒舰队。因此，斯卡鲁斯舰队是整个帝国中装备最好、规模最大的舰队之一。
从240.M41到338.M41期间，斯卡鲁斯舰队参加了欧菲迪安远征（Ophidian Crusade）。
在第十三次黑色远征时，斯卡鲁斯舰队由以下舰艇组成：
5艘战列舰
9支巡洋舰中队
13支护卫舰中队
哥特星区在泰拉北部的朦胧星域，位于朦胧星域与广阔的远东星域的边界处。
哥特舰队负责监督整个哥特星区的帝国舰队活动的安全，始终不得不应对无数的威胁，例如欧克海盗、灵族海盗和人类海盗。然而，由于它靠近恐惧之眼，最大威胁始终来自混沌势力，尤其是掠夺者阿巴顿的黑色远征。来自混沌的威胁在M41早期达到顶峰，因为哥特星区成为了掠夺者最新的黑色远征的前线: 哥特战争。在战争的早期阶段，哥特舰队在一次偷袭中遭受了可怕的损失，并且在对抗接下来入侵的混沌舰队时几乎筋疲力尽，混沌舰队设法抢夺了大部分黑石要塞，并用一艘众所周知的巨舰——行星杀手摧毁了整个主教世界萨瓦文（Savaven）。
然而最终的胜利还是属于人类帝国，在海军上将瑞文斯博格的指挥下哥特舰队在客西马尼战役（Battle of Gethsemane）中成功扭转了局面力挽狂澜并发动了对海盗天堂（Pirates' Haven）的进攻，消除了海盗的威胁后，帝国军队就能够更加专注于混沌敌人而不必担心舰船被强盗袭击。战争胜利后哥特舰队用了几年的时间重建了战力，整个哥特舰队随后在第十三次黑色远征期间返回援助卡迪安之门周围的星区。
著名舰船
神圣权利号（Divine Right）——皇帝级战列舰
血鹰号（Bloodhawk）——报应级战列舰
红衣主教博拉斯号（Cardinal Boras）——报应级战列舰
莱克斯侯爵号（Marquis Lex）——火星级战列巡洋舰
阿米吉多顿星区位于银河系中距泰拉东北部1万光年的朦胧星域，是人类帝国有史以来最大规模战争的发生地。战略意义重大的阿米吉多顿巢都世界是由十个行星组成的恒星系统中的第四颗行星，并且是阿米吉多顿次星区和周边更大区域内的工业中心，在它周围几光年半径内的许多世界都依赖它的大型工业产出。
阿米吉多顿舰队在阿米吉多顿巢都世界的各种战争中发挥了重要作用。
在998.M41第三次阿米吉多顿战争中，指挥阿米吉多顿舰队的海军上将帕洛尔发现他正面对超过六倍于己的战争头目盖兹骨·马格·乌鲁克·萨拉卡（碎骨者）率领的欧克舰队。
然而，帕洛尔知道，即使有海伯莱希特大元帅（黑色圣堂战团长）指挥的阿斯塔特舰队支援，他也不可能在正面战斗中击败如此庞大的舰队。
取而代之的是，联合舰队试图拖延兽人，以便让在阿米吉多顿上的帝国防御部队有尽可能多的时间进行准备，之后他们便从阿米吉多顿星系中撤退。在接下来的战争中，舰队带领着游击部队抵抗绿皮。尽管如此，面对如此劣势，阿米吉多顿舰队最终不堪重负、损失惨重，帝国仅在战斗开始的前几天就有超过100万人伤亡。虽然付出了惨痛的代价，精通战略与谋划的帕洛尔仍然成功建立起了严密的封锁线，帮助扭转了战局。结合光荣时代战斗群（the Glorious Age battlegroup）行动和巧妙的“偷袭战术”，大大减少了欧克援军的数量。在追击欧克残军时，帕洛尔发现了可能搭载着兽基米德（Orkimedes）本人的船只，追击中双双进入了亚空间。到目前为止，这两艘船都没有发现任何踪迹；据信，帕洛尔上将仍在追捕兽基米德。
著名舰船
前大教堂号（Ex Cathedra）——阿米吉多顿级战列巡洋舰
光明之锤号（Hammer of Light）——阿米吉多顿级战列巡洋舰
雷童号（Thunderchild）——阿米吉多顿级战列巡洋舰
巴卡是一个帝国采矿世界，因其轨道上的造船厂而闻名于星系。从第30个千年的大远征早期以来，这些造船厂一直被用于为帝国海军建造新的星舰。
巴卡舰队是一支以巴卡为基地的帝国海军战斗舰队，巴卡是风暴星域的星域堡垒，为该地区的所有帝国海军部队提供配合，并作为所有帝国战斗舰队的补给点和维修站。它是距离马库拉格最近的也是最大的海军基地，因此，在745.M41第一次泰伦战争中的马库拉格之战期间在保卫奥特拉玛时发挥了关键作用。
在最危急的时刻，海军元帅扎卡留斯·拉斯驾驶着他的皇帝级战列舰星界统治者号进入虫巢舰队的中心并引爆了亚空间驱动器，将整个泰伦舰队连同自己一起拖入亚空间。
著名舰船
星界统治者号（Dominus Astra）——皇帝级战列舰
恶魔猎手号(Daemon Slayer)——未知型号巡洋舰
由于其丰富的富含矿物的行星、气体巨星、农业世界和含矿小行星带，卡拉顿星区长期以来一直是远东星域的粮仓和军械库。单单梅塔利卡（Metalica）一个铸造世界就能生产足够的枪支、飞机和弹药来装备几十次远征。有这样的工业产能，它经常被称为“钢铁星区”就不足为奇了。
数千年来，该星域一直是冲突的温床，因为它的世界经常受到兽人、灵族海盗和混沌教派的困扰。在永恒之夜事件（M42早期）之后，卡拉顿星区和附近的铸造世界梅塔利卡遭到了泰弗斯（Typhus）手下死亡守卫部队的无情攻击，战斗在克罗米德星系（现在的克罗米德克前线）中尤为持久
舰队的基地位于梅塔利卡的索拉里锚区，在卡拉顿战役（ Charadon Campaign）期间由赫拉杜斯·利华·谢拉丹中尉指挥（Lieutenant-Heraldus Lihua Sheradane）。当死亡守卫直接袭击梅塔利卡时，大部分舰船被摧毁或被迫逃离。
著名舰船
刀锋慈悲号（Mercy of the Blade）——皇帝级战列舰
因保卫人类帝国的首都和人类的发源地泰拉，太阳舰队毋庸置疑是帝国最强大的舰队。
太阳舰队是一支由帝国海军战舰组成的庞大舰队，负责拱卫神圣泰拉和至关重要的太阳星域。星域内的帝国海军轨道造船厂位于月球上，帝国海军总部设在火星的钢铁之环内。航天器和其他大型专业结构是在这些围绕着红色星球赤道带旋转的轨道工厂中制造的。太阳舰队的战舰就驻扎在这些巨大的浮船坞中，来自帝国各地的其他航天器经常造访整个银河系中最大的人造天体。
科洛诺斯舰队的正式名称为航道守望27（Passage Watch 27-Est），身为在科洛诺斯航道巡逻的小型舰队，为卡利西斯星区抵御潜藏在光环星深处的恐怖提供了堡垒。舰队本身包括12艘巡洋舰和几艘战斗巡洋舰，由一些轻型巡洋舰和几个中队的护卫舰和驱逐舰护航。由于其职责的性质和它必须覆盖的广阔空间，战斗舰队还包含几艘航母。
科洛诺斯舰队主要与居住在光环星内的兽人作战，但也与当地海盗、游荡的混沌战帮、灵族海盗、黑暗灵族和其他神秘的异形文明作战。
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