蛋氨酸在正确使用的情况下很少引起不良反应。蛋氨酸保健品的最常见副作用包括恶心，呕吐和嗜睡等。此外还有可能出现肝脏疾病，酸中毒，动脉粥样硬化，遗传性疾病甲基四氢叶酸还原酶缺乏症等更严重症状。
为了更好的避免蛋氨酸最危险的副作用，学习了解正确的使用方法很重要。尽管这种氨基酸可以在芝麻种子，鱼和谷物等食品中发现，但它的保健滋补品形式更有效。实际上，这种营养品的严重副作用基本上都与过量摄入有关。
大剂量摄入蛋氨酸可以导致身体永久性损伤，甚至有致命风险。此外，过量摄入这种保健品还有可能诱发思维混乱，情绪激动和谵妄等精神分裂症症状。它还可以造成脑损伤和刺激肿瘤生长。摄入太多这种营养品还可以增加血液中的高半胱氨酸水平（与心脏病存在联系）。
过敏反应是另一个蛋氨酸的严重副作用，症状包括脖子上部肿胀，胸闷，皮疹，荨麻疹和呼吸困难等。如果在服用这种保健品后出现这类症状，应该马上送急诊治疗。
患某些疾病的人服用蛋氨酸有可能带来危险，因此应该首先咨询医生。通常不建议孕妇或哺乳母亲服用这种药物，此外，肝脏存在问题或胃酸过多的人也不建议使用这种营养品。
一般情况下，蛋氨酸通过中和尿液的氨成分增加酸性。这种药物经常用于治疗摄入太多醋氨酚的人，在中毒10小时内注射可以防止死亡。
蛋氨酸保健品也用于动物饲料，除了流行的家禽饲料以外，还是一些宠物食品的添加剂。此外，这种氨基酸还经常用于降低狗尿pH酸碱度，避免给草坪带来损害。
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