水草在购入植入缸中前，大多数属于陆上水耕型的栽植，因此在购买后，需要作前置处理，才可入缸，而其中最重要的就是消毒工作，以消灭附着水草之枝叶或根部的病原菌、寄生虫、水蛭、蜗牛、白线虫等为目的。尤其以蜗牛为最。消毒缸的水温可提高至28℃（待消毒工作完毕，再慢慢调整至22～24℃），以加速藻类孢仔的孵化，缩短消毒日数日。
消毒方法：
A、硫酸铜消毒液
浸10分钟后在流动的清水（随时注入新水）中清洗一小时，每日一次，连续三天。硫酸铜30g冲泡10公升水，即为硫酸铜消毒液。使用后可装瓶密封，保存续用。
消毒工作时，请戴手套以免毒液进入毛细孔，造成中毒。万一不小心有感觉头晕、呕吐现象时，即刻至空气新鲜场所，并及时就医，轻微感觉或慎重起见时可饮”绿豆汤”解毒。
B、过氧化氢（工业用双氧水）
将双氧水以喷雾器喷雾全株（含根部），喷透至发泡滴水为止，然后再以清水喷雾清洗药水，再浸入流水中十分钟。
C、稀浓度漂白水
浸泡五秒钟后以清水冲洗漂白水，再浸入流水中漂浮片刻。如此反复三次。（本法限有茎水草适用）
D、高锰酸钾
高锰酸钾10g冲泡10公升水，将水草浸入该消毒液中10分钟后取出，并以清水清洗。
E、甲基蓝
甲基蓝5g冲泡10公升水后，水草浸入10钟后取出，彻底的在流动（继续将新水注入）水中漂洗一小时，否则叶片较薄的水草叶片，则会染上浅蓝色的小点。
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